Colwellia sp. Arc7-D: DBO93_05670
Help
Entry
DBO93_05670 CDS
T05422
Name
(GenBank) OsmC domain/YcaO domain-containing protein
KO
K09136
ribosomal protein S12 methylthiotransferase accessory factor
Organism
cola
Colwellia sp. Arc7-D
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cola00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
cola03009
]
DBO93_05670
Ribosome biogenesis [BR:
cola03009
]
Prokaryotic type
ribosomal protein modification factors
DBO93_05670
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
YcaO_C
YcaO
OsmC
HopBA1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWB59473
LinkDB
All DBs
Position
1297284..1299473
Genome browser
AA seq
729 aa
AA seq
DB search
MEIKVNFLDNVKVEAKFDDFTVIADQPIRYKGDGSAPGPFDYFLASSAMCAAYFVKVYCN
SRDIPTENIRLSQNNIVDPEDRYKQIFQIQVELPESISEKDRLGIRRSIDRCTVKKVIQT
GPEFKVDLVDSLEDDAQAMLMAGTEGGESTYILGKDLPLEETIKNMTALLAGLGMKIEIA
SWRNIVPNVWSLHIRDAASPMCFTNGKGATKESALCSALGEFIERLNCNFFYNDQFLGQD
IANSDFVHYPNEKWFKLDESDDLPSGILDDYCLDIYNPDDELRGSNLIDTNSGNAERGIC
AIPYVRQSDGETVYIPSNLIENLFLSNGMSAGNNLAEAQVQCLSEIFERAVKRQIIEQEI
VLPDVPKNVLEKFPSILAGIEALEAQGFPVVVKDASLGGQFPVMCVTLMNPKTGGVFASF
GAHPSFEVALERSLTELLQGRSFEGLNDVPRPTFNSLAVSEPENAVEHFIDSTGVISWRF
FSNKQDYEFCEWDFSGTSAEENDRLFAILKDLGKEAYVAVFDQLGATACRILVPDYSEIY
PVEDLVWDNTNKALNYREDILNLHILDDDELESLVTRLEDSQLDNYIDIRTLIGIEFDEN
TVWGQLTILELKILIYLALGALEDAQELVEEFLQFNDNTVERRLFYQAMQAVLEIVIDED
MALEDFIANLNSMFGEETMNNVVGSAYGEVKFFGLTKTGMDLAGLDKHLRLIDSYKKLHQ
ARKIQAENK
NT seq
2190 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaattaaagttaattttctcgacaacgtaaaagttgaagccaaatttgatgatttt
accgtcattgccgaccaacctattcgttataaaggtgatggttcagcccccggaccgttt
gattacttcctagcatcttccgctatgtgtgctgcatattttgttaaggtgtattgtaat
tcgcgtgatattccaacggaaaatattcgtttatcacaaaacaatattgttgatcctgaa
gatcgctataaacaaatattccaaattcaagttgagctacctgaaagcatttcagaaaaa
gaccgtttaggtattcgccgctcaattgaccgttgtacggtaaaaaaagtcatacaaacg
ggtccagaatttaaagttgatctagtagatagcttagaagatgacgcacaagccatgtta
atggcaggcactgaaggcggagaaagtacttatattttaggtaaagacttaccgctagaa
gaaactattaaaaacatgaccgcacttttggcgggcttaggtatgaaaattgagattgct
tcatggcgcaatattgttcctaatgtttggtctttacatattcgtgatgccgcttcgccg
atgtgttttaccaatggtaaaggtgctacgaaagaaagcgcactttgttcagccttaggt
gagtttattgaacgccttaattgtaatttcttttataacgatcagtttttgggccaagac
attgctaacagtgactttgtacattatccgaatgaaaagtggttcaaattagatgaaagt
gatgatttacctagcggtattttagatgactattgcctcgatatttacaaccctgatgat
gagctacgtggttcaaatttaattgatactaactcaggaaatgctgagcgtggtatttgt
gcaattccttatgttcgtcaatctgacggcgaaacggtatacattccatcaaacttaatt
gaaaacttatttttaagtaatggtatgagtgcgggtaataatctagctgaagcgcaagtg
cagtgtttgtctgaaatattcgagagagcagtaaaaagacaaataattgaacaagaaatt
gttttacctgatgtacccaaaaatgtgcttgaaaagtttcctagcattttagctggtatc
gaagcccttgaagcacaaggttttcctgttgttgttaaagatgcctcgttaggcggtcaa
tttccggtgatgtgtgtcacccttatgaacccgaaaactggtggcgtattcgcctctttt
ggtgctcacccaagttttgaggtggcgttagaacgcagcttaactgaattgttacaaggg
cgcagttttgaaggcctcaatgatgtaccaagaccaacatttaacagccttgcggtatct
gagcctgaaaatgctgtagagcatttcattgactcaacgggtgtaatttcgtggcgcttt
ttcagtaataaacaagactatgaattctgcgaatgggatttttctggcacgagtgcagaa
gaaaacgatcgtttattcgctattttaaaagacttaggcaaagaagcttatgttgctgta
tttgaccaacttggcgctaccgcttgtcgtatattagttcctgactattctgagatttat
cccgttgaagatttggtttgggataatactaataaagcattaaattaccgtgaagatatc
ctcaaccttcatattttagatgatgacgaactagaaagtttagtgactcgtttagaagat
agtcagctagataactatattgatattagaaccttaataggtattgaatttgatgaaaat
accgtttggggacaactcactattttagagcttaaaatactgatttatttagccctaggt
gcattggaagacgcacaagaactagttgaagagtttttacagtttaacgacaacaccgtt
gaacgccgcctgttttatcaagcgatgcaagcggtgcttgagatcgtcattgacgaagat
atggcgctggaagattttatagctaacctaaatagtatgtttggcgaagaaacgatgaat
aatgttgttggctcggcatatggtgaggttaaattctttggtcttactaaaacaggtatg
gatttagctggcttagataaacacttaagattaatcgacagctacaagaagcttcatcag
gctcgaaaaattcaagcagaaaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system