Colwellia sp. PAMC 21821: A3Q33_12245
Help
Entry
A3Q33_12245 CDS
T04816
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K07289
AsmA protein
Organism
colw
Colwellia sp. PAMC 21821
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
colw00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99992 Structural proteins
A3Q33_12245
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AsmA
DUF748
YhdP
DUF2701
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARD45011
LinkDB
All DBs
Position
complement(2887359..2889287)
Genome browser
AA seq
642 aa
AA seq
DB search
MKLFLKSFAVIIFIIVLLIVVATQLISTEDIFNQVSTKVEQSTGRTLTVAGEQSLSVFPS
LSLVLNDVHFSNVKGGSKPDMASISELMIHIPWLSVFSGELTIEKFVINNPDILLEKSID
GTVNWQFSTLSGAESSTEKSPADDKSINLPDAFDISLGQVEINGGKLTFIDHQSKETKVI
DQLNLAVKLPSLREPLNLSGSVRYMTQVLELESSITTPAKAINNQPFSVELDLTSALVKL
NYKGEVVQQGKELSGKLSVSGDSVKQLLNWQNIPLTAKDEAFNKFSFSTNMGFANNKLTL
NALMVNLDALAFKGSTTITLSTPLKLASNIDLGILDLNPYLPEPTTEATPADDTASQPIV
WDDTALDLSALASLNADITIKSSQLFVRDIKLGKNEIAVVLNNSVANVQLKSFQGYEGNG
SGAIKVNANKKPYQITTKFDLANINAEPLLNDAVGFDKLLGKGQLAWDLSTKGISQRDFI
QQLNGHLDISFIDGAVKGVNLAAIAKSASSIMQGNLSAVSLDSDFSNADKTDFAALTGKF
TLTNGVANTDNLSLNNPFIRISGTGVIDLPETKVNLQVKSKIVASTQGQAAESTDAGVVI
PIKITGPFHNIKIRPDVSSGAKDKVKDKVKDKLKDKLKGLFG
NT seq
1929 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattattcttaaaatccttcgctgtaattatttttatcattgttttattgatagtg
gttgcgacgcaattaatatcaactgaggatatatttaaccaagtcagcactaaagtagaa
caatcgacaggtcgaacgttaacggttgctggtgaacagagtttaagtgtatttccttca
ttatctttggtgctaaacgatgtgcacttttccaatgtaaaaggcggctctaaacctgat
atggcaagtattagtgaattaatgatccatatcccttggctttcagttttttctggtgag
ttgaccattgaaaagttcgttatcaataatcccgacatactgctagaaaaaagtattgat
ggtacggtgaactggcagttctcaactttgtctggcgcagaaagcagcacggaaaaatca
cccgctgatgataaatcaattaatttacctgatgcttttgatattagtctgggtcaagta
gaaattaatggtggtaagctcacttttatcgatcaccaaagtaaagaaactaaagtcatt
gatcagctcaatttagcggtaaaactgccctcgctacgcgaaccccttaatctctctggt
agtgttagatatatgacacaagtacttgaacttgaatcaagtattaccacacctgcaaag
gctatcaataatcagcccttttcagtcgaattagacttaacatctgccttagtaaaatta
aattataaaggtgaagtggtacaacaaggcaaagagctaagtggtaaattatcggtttca
ggagattctgttaagcagttattaaactggcagaacattccattgaccgctaaagatgaa
gcttttaataaattctcatttagtaccaatatgggctttgctaacaataaactcacgctt
aatgcgttaatggttaatttagacgcgttagcatttaaaggttcaacaaccattaccttg
tcaacgccgctcaaacttgccagcaatatcgatttgggcatacttgaccttaacccttat
ttacctgagccaaccacagaagcaacaccagcagatgatacggctagtcagcccattgtt
tgggatgatactgcgcttgatttatccgctttggcgtcattaaatgccgatattacaatt
aagtcgagtcagttatttgtccgcgatattaaattgggtaagaatgagatagccgttgta
ttaaacaatagcgttgcgaatgtgcaattgaaaagctttcaaggttatgaaggcaatggc
agtggcgcgattaaggttaatgccaataaaaaaccttatcaaatcacgactaaatttgat
ttagcgaatattaatgccgagccgctacttaacgatgcggttggctttgacaaattattg
ggtaaaggccaattagcgtgggatctctcaaccaaaggcattagccaacgtgattttatt
cagcaactcaatggccatctcgacattagctttattgatggcgctgttaaaggcgttaat
ttagctgcaattgccaagagcgccagcagtattatgcaaggtaacttatctgcggtcagt
ttggacagtgactttagcaacgctgataaaacagattttgcggccttaacaggtaaattt
acgctaactaacggcgtcgctaatacagataatttgtctttgaataatccttttatcaga
atatcaggcaccggtgttatagacttgcctgaaaccaaagttaatctgcaggttaaatca
aaaatagtggcgtcaactcaagggcaagcggcagaaagtactgacgctggcgttgtgatc
ccgataaaaattaccgggccatttcataacattaaaatacgccccgatgttagttcagga
gccaaagataaagtaaaagacaaagttaaagataagctcaaagacaaactaaaaggactt
tttggctaa
DBGET
integrated database retrieval system