Colwellia sp. Arc7-D: DBO93_13820
Help
Entry
DBO93_13820 CDS
T05422
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cola
Colwellia sp. Arc7-D
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_5
Cadherin_4
CshA_repeat
Cadherin
fn3
Ig_ILCR1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWB58526
LinkDB
All DBs
Position
complement(3185771..3190222)
Genome browser
AA seq
1483 aa
AA seq
DB search
MYINRCIYIITLLGITACGGGESAPAKETIDSVPVISLPQPSNTQTFDLTGKSGIALAVP
KKVAGTQSESNSTVSTSFSNAIGTLRLASSTSNVEGNLTFGITASDTDVMNKVSLYLPNA
ARSFVLCSNNCTPDFQATITGFNPQFANEVAGSLRIELIVEDNLGNSAVVDALSVNWQPI
QISAISASRENGTVTVSWSGNSALERYNLYAATEVGITSENAIELENGIQQLAINGTTAQ
FTDVDESKNYHLLVTGIDNGGESGKSVPYSLAKLGGVTNLPPVANNDNYQVNEDEPLTVN
VLDNDFDPEGLALIIDSILLPPFNGTLTQDDAGNFTYVPRLNFHGSDSASYRVIDAEGAT
AEATVFFEVLSVNDNPIAVDDTYGVDVNGNIVADNTNLLNNDSDIDGDDLTVSTTPITPA
QFGTVSINADGSFSYQSSGVLTENDQFVYQVTDGQGGTATATVTILPNGNVLPPIALNDD
YIVNEDNTLVITSVSLGVLANDSDPNDLPFELQETLLIQPQHGQLNLALDGTFTYIPNSN
FFGVDQFQYQIRNSADLVAQAFVTIKVNPTADIPVALDDNYQTQEDIQLNVDSSNGLLIN
DVNFDDSNLTVNTTPVSAPQNGSLVLAADGGFSYLPNTDFNGVDSFTYQVISGTGLTNTA
NVNISVIPLNDAPVAVNDIATTNEDTQITVDVLANDIDTESDVLAIISVNLENGTAAIVN
GKLDITPALNFFGDITVTYTITDSINAPSSGTLMLTVLPINDAPIAVDDRYSLGEDAVLR
VLASSDNHLLSNDSDIEGDTLTVNTTPVVNVNTNNFTVNTKALSDVTNGSLTLNSDGSFT
YIPNLNFNGIDSFTYQITDGNGGTAQASVTLAVAALNDVPEIIVNKIFTILEDANLTKLV
GDIDNLLSGASDADGDSLSINTTPALNVNNGSLTLSANGAFSYIPSLNFNGTDSFTYEVL
DGNGGKAQGNVTLTVSAVNDLPIAVSDAFSINEDIVLSILATDANNILNNDSDADSDTLT
VSLVSGTSNGTLSLNSDGAFNYTPNLNFNSTDSFIYQISDGNGGTAQASVTLTVNAVNDL
PVALDDSYSFAEDFTWVRAVTDGDQLLSNDTDADSDVLTVNTMPISGVSNGTLTLNSDGS
FTYIPDADFFSQDSFTYEISDGKGGTAQASVTLIVNAVNDIPVVVSNTKSFTFDEDMTLT
KLATDDNNLLTGASDVDGDSLTVTLDSGVTNNGLLTVNGDGSFQYIPNLNINGIDADTFT
YQVIDGKGGVSETVTVSLNIQAVNDAPTPDLDSYTFSISEGATDGDVVGTISASDIESDP
LVYSLTSGDISLFQIDPSSGVITVKGTNPLDFETSIQHALTVTITDNGTPIAESSNVTVT
IDIIDILGDAAITEEASFGRTVFGSLELTGFKTQPQLNKSVSVGSKVYFIGSIDNVDKDA
YVVAYNDDSTLDTTFGTNGKKSFDLGAQDYGKAIVEIEGVYTL
NT seq
4452 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatattaatagatgtatatatattattactttattgggcattacagcttgtggtggc
ggtgagtcagcacctgcaaaagaaactattgattccgtccctgtcataagtttaccacaa
ccctctaatactcaaacgtttgatttaacaggaaagtcaggtatagcgctagctgtaccc
aaaaaagttgcaggtacgcaaagcgaaagtaacagcacggttagtactagcttttcaaat
gctataggcacactcagacttgcaagctcaacgagtaatgttgaaggtaatttaactttt
gggataacagcatcagatactgatgtaatgaataaagtatcgctatatttgccgaatgct
gctcgtagctttgttttatgttcgaataattgtactccagattttcaagcaacaatcaca
ggttttaacccacaatttgccaatgaagtcgccggttcattacgtatagaacttatcgta
gaagacaatttaggcaatagtgcagtagtcgatgcgcttagtgttaactggcaaccgatt
caaatttcagcgattagtgcaagtcgagaaaatggaactgttaccgtttcttggtcaggt
aactcagcgcttgaacgttataatttatatgcagctactgaagttggaataacttctgaa
aatgcgattgaacttgaaaacggtatccaacaactcgccattaatggcacaacggcacaa
tttacggatgtggatgaaagcaagaattatcatttgcttgttactggtatcgataatggt
ggtgaaagtgggaagtcagtgccttatagcctagctaaacttggcggtgtgactaacttg
cctcctgtggcaaataatgacaattatcaagttaatgaagacgaacccctaactgttaat
gttctggataatgactttgatccggaaggcttagcattaataatcgacagtattttatta
ccgccttttaatggcacattaacgcaagatgacgccggtaactttacctatgtaccgagg
ttaaatttccatggtagtgatagtgccagttaccgagttatcgatgctgaaggtgcaacg
gcagaagccactgttttttttgaagtgttatctgttaatgacaaccctattgctgtagat
gatacctatggcgttgatgtaaatggcaacattgttgccgataacaccaatttattaaac
aacgattcagatatagatggtgatgatttaactgtatcaactacacctattacgcctgca
