Colwellia sp. PAMC 21821: A3Q33_01590
Help
Entry
A3Q33_01590 CDS
T04816
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K03546
DNA repair protein SbcC/Rad50
Organism
colw
Colwellia sp. PAMC 21821
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
colw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
colw03400
]
A3Q33_01590
DNA repair and recombination proteins [BR:
colw03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
A3Q33_01590
Archaeal homologous recombinant proteins
A3Q33_01590
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_23
SbcC_Walker_B
AAA_29
ABC_tran
SMC_N
ABC_tran_CTD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARD43122
LinkDB
All DBs
Position
complement(394712..398635)
Genome browser
AA seq
1307 aa
AA seq
DB search
MKILSLRFENINSLKGHWKIDFTQSPFDTSALFAIIGPTGAGKTTILDAMCLALYHQTPR
LTISDKQNQLMTRHTANCLAEVEFEVKGQAYRAFWSQRRAKNSIEGNLQKPTAELAKLVS
TGEDNSELAVGAAEVIATKVSDIRTEIARLTGLDFSRFRKSMMLSQGEFAAFLNAPANDR
ADLLEELTGSEIYGEISKAVYDQHKEASNELKLLQAKSTGMQLLSAEQQQQINEQLNKAN
AQQQPFEAQLAHWQQIRSWLMNLQSANKQKLQAEQLQTSAQQTQQEHATQLQALALSEPA
ENLRADYQQLSYVNQQLVELNEQARLLADDAKQSQYQVDNAEKELAEFLLSHAKFVTQQQ
ETEQLIVEQVLPLDSKIAQLIEHKNQQVTRVNAASEALVQATVQSEQLAIQKQLQLDKIT
NAQVIISQQGYLATLPEHLPLWRNMLAQMVNEKQLSFELDTQNDNLQTQTDLLSNELIKS
QEQLVALEADYKQQQVMLNTKENDISQLLQQVQCQNEQALSQQLHGMQSTINEQSQALHN
AERYQTLNTELQEIDKALALDNQHLANLAEQLTPLRKHYKNQKSEFIDVQLIVEQQKTIM
SLSAHRDNLKVDEACPLCGSDQHPAIADYQALSDNSSTESEHQQRLKQLTVELEQLETQG
KALSSEQDRLKEKLNFITENKAIKQQEQQSLSQQWLALRELLKIDFELSAFEQIKADIHA
RRQQFEQLNNANNQLQQLKQSKQQQSELVLGLEKQLVNLSNQRENKAVQSSQLQQQIAQN
KQNLNHKLEQISQEWQKLSLLMQDCQLVMPECFSVFQPSNTANNTFSPNTFADAVQLQQT
WINDLEQQSHGYQTALSAVASDNEQLQQVQQQLAIIQSKIEQLTESEQAIKNELTIIESQ
HNDAKTQRQALFAEQDTQQMRQQLKQQQQTQEQLLVNLQNSVNEQKSLQQNISGKLNGNV
DAISRLTPQQQAAEQTWQTQLTHSDFETEDDFKAALLSQEQRISLKAIQQNINQQTQQAN
AQFEQVQQQLIQLEEDKYQLQAQTKQLVATIPLDEENACNSDELLNDLMFTEILTLDADV
DITEFDNKAAVCKEKLKQLQIRQGQLSQQITQDQQQRNEQQTLLDEIVKQQAELDDLSHL
NGLIGAADGAKFRRFAQGLTLSHLVYLANQQLNKLHGRYQLQRQESDSLALEVLDTWQAD
SVRDTKTLSGGESFLVSLALALALSDLVSAKTSIDSLFLDEGFGTLDNDTLEIALSALDS
LNASGKMIGVISHVDALKKRIDVQIEVKKQNGLGVSELADCYRYLGS
NT seq
3924 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatattatcgctgcgctttgaaaatattaattctttaaaaggtcactggaaaatt
gattttacgcaatcgcccttcgataccagtgcactttttgccattatcggcccaacgggc
gctggcaaaactactatactcgatgccatgtgtttggcgctatatcatcaaacgcctagg
ctaactatttcggataagcaaaaccaattaatgactcgccatacggcgaactgtttagct
gaggttgaatttgaagtaaaaggccaagcttatcgtgcattttggagccaacgtcgagcg
aaaaatagtattgaaggcaatttacaaaagccgaccgctgagctagctaaactagtctct
acgggtgaagataacagtgaattagccgttggggcagccgaggttattgcaacaaaagtt
tccgatatacggaccgaaatagcacgattaacgggcttagatttttctcgttttagaaaa
tcgatgatgttatcgcaaggtgagtttgctgcttttttaaatgcaccagccaatgatcgc
gccgatttattagaagagctaacgggtagtgagatttatggcgaaatttctaaagcggtg
tacgatcagcataaagaggcaagtaacgaattaaagttattacaagctaaaagcaccggc
atgcaattgctctcagcagaacaacaacagcaaataaatgagcaacttaacaaggctaat
gctcagcagcaaccttttgaagctcaactcgcacattggcagcaaattcgtagctggttg
atgaatctgcaaagcgctaacaaacaaaaattacaagctgagcaactacaaacatcagca
cagcaaacacaacaagaacatgctacgcaactgcaagcgttagccttgtcagagcccgct
