Colwellia sp. PAMC 21821: A3Q33_05405
Help
Entry
A3Q33_05405 CDS
T04816
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
colw
Colwellia sp. PAMC 21821
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
colw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
colw02000
]
A3Q33_05405
Transporters [BR:
colw02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
A3Q33_05405
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARD43794
LinkDB
All DBs
Position
complement(1287678..1290062)
Genome browser
AA seq
794 aa
AA seq
DB search
MKPVTSKKLVKSVIALAIVNACISQSAIAAEEKSTKATDKIERIMVTANRQSQDLQEVSS
SITALGADDVERAGIIDISGLQQVIPGLKVGSSGGEVRPAMRGARTNEVGVAGTGIAEQI
VGIFQDGIYVPTTTAGMGAFVDIERIEVLRGPQGTLYGRNTFAGSINVITNRPNMDEIEG
NIKITTGAYNRSAYEGVLNIPLADDLATRIVVASDRHDGYIKNHVIDGPSDDLREKNSFY
ARSITRYEPSDNFNATFRLDYSKKDANSEAIWGYQQIAGYSLTETSPGVYNPNATVTPGH
IYQRDDVEHNDTGPYDVYRNAMSLDKQEAFSATAILEWYTDVADFKWTSNYSELSGKQFY
DNDYSDGGLDFVGGFGRQDDQKTISTELQVSSNHEGPLQWIAGLYYFDQEADWEWLSSTD
TTGNGVADSIVVPSWGNPDHDPHTSDSIAVFGQLRYELSDDLRLVGGLRYNKDEKSFTGD
TIPDWDDSAVLWKAAIEFDQTDDVMLYASAATGIRTGGANDSRVVSRGADPLYDNEEVMS
YEIGMKSTLLDGDMRLNISAFVNEYDDVKAQLFAVACSDITSTDTVLECVEAGATQSFEY
YENGGGIDTKGIELDMQWYPIDNLAVTGTFTWLDAEFTDDYAVGNDQLRPLLGLGNFEGR
QDINDNNSQFSFAGWAPAMAPEYTVGLAANYEFGLSNGGALIPHIQVTYSDEYYAFDVNT
PETKVDAHAIIDARLTWLINDDVKVDFFVKNLTDEEVLTRAVVHSQLVDAKPINSVQANW
NDPRTWGASLKYTF
NT seq
2385 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagccagttacatcaaaaaagcttgttaaatcggttattgcattagctattgtcaat
gcatgtataagccaatctgcaattgcagcagaagaaaaaagcacgaaagccactgataaa
attgaacgaataatggttacagctaaccgtcaatcacaagatcttcaagaggtgtcttct
tctattactgcattaggggctgatgacgtcgaacgcgcaggaattattgatatatcaggc
ttacaacaggttattccgggtttaaaagtaggtagttcaggtggcgaagttagacctgcc
atgcgtggtgctagaacgaatgaagtgggtgttgctggtactggtattgctgaacaaatt
gttggtattttccaagatggtatttatgtaccgacaacaactgcaggcatgggtgctttt
gtcgatattgaacgcattgaagtattgcgtggcccgcaaggtactttgtatggtcgcaat
acctttgcaggtagtataaacgttattactaatcgtcctaatatggatgaaattgaaggt
aacattaaaataactacgggcgcatataatcgcagtgcctatgaaggtgtattgaacatt
cctttagcggatgacttagcaactcgaatcgttgttgcttcagatagacatgatggttat
atcaaaaatcatgttatagatggcccttctgatgacttacgtgaaaaaaattcattttat
gcgcgttctataacgcgttatgaaccgagtgataattttaatgcaacttttagattagac
tactcgaaaaaagacgctaactctgaagctatttggggttatcaacaaattgctggttac
tcacttactgaaactagtccaggtgtttacaatcctaatgcaaccgtaactccgggccat
atttatcagcgagacgatgtagagcataatgatacaggtccttatgatgtatatcgaaat
gcaatgtcgctagataaacaagaggcattttctgcaactgctattttagagtggtacacc
gatgtagctgactttaaatggacatctaactattcagagctaagcggtaagcagttttat
gataacgattacagcgatggtggtttagattttgttggcggttttggtcgccaagatgat
cagaaaacaatttcaacagagttacaagtttcatcaaatcatgaaggtccactgcagtgg
attgcaggcttatattatttcgatcaagaagctgattgggaatggttgtcaagtactgat
actactggcaatggtgtagcagattcaattgttgtccctagttggggtaacccagatcat
gaccctcatacttctgactcaattgcagttttcggacaactacgttatgaactgtctgac
gatttacgtttagtgggtggtttacgttataacaaagatgaaaagtcatttaccggcgat
acaattccagattgggatgactcagcagtattgtggaaagcggcaattgaatttgatcaa
actgacgatgtaatgttatatgcgtctgctgctacaggcataagaacgggtggggcaaac
gatagtcgagttgtttcccgtggtgctgatcctctttatgacaatgaagaagttatgtca
tatgaaataggtatgaaaagcacattgcttgatggtgacatgcgtctaaatatatctgct
tttgttaatgaatatgatgatgtaaaagctcaactatttgctgttgcttgtagcgacatt
acctctacagatactgttttagagtgtgtagaagctggagcaacacaaagctttgaatat
tatgaaaatggtggtggtattgataccaaaggtattgagcttgatatgcaatggtaccct
atcgataatttagcggttacaggtacttttacctggttagatgctgagttcacggatgat
tacgcagttggtaatgatcaattacgtccgttattaggattaggtaactttgaaggtcgt
caggatattaatgataataacagccaatttagttttgctggctgggctcctgcaatggca
ccagaatacacggttggcttagcggcaaactatgagtttggcttaagtaacggcggtgcg
ttaattccgcatattcaagtaacttattcagacgagtattatgcttttgatgttaatact
cctgaaactaaagttgatgcccatgccattatcgacgcacgattaacctggttaattaac
gatgatgttaaagtggacttctttgttaaaaacttaaccgatgaagaagtgttaacgcgc
gcagttgtgcattctcaacttgttgatgcaaaaccaataaactcagtacaagctaactgg
aatgatcctcgaacttggggtgctagtcttaaatataccttttaa
DBGET
integrated database retrieval system