cagtttggtactgtatcaatcaatgcggatggcagtttttcttatcaatcttctggtgtt
ttaactgaaaatgaccagtttgtttatcaagttaccgatggtcaaggtggcacagctacc
gcaaccgtgactatattacctaacggtaatgttttaccacctatcgcgctgaatgatgat
tatatcgtcaatgaggacaacacactggtgataacctcagttagtttaggtgttttagct
aatgatagtgatccgaatgatttaccatttgaattacaagaaacgctacttattcagcca
caacacggacaattaaatttagcactagatggcacatttacttatatccctaatagtaac
ttttttggtgttgatcaatttcaataccaaataagaaattcggctgatttagttgcacag
gcttttgtcacaataaaggttaatcctaccgccgatataccggtcgccttagatgataat
tatcaaactcaagaagatattcagttgaatgttgacagttcaaatggcttattaattaat
gatgtaaattttgacgactcaaatttaactgtcaacacaacccctgtaagtgctccgcaa
aatggtagtttagtgttagctgctgatggcggttttagttacttacccaacactgacttt
aatggggttgatagttttacttatcaggtgatcagtggcacagggctgaccaatactgct
aatgttaatatctcggtaatacctttaaatgatgcccctgtagcggttaatgacatagct
acaacgaatgaagatactcaaatcaccgttgatgttttggcaaacgatattgatacagaa
agcgatgtgcttgctatcatttcagtcaacttagaaaatggcacagcagcgattgtaaat
ggcaaacttgatatcacgccagcgctaaacttttttggtgacattacggtcacctatacc
ataactgatagcattaatgcgcctagttcaggcacactcatgctaactgttttacctata
aatgatgcaccaatagctgttgatgacagatatagtctaggtgaagatgctgtgctaagg
gttttagctagtagtgataaccacttgttaagtaacgatagtgatattgagggtgataca
ttaacggttaataccactccagtagtcaatgttaataccaataactttaccgtaaatact
aaggcattgtcggacgttactaatggtagtttaacgcttaatagtgatggttcgtttact
tatattcctaatctgaatttcaatggcatcgatagctttacttaccaaataacagacggt
aatggtggcacagcacaagcgagtgttacattagccgttgctgcactgaatgatgtacct
gaaataatagtaaataaaatattcacgatacttgaagatgcaaatttaactaagttagtg
ggtgatatcgataatttactgagtggtgcgagtgatgcagacggagacagtttatcaatc
aatacaactcccgctttaaatgttaataatggcagcttaaccctaagcgccaatggtgct
tttagttatatcccaagcctcaactttaatggcacagacagttttacctatgaagtttta
gatggcaatggtggtaaggcgcaaggtaatgttacgttaaccgttagtgcagttaacgac
cttcctatagccgtttcagatgccttcagtattaacgaagatattgtgttgagtatctta
gccacagatgccaataacatattaaataatgatagcgatgctgatagcgataccttaacg
gtttctctagtgtcagggacgagtaacggcacgttatcattaaatagtgatggcgctttt
aattacacgcctaatcttaattttaatagcacggacagctttatttatcagataagcgac
ggtaatggtggcacggcacaagcaagtgttaccttaacggttaatgcggttaatgatttg
cctgttgctctggatgatagttatagttttgctgaagattttacatgggttagagctgtt
actgatggtgatcagttattgagtaatgataccgatgctgatagcgacgtgttaaccgtt
aataccatgccaatttcgggggttagtaatggtacattaaccttgaatagcgatggttca
ttcacttatatacctgatgcagattttttcagtcaagacagttttacttatgagattagt
gatggcaaaggcggtactgcacaggcgagtgtaacgttaatcgttaatgctgttaatgat
attcctgtagttgttagtaatacgaagagtttcaccttcgatgaagatatgactttgacc
aagttagccactgatgataataacctgttaactggtgccagcgatgttgacggcgatagt
ttaacggtaacgttagattcaggtgttactaataatggccttctaacggtcaatggtgat
ggttcgttccaatatattcctaaccttaatattaatggaattgacgcggacacttttact
tatcaagtgattgatggtaaaggcggcgtaagcgaaactgttactgtctcgctcaatatt
caagcggtaaacgatgcacctactccagatttagactcttatacttttagcattagtgaa
ggagcaactgacggtgacgtagttggcacaattagcgcgagcgatatagagagtgaccca
ctggtatattcacttacctctggcgacattagcctatttcaaatcgacccatcaagcgga
gttatcacagtaaaaggtactaatcctttagattttgaaactagtatccaacatgcctta
actgtaactattactgacaatggcaccccaattgccgaatctagcaatgttacagttacc
attgatatcattgatatacttggagatgcagcaataaccgaagaagcaagctttggtcgc
acggtttttggctcgttagaattaactggatttaaaacccagcctcaacttaacaagtca
gtaagtgtaggcagtaaagtttactttattggcagtatcgataatgtagataaagatgct
tatgtagtagcctataacgacgatagcactctggatacaacttttggcacaaatggtaaa
aaatcatttgatttaggtgctcaggattacggtaaagccattgtcgaaattgaaggggtt
tataccttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system