Colwellia sp. PAMC 21821: A3Q33_02440
Help
Entry
A3Q33_02440 CDS
T04816
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
colw
Colwellia sp. PAMC 21821
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_1
Invasin_D3
MG2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARD43274
LinkDB
All DBs
Position
complement(597875..600085)
Genome browser
AA seq
736 aa
AA seq
DB search
MALLQRFSLILLFATLVGCGGSSGGFTESTDGSGDGSSSDAITVSLEISDKNLTQATPQT
LTVTVMQGSTPLSDKLVTFTVSNIDLVSFSTDINTSSTDADGKAEIGLLVGVSSGDGSIT
ATVDGVDSNSITFKSAGDGGAAGVPVANDISLFASSQQIASSGNEDVQLTTIAKDINNNL
VAGVTITFSSTSGQLEIINSVTGADGQANAILKTNNEPTNRVITITSKSGQVTDTLNVQV
TGTSINLTGSSSLAINDNNSFFIQVLNSEGVGIPNAKVDLSLMPPTTGDVAAITIVDSVT
TDITGQANFVVTGTTGGKNSIVANAVGVTTNHDVTVQADSFLFSSFNNGQGTVTPGTNAL
PDVLLSNNATIELTWMQSNTAIADGTIVNFTSTRGTLSSNSASTVDGKVEAIISSTNAGK
ALVTVTGTQDGITLSNQLEFEFVAESVNSLSTQASPSSIAPNGDTSTISVVAKDLNGNLV
KGKTIEFTLTDTSGGNILPATAVTDSNGSASTVYTSNSVSAQDGVSIIATVQDTPSQTDS
VTLTVADRNLFITLGTGNELIEVDSATFNKQYVVFVTDVDSASPAKNTVLTVSAVPKSYR
KGRWIKLLDEQDEFDQWGAEVSTTCDNEDLNIDGVLDVGEDINGDGRLTPGNVAAVLGEV
TTDDQGSALIDIKYPQNFGAWVNINLIVSAKVGGTESSQQVVFVLPAFLVDVLNEDAPPP
SGTSPFGNSNNCSDSN
NT seq
2211 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgctacttcaacgctttagtttaattttactgtttgcaaccttagtcggttgtggc
ggtagtagtggtgggttcaccgaatccacagatggcagcggcgatggtagttcatcagac
gctataacggtttctttagaaatttcggataaaaaccttacacaagcgacacctcaaacg
ctaacagtaaccgtcatgcaaggtagtacaccgctatcagataagttagttactttcact
gttagcaatatagatttggtcagttttagtaccgacataaatacaagtagtactgatgca
gatggtaaagctgaaataggcttgctcgttggtgttagtagcggtgatggttcaatcacg
gcgactgtcgatggtgttgactctaattccataacgttcaagagtgcaggtgacggtggt
gctgcgggtgttcctgttgctaatgacattagtttatttgccagtagtcagcaaatagca
tctagtggtaatgaagacgtccagttaactaccatcgcaaaagatataaataataatctt
gttgcaggagtaactattaccttcagttcaacttcagggcagcttgaaattattaattct
gttactggtgctgatgggcaagccaatgcaatattaaaaacgaataatgagcctactaac
cgtgttattacaataacttctaaaagtgggcaagtaaccgatacccttaatgttcaagtt
actggaactagtattaatttaacagggtcgtcgtcgttagctattaatgacaataatagc
ttttttatccaagttttaaattcagaaggtgttgggatacctaatgccaaagttgattta
tctttgatgcctccaacaacaggtgatgtggcagcaattacaatcgtcgattctgttact
accgatataactggtcaagcaaactttgttgtaacaggaacaactggcggtaagaattcg
atagtggctaatgctgttggagtgacaactaatcatgatgtgacggttcaagctgattca
tttctatttagtagctttaacaatggtcaagggactgttacaccgggaactaacgcttta
cctgatgtgttactatccaataatgccacaattgagcttacttggatgcaatcaaataca
gcaattgcagacggtactattgttaattttacctccacacgaggcacgttaagttcaaat
tctgcatccactgtagatggaaaggttgaggcaataattagttcaactaacgctgggaaa
gctctagtgacagttacaggaacacaagatggtattactttaagtaatcagcttgagttt
gaatttgttgccgaaagcgttaatagtctatcaactcaagcctcgcctagctcgattgca
ccaaatggggatacctcaaccatttctgttgttgcaaaagatcttaacggtaatctagtt
aaaggaaaaacaattgaatttaccttaacagatactagcggtgggaatatattgccggca
actgcagttacagatagtaatggtagtgctagcacagtttacacgtcaaattcagtgtct
gcgcaggatggcgtgtcaattattgcgacagttcaagatacaccttcacaaacagattct
gtaactttgacagttgcagatcgaaatttatttattactttaggaacaggaaatgaatta
attgaagtggatagtgcaacattcaataagcaatatgttgtatttgtcacagatgtagat
tcagcttctccagcaaagaatactgttttaacagtatctgcagtacctaaaagttacagg
aaagggcgctggataaaattgttggatgaacaagatgaatttgatcagtggggagctgaa
gtcagcacaacgtgcgacaatgaagatttaaatattgatggcgttttagatgtaggggaa
gatattaacggtgatgggcgcttaacccctggcaatgttgcagctgtacttggagaagtt
acaacagatgaccaaggtagtgctttaattgatattaaatacccacaaaattttggtgcc
tgggtaaatattaatttaattgttagcgcaaaagttggcggtactgaaagctcacaacaa
gtggtttttgttttgcctgcatttctggtagatgtgctgaatgaagatgcgccgccacct
tccggtacaagtccatttggtaattcaaacaattgttcggacagtaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
