Colwellia sp. PAMC 21821: A3Q33_09195
Help
Entry
A3Q33_09195 CDS
T04816
Name
(GenBank) hybrid sensor histidine kinase/response regulator
Organism
colw
Colwellia sp. PAMC 21821
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_7
HATPase_c
Response_reg
HisKA
PAS
PAS_4
PAS_8
DUF2107
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARD44468
LinkDB
All DBs
Position
2176748..2180185
Genome browser
AA seq
1145 aa
AA seq
DB search
MFPNWQLAGLSFAYIGLLFFIAYVGDKYRHKLLRKSQAVIYALTLGVYCTSWSFLGTPGQ
ASTNFISHIPIYLGPILLFIFAWPFIQRIIRVSLKLNLTSIADLLAARFGKSHNLAILVT
IVALIGTMPYIALQLKAIVYTFQQLQAEQSLANWHFGLVVSLVLAGFTIVFGVRNIDVTE
RHPGVMLAIAFESLVKLFAFIAVGIFVTYVLFDSPMEIWRRSSASLQLDQQLNFPNVMSM
FAMLVITMAAFLSLPRQFQVMVVELKDEKDTWLSRRIFPLYLLVFAVFAVPLGLAGDLLL
GDTVPSDAYVLFLPWYQQQPWLTLFTFLGAISAASSMVIISSIALSTMLSNEIVFPWLYR
ANKNHDTDYDKFRLRLLTIRKVLVLFVILLGYGVFLMASPDTLSSLGEIAFGAFAQLTPA
LIAAFYWRRATLTAVYGGIVIGFSAWLFLNFIPQFGVYPHPFEGGFLPANSMASLLSLSA
NIIAMWLLSHVSRQSVQERMQASLFMEYQAPKALQLQRNKQINYQELELLVSRFVGEKKT
ITSFKQFQRSTDKAQMSNVAYNQKLLQHTENTLASVMGASSARLVLSSALEGRDIALDEI
AVLVEEASSQRQQYSQDLLQSAIENASEGISIVDSDLNLVAWNIKYVDLFSYPSELIFQG
SPVSDLIRFNVVRGLCGVGKIEEQVSKRLAHLRNGSPHSSEREHSDGRVIRIEGNPLPGG
GFVMLFSDITAFRQAERGLKEANVDLETRVLERTKKLEQTNDALALAREKAEQAHVKKSL
YLKACSHDLMQPLEAARLFTSALSSQGNLTATQQRQVDNIDHSLKVANDLVADLAEIARI
ESGNIRPNISNFSVQSLFDDLAKEFSASAVDLEIEFRVHCNSKWLRSDRNLLRRILQNLI
GNAFRYASPGKVLLGTRVKGDTIDIQVLDNGPGIPADKQVMVFEQFIQLDNQRSSSAGGL
GLGLNITQSLAQLLGHPLALNSILGKGCKFSVEVERTQAQQEVLAVKSAVNIGLSDVTVM
CIDNDPDVLSGMVELLSAWGCNVLAADSYQQALSVYDMHKNDIEILLVDYQLDANFNGIT
LTKKLRKLSRHHVPAILITATTDSDLEEKTLAADIGFMRKLIKPAALRAMMSAMLTKKLQ
AKYLQ
NT seq
3438 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttccaaattggcaattagcaggcttaagttttgcttatataggtttgctgtttttt
attgcctatgttggagacaaatatcgacataaattattgcgcaaaagccaagcggtaatt
tatgcactcaccctaggagtttattgcacgtcttggagtttcttaggtacgccgggacaa
gcatcaactaatttcatttctcatatccctatttatctaggacctatattactgttcata
tttgcgtggccatttattcagcgcattattcgggttagtttaaaattaaacctgacatca
atcgccgatttattagccgcacgttttggtaaatcacacaatttagccattttagtcacc
atagtggcactcattggcaccatgccttatatcgccctgcaattaaaagccattgtttat
accttccaacagttacaagcagagcaaagcttagccaattggcattttggccttgtggtt
agtttggtattagcaggctttaccattgtgtttggtgtccgtaatatcgatgttactgag
cgtcatccaggggttatgctagctattgcttttgaatcgctagttaagctatttgcgttt
atcgctgtgggtatttttgttacctatgtcttgttcgattcgccgatggaaatttggcga
cgttcatctgcaagcctgcaacttgatcaacaacttaactttcctaatgttatgtcaatg
tttgccatgctagtgataacaatggcggcatttttatctttaccacgacaatttcaagtc
atggtcgttgaactaaaagatgaaaaagatacttggcttagtcgccgtattttcccactt
tatttattagtatttgcagtttttgctgtaccactaggcttagcgggagatttattactc
