Colwellia sp. Arc7-D: DBO93_04665
Help
Entry
DBO93_04665 CDS
T05422
Name
(GenBank) peptidylprolyl isomerase
KO
K03770
peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D [EC:
5.2.1.8
]
Organism
cola
Colwellia sp. Arc7-D
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cola00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03110 Chaperones and folding catalysts [BR:
cola03110
]
DBO93_04665
Enzymes [BR:
cola01000
]
5. Isomerases
5.2 cis-trans-Isomerases
5.2.1 cis-trans Isomerases (only sub-subclass identified to date)
5.2.1.8 peptidylprolyl isomerase
DBO93_04665
Chaperones and folding catalysts [BR:
cola03110
]
Protein folding catalysts
Peptidyl prolyl isomerase
Cyclophilin
DBO93_04665
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SurA_N_3
SurA_N_2
Rotamase_3
Rotamase
Rotamase_2
SurA_N
Metallopep
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWB56919
LinkDB
All DBs
Position
1071595..1073502
Genome browser
AA seq
635 aa
AA seq
DB search
MLENIRESSQGLTAKIILGFIILTFAVAGIGSYSNSVDSSVADVNGEKITQDEFNKAYQE
QRNRMAQQFGEMFETLSSDPGYMSNFRKGVVDNLINQKLIDQNSEMLAIRVADQRIKSTI
RNMPEFQVDGVFDNNRYLAMINQAGFYQSSDFRDYLRTEMTRRQLTQALVASEFSLPYQE
SMFSALQNQERDIRFATINAEQFKATIELSDEEVNDYYLENQSRFENQEQVKVNYITLDV
NTIASKVVLTDADVKAYYQSNISQYRDEEKRRVAHILIEFGDDEAKAKADTEALLAKINA
GEDFATLAKENSADTFSGENGGDLDWIDAGVMDAAFDEAAFALTGVGSVSEVVKTDFGFH
IIKLTDYKAENVQTLSEVREDIVKKAKSEKAQDKFFELQQEVARLSFEFPDSLDDAAGAI
NATVKTSGWLTRGANVAPFNESAAVDAAFSDIVVNEQLNSDVIEVSDTLAIVMRLNEYQD
ASIKPLADVSAQIKSILVAKKASEKAQTVADELLAAFKSGTDITEQLSAIGATMETKTAV
TRVGSGLDASLAREAFKLPKPNDGAVSATTVNLSNGNLALLEVQSVKVGEAKDSPNLSQQ
LTQQLAQASYLSYVESLKVGAEIVRKEVQAPTTQY
NT seq
1908 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttagaaaatattcgagaaagctctcaaggattaaccgctaagattattcttggtttt
attattttaaccttcgctgttgccggcattggtagctacagtaattcagttgattcgtca
gttgctgacgtcaatggtgaaaaaattacacaagatgagtttaataaagcttatcaagaa
caacgtaatcgtatggcgcaacagtttggtgaaatgtttgaaacgttatcatctgatcct
ggctacatgagtaactttcgtaagggcgttgttgataacttaattaaccaaaaacttatt
gaccaaaactcagaaatgcttgccattcgagttgctgaccaacgaattaaaagtactatt
cgcaatatgccagaatttcaagtggacggtgtttttgataacaaccgctacttagcgatg
attaaccaagctggtttttaccaatcgtctgattttcgcgattacttacgtactgaaatg
acacgtcgtcaattaactcaggcattggttgcaagcgaatttagcttaccttaccaagaa
agtatgttttcagctttacagaatcaagaacgtgatattcgttttgctaccattaatgct
gagcaatttaaagctactatcgaactaagcgatgaagaggtaaatgattattaccttgaa
aaccagtcacgtttcgagaaccaagaacaagtaaaagtaaattatattacgcttgatgtt
aataccattgccagcaaggtagtgttaacagacgcagatgttaaagcttattatcaaagt
aatatcagccaatatcgcgatgaagaaaaacgtcgtgttgctcatattctaattgaattt
ggtgatgatgaagctaaagctaaagccgatacagaagcgttacttgcaaaaataaatgcc
ggtgaagactttgctactttagcgaaagaaaattcagctgatactttcagtggtgaaaat
ggcggcgacttagattggattgacgctggtgtaatggatgctgcttttgatgaagccgct
tttgcattaacaggtgttggtagtgtaagtgaagtggttaaaacagattttgggttccac
atcattaaacttactgactacaaagctgaaaacgttcaaacgttatctgaagtgcgtgaa
gatatagtcaaaaaagctaaaagcgaaaaagcgcaagataaattctttgagcttcaacaa
gaagttgcgcgtttaagtttcgagttcccagatagcttagacgatgctgctggtgcaatt
aatgcgacagttaaaacctctggttggttaacacgcggtgccaatgtagcaccttttaat
gaaagtgctgctgtagatgctgccttttcagatattgtagttaatgagcagttaaactca
gatgttattgaagtaagtgatactttagcaatcgttatgcgtttgaatgaatatcaagat
gcgagtattaaaccgcttgctgatgtaagtgcgcaaattaaaagtattttggttgctaaa
aaagcatctgaaaaagcacaaacagttgctgatgagttactcgctgcatttaagtcaggt
actgatattaccgaacaattaagtgctattggcgcaactatggaaactaaaacagctgtt
acacgtgttggaagtggcttagatgctagtttagctcgtgaagcgtttaaattacctaag
cctaatgatggtgcggtatcagcaacaacagttaatttaagtaacggtaatctggcgcta
cttgaagtgcaatctgtcaaggtaggcgaagcgaaagactctccaaacttgtcacagcag
ctaactcagcaattagcacaagcgtcttatttaagttatgtagaatcacttaaagtcggt
gcagagattgtacgtaaagaagtacaggcgccaactacgcaatactag
DBGET
integrated database retrieval system