Colwellia sp. Arc7-D: DBO93_08160
Help
Entry
DBO93_08160 CDS
T05422
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K07278
translocation and assembly module TamA
Organism
cola
Colwellia sp. Arc7-D
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cola00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cola02000
]
DBO93_08160
Transporters [BR:
cola02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
DBO93_08160
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Omp85
POTRA
POTRA_TamA_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWB57532
LinkDB
All DBs
Position
1863826..1865673
Genome browser
AA seq
615 aa
AA seq
DB search
MKQSRHNYIPLCCYHQLISHGKILKYLNYLYISRLFYTYITLLLLVTTSKVIAADPGINS
GTHLNIIGVETTFKTNIYRSLSSNENVIPLSLLGFPQSDNYILSKARSALQALGYYQPAL
TLSEDQKGKVLSIELNKPVRWNNSSIALNCEIESKEMSQLVAKHPFTKDKIINHGDYSQF
KSRVQRQAQELGLLNATFAKSALNVDIAELQANVDWIFNCGARYTIHKISIEGTVLSHDL
VNSYSTIREGDAYSQLDIVASQQALNRSGFFKSVVVDQSVDHATKSVDVNLSILDTDKYE
LKTLLGYGTDSGGKLGVSWRNRRVNNRAHQYVASIDFNEVKLNKANLHATFQYQIPLEKA
SSQWINLVSYEVKDEEIGRSNILTLESVLANKINAHWSSQWSIVMAQEQLESEADVNQSL
KYIVPSWQTNYYSVTDPFSAVEGWRWQSIIRFSTKQLSNPDIEFLQTDQKVKRIWSLNDD
WRLLLRARIGSTLMDTEDFTSSMPSTYRFFAGGDVSVRGYKHQSLSPTDNDVSIGGKHIL
TSGIEVDYLFYESFRWAIFSDQGNAFNDWKDWELQKSVGTGLRWVTPIGAIRLDIAKALD
GNKAWRFHVTIGPDL
NT seq
1848 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaaagtcgtcataattatattccgctttgttgttatcatcagttaatcagccat
ggaaaaatattgaaatatctgaattacctatacataagccgattattttatacatatatt
acattacttttactggtaactacgtccaaagtaattgcagctgaccccggcattaattca
ggcacacatctcaatattattggtgttgaaacaacctttaaaactaatatttatcgtagt
ttaagcagtaacgaaaatgttattcctttgtctttgctcggtttccctcaatccgacaat
tatattttaagtaaagcacgcagtgcactacaagcattaggctattatcagcccgcttta
acgttgtcagaagatcaaaaagggaaggtattgagcattgagctaaataaacctgttcgg
tggaataacagcagtattgcgctcaattgtgaaatagaatcgaaagaaatgtcacagctt
gtcgctaaacacccgtttaccaaggataaaataattaaccatggcgattacagtcaattt
aaatcacgggtacaacgtcaagcacaagagttaggtttattaaatgctacttttgccaaa
agtgctttaaatgttgatatagcagaactacaagcaaatgttgattggatttttaattgc
ggcgctcgatataccatccataagatctccattgaaggtacggttttatctcacgattta
gttaacagttattcaactattcgtgaaggtgatgcctacagccaattagacattgttgct
agtcaacaagcactgaaccgttctggtttttttaaatcggttgtggttgatcagtcagtc
gaccatgcaacaaaaagtgtcgatgttaacctttcaatactcgataccgacaagtatgag
cttaaaacgttattaggctacggtactgatagtggaggaaaacttggtgttagttggaga
aatagaagggtaaacaacagggcacatcaatatgttgcttctatcgactttaatgaggtt
aaattaaataaagctaatttacatgcgacatttcagtatcaaatcccgttagaaaaagcc
agtagccagtggataaacctagtcagttatgaggttaaagatgaagaaattggtcgcagt
aatattttaactttagagtcggtattagcgaataaaattaatgctcattggtcgagtcaa
tggtctattgttatggcacaagagcaactagaatcagaagctgatgtaaaccaaagtctt
aaatatattgttccttcatggcagactaactattacagtgtgaccgatcccttttcggcg
gttgagggctggcgttggcaaagtatcattcgatttagtaccaagcaattgagcaatccc
gacatcgaatttttacaaacagatcagaaagtaaaacgtatttggtcattaaatgatgat
tggcgtttactgttgcgcgctcgtatcggttcaacactaatggataccgaagattttacg
agttcaatgccatcaacctatcgattttttgccggcggtgacgtatctgtacgtggttat
aaacatcaaagcttatcgccgactgataacgatgtatccattggtggtaagcatatatta
acctcgggcattgaagttgattatttattttatgaaagctttcgttgggcgatattttcc
gaccaaggtaatgcttttaatgattggaaagactgggagttgcaaaagtcagttggtaca
ggtttaaggtgggttacaccgattggtgctattcgcctagatatcgcgaaggcacttgac
ggaaataaagcatggcgttttcatgtcaccatagggcctgatctatga
DBGET
integrated database retrieval system