ggcgatacagtgccatcggatgcttatgtattatttttaccttggtatcaacaacagcct
tggctaaccttatttacctttttgggcgcaatatctgctgctagctctatggtgattatt
tcttctattgccttgagcactatgctcagtaatgaaattgtttttccttggttatatcgg
gctaataaaaatcatgacactgattatgacaagtttcgtttacgcttgttaactattcgt
aaagtattagttttattcgttattttattaggttatggcgtgtttttaatggcgtcgcca
gatacattaagctctttaggtgaaatagcctttggtgcttttgctcaattaaccccagca
ttaatcgccgcattttattggcgaagagcaactttaacggccgtttatggtggcattgtt
atcggtttttctgcctggctgtttctgaactttattccacagttcggtgtttatcctcat
ccgtttgaaggagggttcctacccgctaattcaatggcaagcttactgtctttatcggct
aatattatcgcgatgtggctgctttcccacgtaagtcgtcaaagtgtgcaagagcgcatg
caagcgtcattatttatggaatatcaagcaccaaaagctttacaactacagcgcaataaa
caaattaattatcaagaacttgaattattagtttcgcgatttgttggtgagaaaaaaacc
atcactagctttaaacaatttcagcgctcaacagacaaggctcaaatgagtaatgttgcg
tataaccagaagttattgcaacacacagaaaataccttagcgagtgtgatgggggcatcg
tcagcccgcttagttttatcatcggcattagaagggcgagatattgctttagacgaaatt
gccgtactggtggaggaagcttcaagccaacgccagcaatatagccaagatttattacaa
agcgcgatagaaaatgccagtgaaggtatttccatcgtagatagcgatttaaaccttgtt
gcctggaacataaagtatgttgatttattctcttatccaagcgagttaatcttccaaggt
agcccggttagcgatttaattcgctttaacgtggtacgtggtttatgtggtgttggcaag
attgaagagcaagtgagtaaacgcctagcgcatttacgtaatggcagcccgcatagctct
gagcgagagcatagtgatggtcgagtgatacgtattgaaggtaacccgctgcctggtggt
gggtttgttatgttgttttcagacataaccgctttccgacaagctgaaagaggtttgaaa
gaagcgaatgttgatttggaaactcgagtacttgagcggacaaaaaaactcgaacaaacc
aatgacgctttggctttagcacgtgaaaaagctgagcaagctcatgtcaaaaaaagttta
tatttaaaagcgtgtagccatgacttaatgcaacctttagaagccgcacgtttatttact
tcggctttatccagccaaggtaatttaacggccacccaacaacgacaagtcgataatatc
gatcactctttaaaagttgctaatgatctagtcgctgatttagccgaaattgcccgtata
gaaagtggcaatattaggccgaatataagcaatttttcagtgcagtctttatttgatgat
cttgccaaagaattttctgccagtgctgtagaccttgaaattgaatttcgtgtgcattgt
aattctaagtggctgcgctcagaccgaaatttactgcgccgcatattacaaaacttaatc
ggtaatgcttttcgttatgccagtccaggcaaggtgttattaggcacgcgcgtgaaaggc
gatactattgatattcaagtgctggataatggtcctggcatccccgcggataagcaagtt
atggtctttgaacaatttattcaattagataatcaacgaagttcatctgcgggtggacta
ggtttaggcttgaatattacccaaagcttagctcaactgttaggtcaccctttagcgctt
aactcgatactaggtaagggttgtaagttttctgttgaagtagaaagaactcaggctcag
caagaagtgcttgcggtaaaatctgccgttaatatagggttaagcgatgtgacagtgatg
tgcattgataacgacccagatgtgttgagtggtatggttgaactgttatcagcatggggt
tgtaacgtattggccgctgattcttaccaacaagcactttcagtttatgacatgcataag
aatgatattgaaatattgttggttgattatcaacttgatgccaattttaacggcattacg
ttaactaagaaactaagaaagttaagtcgacaccatgtgcctgcaattctaattaccgcc
acaacggacagcgatttagaagaaaaaaccttagcagccgatatcggctttatgcgaaaa
ttaattaaacctgccgcgcttcgagcgatgatgagtgccatgttgacgaagaagctgcaa
gccaaatatttgcaataa
DBGET
integrated database retrieval system