KEGG   Colwellia sp. Arc7-D: DBO93_04795
Entry
DBO93_04795       CDS       T05422                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
cola  Colwellia sp. Arc7-D
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cola00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:cola02000]
    DBO93_04795
Transporters [BR:cola02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   DBO93_04795
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug DUF5719 FbpC-like_RD
Other DBs
NCBI-ProteinID: AWB59463
LinkDB
Position
1098479..1101283
AA seq 934 aa
MAFAEEAAAEEKGVERIQVTGSRIRRSELTAVTPIIEISAQEFAISGNLNIEQKLAELPS
TLPSFGPSSNNPGDGTATVDLRGLGTSRTLVMVNGRRWVPANQSGVVDLNTIPASLIENV
EIITGGASAVYGSDAIGGVVNFKMKDDFEGVEISTLYDVTTEGDAEKFNLDLTMGGNFAD
DRGNAVLYVGYSKREPLFQGDRDFASVALTEGDGELIAGGSSGIPGTRVFGGPTLNTGAN
AGSSLGRFLPDGTGAAFTGADRFNYAPDNFLQLPQERLTMNAFSHFYINDETRIYSELSF
IRNEVPQELAPTPAFTTITVNPNSAFFGADVQNAILTAQITNNNGTPDDESDDFLESALN
ADGTYDMFVGRRMVENGSRQSIDTRDAMRILVGIDGYINDDWSYDVYYSRSQLDHTTLLN
NDVAASRFKQAILVNDDATACQDTSGGCVPLNIFGEGNISDEAVDFVNIGATNATTLKQE
VFMATVSGALPFTFPGAEESVGVVFGYEKRQDESTYRPDEFLAAGDVLGFNAGEATVGSY
SSDEIFTEFSIPLMSGKEFAEDLSLWGAARFADYSNIGRVSSFATAINWAPTDWISTRVG
FQSSVRAPNVSELFLGASAGFPGAVDPCAVDGYKAGITSDALCLADGVSAAQIGVFEQAN
GQIEGSFGGNSDLQEETSDTLTVGIVVQPFEGLDFTIDYFKIEIEDAISVYGVNNTLDVC
YNVVKDASHETCQNISRRADGNVDVVKSLNANIASIETSGVDFNVTYNTELDFGLFDSGS
DLNIQFRSTFLDTSDVVPVVGLDTINECAGSYGNTCGNPQPEFQANTRVNWTNGDLTLSA
LVRYIGSTDDDQLIGDDPITRSDLVVSEIDAAIYVDLSASYLVNENLNVNFGVKNVFDEE
PTALGESQSQANTFPETYDVIGPRVFLSASYTFN
NT seq 2805 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcatttgctgaagaagcagctgcagaagagaaaggtgttgaacgtatccaggtaact
ggttcacgtattcgtcgttctgaattaactgctgtaacacctattatcgaaattagcgct
caagaattcgctatttcaggtaaccttaacatcgagcaaaaacttgctgagttaccttct
actttaccttcgtttggtcctagctcaaacaaccctggtgacggtacagcaacagtagat
ttacgtggcttaggtacttctcgtactttagttatggttaacggtcgtcgttgggttcct
gctaaccaatcaggcgttgttgatttaaacacgattccagcttctctaattgaaaacgtt
gaaatcatcactggtggtgcttctgctgtatacggttcagatgcaatcggtggtgttgtt
aactttaaaatgaaagatgattttgaaggtgttgaaatttcaacgttatatgatgtaacg
actgaaggcgatgctgaaaaattcaacttagatttaaccatgggtggcaactttgctgat
gaccgtggtaacgcagtactttacgttggttactcaaaacgtgaacctttattccaaggc
gaccgtgactttgcaagtgttgctttaactgaaggcgatggcgaattaattgctggtggt
tcttctggtattccaggtactcgtgtatttggtggtccaacgcttaacactggtgcaaat
gctggttcaagcttaggtcgtttccttccagatggtactggtgctgcatttacaggcgct
gatcgttttaactatgcacctgataactttttacagttacctcaagaacgtctaacaatg
aacgcattctctcatttttacattaatgacgagactcgtatctacagtgaactttctttt
attcgtaacgaagttccacaagaattagcaccaactccagcgtttacaacaattacagta
aaccctaacagtgcattttttggtgctgatgttcaaaatgcaatcttaactgcacaaata
acaaataataatggaactcctgatgatgagtcagatgattttcttgaatcagcattaaat
gctgatggcacttatgatatgtttgttggtcgtcgtatggtagaaaacggttcacgccaa
tctatcgatacacgtgatgcaatgcgtattttagttggtatcgacggttacattaatgac
gattggtcatacgatgtttattacagtcgttcacaattagaccacacaacactgttaaat
aacgatgttgcagcttcacgctttaaacaagctattttagttaatgacgatgctacagcg
tgtcaagatacatcaggcggttgtgttccacttaatattttcggtgaaggcaacatttct
gatgaagctgtagactttgttaatattggtgcaactaacgcgactacacttaaacaagaa
gtgttcatggcaacggtatctggtgcattaccatttactttcccaggcgctgaagaatca
gttggtgttgtttttggttatgaaaaacgtcaagacgaatcaacttaccgtccagatgaa
ttcttagctgcaggtgatgtactaggctttaatgctggtgaagcaactgttggttcatat
agctctgatgaaatctttacagaattctctattccacttatgagcggtaaagaatttgct
gaagacttaagcctttggggtgcagcacgttttgctgattactctaacattggtcgtgtt
tcatcattcgctacagcgataaactgggcaccaactgactggatcagcactcgtgttggc
ttccaatcatcagtacgtgctccaaatgtatctgagttattcttaggtgcgtctgcaggc
ttcccaggtgcggttgatccatgtgctgtagatggttacaaagctggtattacaagtgac
gcactttgtcttgctgacggtgtatcagctgcccaaatcggtgttttcgaacaagctaac
ggtcaaatcgaaggttcattcggtggtaactcagatcttcaagaagaaacttctgatacg
cttactgttggtattgttgttcaaccatttgaaggtttagatttcacaattgattacttc
aaaattgaaatcgaagatgctatttctgtatacggtgtaaataacacgcttgacgtttgt
tacaacgttgttaaagatgcatcgcatgaaacatgtcaaaacattagtcgtcgtgcagac
ggtaatgttgacgttgttaaatcattgaatgcaaacattgcatcaattgaaacaagcggt
gttgattttaacgtaacttacaatactgaacttgattttggtttgtttgatagtggttct
gacttgaacattcaattccgttctacattccttgatacgtctgacgtagttccagttgtt
ggtttagatacaatcaacgaatgtgctggttcatacggtaacacttgtggtaacccacaa
cctgagttccaagctaacactcgtgttaactggacaaatggcgatttaacattatctgct
ttagtacgttacatcggttcaactgatgatgaccaactaattggtgatgacccaattaca
cgtagtgacttagttgtttctgaaattgatgcagctatctatgttgatttaagtgcaagc
tacttagttaacgaaaacttaaatgttaactttggtgttaaaaacgtatttgatgaagaa
cctactgctttaggtgagtcacaatcacaagctaacactttcccagaaacgtatgacgta
attggtcctcgcgtattcttgagtgcttcttacacgtttaattaa

DBGET integrated database retrieval system