Colwellia sp. Arc7-D: DBO93_10110
Help
Entry
DBO93_10110 CDS
T05422
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
cola
Colwellia sp. Arc7-D
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cola00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cola02000
]
DBO93_10110
Transporters [BR:
cola02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
DBO93_10110
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWB57891
LinkDB
All DBs
Position
complement(2315535..2317706)
Genome browser
AA seq
723 aa
AA seq
DB search
MSLINQFLPKKISLAVIIALSGSATVYAEEASTKSNVEEIEKIVVTARGRSETLQQIPDS
VTVFSDEDIKAARITSIKDFSSLTPNLNVSTNFRSGLNFVTVRGLITPQVGEAPIAYVVD
GITVPNLEFINQGLHDIERIEVLRGPQGALYGKNAIGGAINIVTKQASDDVEGSIQASIA
EGNDKKLNVAVSGPIVEDKAYFRFSANYQDFDGLIDNSYLNEKVDYVDGAFGTQGMLEFY
LTDYTTLTLHGNYSKKTQGSNYMAFVDVDELEDFSIEPDANAVGLDESELWSVSAKLDHE
TDNGDFTFIASANDSDIMFFSDGDFTHQDASEDNFYFPITQINPIEEDSISVETRFTSPG
EESFRWAIGAYYESKDRTVSYDQVWDLTPTERVTYQMVKDNISEDPSLVFVGEKTVQESN
AYAVFGQANYDMRDDLELTVALRYDSEDRDAFDERDPNASKVNDTFSQLQPKASLAWQMT
EDHLLYSTYSKGFRSGGFNEYSPSVIRKYDEEISDTVELGLKTTWFDGKMWLNMSVFHIE
QQDAQFTRLNPDTFTLENLNIDEVAIDGFELEMSATITDNLSINFGLGLIDNEITKNIGN
DILSGRDLAQTEEGTMPYVSDFNLNGSIDYSQEAFSDYVFKARLAFNTLGPRSFDIFNED
TGESDTHTFLNANFTLENEQWSASIFASNLTDEASPETVFLFNPLIRMRNQPRQIGAQVR
YNF
NT seq
2172 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcattaatcaatcaatttcttcctaagaagatttcgttagcagtaattatcgcttta
tcaggaagcgcaactgtatatgcagaagaagcaagcactaagagtaatgttgaagaaatt
gagaaaattgttgtaaccgcacgaggaagaagtgaaacgttgcaacaaattccagactcg
gtcacggtctttagtgatgaagatatcaaagccgctcgtatcacatcgattaaagacttt
tcctcgttaacacctaatttaaatgtttcaaccaactttcgatctggtctcaattttgtc
acggttcgtggtttgatcacaccgcaagtaggtgaagctcctattgcttatgttgttgat
ggtattactgtccctaatttagagtttatcaaccaaggtttgcatgatattgagcgaatt
gaagtattacgagggccacaaggtgccctgtatggtaaaaatgcgattggtggtgcaata
aatattgtcacaaaacaagcatcagatgatgttgaaggcagtattcaagcctcaattgca
gaaggtaatgacaaaaagctaaatgttgcagtgagcggacctattgttgaagataaggct
tactttaggttttcagccaattaccaagattttgatggcttaatcgataactcttattta
aatgaaaaagttgattatgttgatggggcattcggtactcaaggtatgcttgagttttac
ttgactgattatacaacactaaccttgcatggtaactattctaagaaaacgcaaggcagt
aattatatggcgtttgtggatgttgacgaactggaagatttttctatcgagcctgatgcg
aatgcggtagggcttgatgaatcagagctttggtctgtttcagctaaacttgatcatgaa
actgataatggtgacttcacttttatcgcttcagcaaatgattctgacatcatgtttttc
tccgatggtgactttacacatcaagacgcgagtgaagacaatttttacttcccaattacg
caaataaacccaatcgaagaagactctatcagtgtcgaaactcgttttacttctccaggt
gaagaaagctttcgttgggcaattggtgcgtattatgaatcaaaagatagaaccgtatct
tacgatcaagtatgggatttaacgccaacagagcgtgtgacttatcagatggttaaggac
aatatttcagaagatccaagcttagtttttgttggtgaaaaaacagtacaagaaagtaat
gcttacgcggtttttggccaagcaaattatgacatgagagatgatttagagctaacagtg
gcattacgttatgactctgaagacagagatgcttttgatgagcgtgacccaaatgcttcc
aaagtgaatgatacctttagccagttacagcctaaagcttcacttgcttggcaaatgaca
gaagatcacctactttatagcacctattcaaagggctttagatcaggtggtttcaatgaa
tactcgccaagtgttattcgtaaatatgatgaagaaatttcagacactgtagagttaggg
ctgaaaacaacatggtttgacggcaaaatgtggttgaacatgtcggtatttcatattgaa
caacaagatgcacaatttacgcgtttaaaccctgacacttttaccttagaaaatttaaat
attgatgaagtggctattgatggttttgaactagagatgtcggcaacaataacagataac
ttaagcattaattttggtcttggtttaatcgataatgagatcactaaaaatataggtaat
gatattctttcgggtagagatttagctcaaacagaagagggtacaatgccgtatgtatct
gactttaatttgaatggctcaattgattattcacaagaagcattttctgattatgtattt
aaagctcgtcttgcctttaatacacttggacctcgttcatttgatatcttcaatgaagat
acgggtgaatcagacacgcatacatttttgaatgcaaatttcaccttagagaatgagcaa
tggtcagcttcaatatttgcctctaacctaactgatgaagcttcaccagaaacggtgttt
ttattcaacccactaatccgtatgcgcaaccaacctcgacaaattggcgcacaagttcgg
tataacttctag
DBGET
integrated database retrieval system