gaaaacttacgggctgactatcagcaactcagctatgtaaatcaacagcttgttgagctt
aatgagcaagcaaggttacttgcagatgatgcgaagcaaagtcaatatcaggtagataat
gccgaaaaagaactcgcagaatttttactatcacatgctaaatttgttacccagcaacaa
gaaactgagcaactaatcgttgagcaagtactgccgcttgatagcaaaatagctcaattg
attgagcataaaaatcagcaagttacccgagtaaatgcagcgagcgaagcattagttcaa
gcaaccgtgcaaagcgagcagttagccatacaaaagcagttgcagttagataaaataact
aacgcgcaagttattatttcgcaacaagggtatttggctacattgcctgaacacctgccg
ttatggcgtaatatgcttgctcaaatggttaatgaaaagcagttgagctttgagctagac
acgcagaatgacaacctacaaacgcaaaccgatttactatcgaatgaactcatcaaatcg
caagagcaattagttgcactagaagcagattataaacaacagcaagtcatgcttaacacg
aaagaaaacgatatttcccagttgttacagcaagtccagtgtcaaaatgagcaagcactt
agccagcaactccatggcatgcaatcgacgataaatgagcaatcgcaagcgctgcataat
gctgagcgttaccagacattaaacactgaacttcaggaaattgataaagcattagcctta
gataatcagcatttagcaaatttagctgagcaattaacacctttacgcaaacactacaaa
aaccaaaaatctgagtttattgatgtccagttaattgttgaacagcaaaaaacaattatg
tcgctaagcgcacacagagataatttaaaagtagatgaagcttgcccattatgtggttca
gatcagcatcccgctatagcggattatcaggcacttagtgacaatagttcaactgaaagc
gaacatcaacagcgtctaaaacaactgacggttgagttagagcaacttgaaactcaaggc
aaagctttgtcttcagagcaagacagactaaaagagaaacttaatttcattactgaaaat
aaagcaataaaacaacaagaacagcaaagtttatcgcagcagtggttagcattaagagag
ttattgaaaattgactttgaattatcagcctttgagcaaataaaagcagacattcatgcg
cggcgacaacaatttgagcagttaaataatgcgaataaccaattacaacaattaaagcag
tctaagcaacaacaaagtgaattagttttagggctagaaaaacagttagtgaacttatct
aatcagcgcgaaaataaagcggtgcaatcaagccagttgcagcaacaaattgcgcaaaac
aagcaaaaccttaatcacaagcttgagcaaatatcgcaagagtggcaaaagctaagcctg
cttatgcaagattgtcagttggtaatgcctgaatgttttagtgtttttcagccctctaat
acggctaataatacattttcacctaatacgtttgctgatgctgtgcaattacaacaaacc
tggataaacgatcttgaacagcaaagccatggttatcaaacagcccttagtgcggtggca
agcgataatgagcaactacagcaagtgcaacagcaacttgcgataatacaaagtaaaatt
gaacaactaactgaatcggaacaagcgataaaaaatgaattaacgataatcgaaagtcag
cataatgatgctaaaacccagcgccaagcattgtttgcagagcaagatactcaacaaatg
cgccaacagttaaagcaacaacaacaaacacaagaacagctacttgttaatctgcaaaat
agcgttaatgaacagaaaagccttcaacaaaacattagcgggaagttaaacgggaatgtc
gacgcgataagccgtttaacgccacaacagcaagctgctgagcaaacttggcaaacgcaa
ttaacccatagtgactttgaaactgaagacgattttaaagcggcattattaagccaagaa
caacgcataagtttaaaagcaatacagcaaaatattaaccaacaaactcaacaagctaat
gcacaatttgagcaagtacagcagcaattaatacaacttgaagaagataaataccagctt
caagcgcagacaaagcagcttgttgccactattcctctggatgaagagaatgcctgtaat
agcgatgaactgctgaatgatctaatgttcactgaaatattaacgctagatgcggatgta
gatataacagaatttgataataaagccgctgtctgtaaagagaaattgaaacaactgcaa
attcgccaaggtcaactaagtcagcaaattacccaagatcagcagcagcgtaatgaacaa
caaacattactcgatgaaatagttaagcaacaagcagagctcgatgatttgtcacatctt
aacggcctaattggtgcagctgatggtgctaaatttaggcggtttgctcaagggttaacg
ctttctcacctcgtttatttagcgaatcagcagctcaataaattgcatggtcgttaccag
ttgcaacgtcaggaatcagacagtttggccttagaagtgcttgatacttggcaagctgat
agtgtgcgcgatacgaaaaccttatccggtggtgaaagctttttagtgagtttagcgtta
gcactggcgctatcagatttagtgagcgcaaaaaccagtattgattcgctatttcttgat
gaaggtttcggcactttggacaacgatactttagaaatcgctttgtctgcgcttgattcc
ttaaacgccagtggcaaaatgattggagttataagccatgtagatgcgttaaaaaaacgt
attgatgtacaaatagaagtgaagaaacaaaatggacttggcgtgagcgaattagctgat
tgttatcgctatcttggtagttaa
DBGET
integrated database retrieval system