Colwellia sp. PAMC 21821: A3Q33_06180 Help Entry A3Q33_06180       CDS       T04816                                  Name (GenBank) hypothetical protein   KO K12287   MSHA biogenesis protein MshQ Organism colw  Colwellia sp. PAMC 21821 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:colw00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02044 Secretion system [BR:colw02044]     A3Q33_06180 Secretion system [BR:colw02044]  Type II secretion system   MSHA pilus biogenesis protein    A3Q33_06180 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  DUF6701 Laminin_G_3 Pardaxin Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ARD43937 LinkDB All DBs Position complement(1478148..1482302) Genome browser AA seq 1384 aa AA seqDB search MKYLLLFVVCLLPFTASAFEDILYDFNTRTPSTDIFAYKGQSSTQVPTTLSAVGSAVSAS EYASLKVDDQTYQQSIATTNGSYPVTQYVINIDEDEADITQFNILWNGYGINSNNGRRDG VNFYIWNFRTASYVLVQEGSSTSNEVTLLGQATSNITDFFGGSNQNAMVLYMVAQDKKSG QNKDDIIYSDYVSLTIKVPDPAVAIANFQFDECKYLGSGNEVIDQFGNYSGTSHNGVNTS DDAQIENALAINNAVHHMQTNIPLPSRYSVSTWFKKPTDITGSRYFVLGAMVNGSDLLVI DRLNDWKWAIYSSNPQQTIYGTYQFNTLSDGWHHMALVYKNGQSNLYIDGTFIEAINLIP AGTLKYIGTSFDEISTNDPQGFRAPLDEFIVFNGALKASEISTIYNNQNGGANYDGGVRA SPNCIELIAQYSLDESSWSSVAGEVIESNANLNGQAFNGANTALNSPALTGNPGTCGFGV FDGIDDYVSIADNTALDIPRELTITAWINPKSLPSASENFHTIVSKDENYEFHLKPTGEI NWWWETNELTTTGAGITLNSWYHIAITYKSGQQVIYVNGVERGSGTFSEQLTLNDAPLNI GQDQNQEHGSDSRYFHGFIDEVKIYTGALNATEVNQVYNERHACAEPVIHHYEIVHDGNG LTCAAEPITIKACSNSDCTTESTESVSLNLNITSSVTGKEIKASPTFNGSTQINLSHTTA ETLVLSIDGASIAASNAVECSGFGTSCDITFTDAGFRFLYGDTNSEVIGHQTAGAIFSET LKIQAVKNNNGACEGIFAGNVDVSLAQLNVTPDSSFNAGLAFQTNGVSIAKQPLFTDNVT LNFGNDSIAVIPIPSYLDVGEIRLHAHYSNANISLEGSSNDFWVKPHSFAISATNALGAI NGSSASSTIIHKAGDNFGFTLSALNAAGNLTQNYRQADGELQLKILRVAPVLNGAIDGQF TYALGQNRAATTNASFQSAILTSFSDGEKGKSAFSGAQYNEVGVINVDIQDINYGGLGNV DGLITANDLTIGRFTPAYFKQTVKTEHKGKLDAYHSATGICSISDWAYTGQQTTNGKGAI SYSLEPKITITAYNANDGLTKNYTLGDSEGFMKLLFSGVDINLPTNDDSQQKVGSASGNP VAISAVMEAGSLSASIDVSGNLIAGEWLYTLSNDDHFSYNKNASSLLPPFNAQIAFVTSR IEDSDGVLLSSNTDATEKLITDGVEIRFARMVLENAYGSENAKLRAPLNVQIYDDSTFKL HTDESCLSTLIGDKKAGAKYSGNMNLWDYRLIDIDTDAIQVSDTAASVSGVFDRGIQAGL SFSSPGKRGMLEWEYEVPSWLKFKWDGVDSDNDGNFYDDNPSAVLSFGFYRGNDRIISWR EVVN NT seq 4155 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaagtatcttttattgtttgttgtttgtttactgccatttactgccagtgcgtttgaa gatattttatatgacttcaatacccgcacgccgagtacagatatctttgcatataaaggg cagtcaagtacacaggtccctactaccttaagcgctgtaggctctgctgtctcagcatct gagtacgccagtttaaaagttgacgaccaaacgtatcagcaaagtattgcaacgacaaat ggaagttatcctgtcacgcaatatgtaattaatatagatgaagatgaagcagatattaca caatttaatattttgtggaacggatatggcatcaatagtaataatggccgtcgcgatggc gttaacttttatatatggaactttcgaacagcatcttatgtcttggttcaagaaggttcc tcgacaagtaatgaggtcacgctcttaggtcaggcaacaagtaatattactgacttcttt ggtggtagcaaccaaaatgccatggtgttatatatggtcgctcaagataaaaaatctggg caaaataaagacgatattatatacagtgactatgtcagtttaacgattaaagtaccagat cccgccgttgctatagcaaactttcaatttgacgagtgtaaataccttggctcaggcaac gaagttattgaccagtttggtaactactcgggcaccagtcataacggcgtgaatacgtca gacgatgcacaaatagaaaatgcattggcaattaacaatgcagttcaccatatgcaaact aatatcccgctacccagtcgatacagtgtttcaacttggtttaaaaaacctactgatatt acaggcagtcgatattttgtgcttggggctatggtaaatggcagcgatttactcgttatc gatcgattaaatgattggaagtgggcgatttatagctcaaatccgcaacaaactatttac ggtacgtatcagtttaataccttaagtgatggttggcatcatatggcgctagtgtataaa aatgggcaatccaatttatatatagatggcacatttatagaagcgattaatctaattcct gccggcacacttaagtatattggtacatcttttgatgaaataagtaccaatgacccgcaa ggttttcgggctcctttagatgaatttattgtttttaatggcgcgttaaaagcgagtgaa atcagcacaatttataacaaccaaaatggtggtgcaaactatgatggtggcgtgagggcc agtcctaattgtatagaattaattgcacaatattcactagatgaaagctcgtggagcagc gtagcaggtgaggttatagagagtaatgcgaacttgaatggacaagcgtttaatggtgct aacactgcattaaactcgcccgccctaacgggcaatcctggtacctgtggttttggtgtt ttcgacggtattgacgattatgtcagtattgcagacaacacagcattagacataccaaga gaattgaccattacagcttggataaaccctaaatcattaccaagcgctagcgaaaatttt cataccatagtttcaaaagatgagaattatgagtttcatttgaaacctacaggtgaaatt aactggtggtgggaaaccaatgagcttacgactacaggagctggtattacccttaatagt tggtatcacatagcaataacctacaaaagtggtcaacaagtcatttatgttaatggtgtt gaaagaggctcaggtacttttagcgaacagttaaccttaaatgatgctccgttaaatatt ggtcaagatcaaaatcaagagcacggttcagactctcgttactttcacggctttattgat gaggtaaagatatatacgggcgcacttaatgccactgaagttaatcaggtttataatgag cgacacgcttgtgctgagcccgttatacatcattatgaaatagtacatgacggtaatggt ttaacctgtgccgccgagccaataactataaaagcatgtagtaatagtgactgcacaacc gaaagcactgaatcagttagcttaaatcttaatattacgagctcagttacgggcaaagag attaaagcctcgccgacatttaacggcagtacccagattaatttaagtcatacaacggca gaaacgctggtgttatctattgatggcgcaagcattgccgctagcaacgctgtggaatgt tcaggttttggaacaagttgcgacattacctttactgatgcaggtttcaggttcttatac ggtgacactaatagcgaagttattggacaccaaaccgctggcgctatttttagtgagacg ttaaagatacaagcagtaaaaaacaataatggtgcttgcgaagggattttcgccggtaat gttgacgttagtcttgctcaactaaatgtcacgcctgatagcagctttaacgccgggtta gcatttcaaaccaatggagttagtatcgccaaacagccactatttactgataatgttacc ttgaactttggcaacgacagcattgctgttataccaatccctagctacttggacgttggc gaaattcgactgcatgcccattactcaaacgctaatatttcgctggaaggtagttcgaat gatttttgggtgaaaccgcatagttttgcgatttcagcaacaaacgcgctaggtgcaata aatggtagtagcgcttcgagtacaataatccataaagctggggataatttcggctttacc ttgagtgcgcttaatgccgcaggaaatctaacacaaaattaccgtcaagccgatggcgaa ctacagctaaaaatattacgcgttgcgccagtacttaatggcgcaattgacgggcaattt acctacgcgctaggacaaaatcgcgcggcgacaacgaatgcaagttttcaaagcgccata ttaacgagttttagtgatggcgagaaaggtaaatcagcatttagtggcgcgcaatataat gaagttggcgtaattaatgttgatatacaagatattaattatggtggtttaggtaatgtt gacggcttaattaccgctaatgatctgactattgggcgatttacgcctgcttactttaag caaacggttaaaacagagcataaaggaaagcttgacgcgtaccatagtgcaacaggtata tgttctatttctgattgggcctataccggccagcaaaccactaacggtaagggcgctatt agctatagtcttgagcctaaaataacgataacggcatataatgccaatgacggccttacc aaaaactacaccttgggcgattcagaaggttttatgaagctactctttagtggggttgat attaacttaccaacgaacgacgatagccaacaaaaagtaggcagtgctagcggcaacccc gttgctatttctgcggtgatggaagcaggcagtttgagcgctagtattgatgttagcggg aatttaatcgctggcgaatggctttatactttatctaatgatgatcattttagttataac aaaaatgcttcaagtttattaccgccttttaatgctcaaatagcttttgtgacgagtcga attgaagatagtgatggtgtgttactcagcagtaatactgatgcgacagagaaactgata accgatggtgtagaaattcgctttgctcgtatggtgttagaaaatgcttatggctctgaa aatgccaagttacgcgcgccgttaaatgtccaaatttatgacgattcaacgtttaaattg cataccgatgaatcttgcttatcaacacttattggcgataaaaaagccggcgcgaaatat tcaggtaatatgaacctttgggattatcgtttaatcgacattgatacagatgcaatacaa gttagtgataccgcagcgagcgtttcaggtgtttttgaccgtggtattcaagcagggtta tcattcagtagcccagggaaacgtggcatgcttgaatgggaatatgaagtgccaagctgg ttaaaatttaagtgggatggggtagacagcgataatgacggtaatttttacgatgacaac ccaagcgcggtattaagttttggtttctatcgcggtaacgatcgaattatttcatggcgt gaagtggtgaattaa

DBGET integrated database retrieval system