Colwellia sp. PAMC 21821: A3Q33_13185
Help
Entry
A3Q33_13185 CDS
T04816
Name
(GenBank) c-type cytochrome biogenesis protein CcmF
KO
K02198
cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
Organism
colw
Colwellia sp. PAMC 21821
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
colw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
colw02000
]
A3Q33_13185
Transporters [BR:
colw02000
]
Other transporters
Others
A3Q33_13185
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CcmF_C
Cytochrom_C_asm
ResB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARD45174
LinkDB
All DBs
Position
3096482..3098467
Genome browser
AA seq
661 aa
AA seq
DB search
MIPELGHFALIIGFAFALCLSIVPLIGVAQNNQQLINSAKPLSFGLFLFIGISIFLLAYS
FTQDDFSVKYIANHSNSLLPYYFKISAVWGGHEGSMLFWIFALTCWTFAVSVFSKQLEKE
FVARVLAVMGMIAVGFILFTLLTSNPFERLLPNFPLEGQDLNPLLQDIGLIIHPPMLYMG
YVGFSVAFAFAIAALMAGKMDAAWARWSRPWTVAAWSFLSVGIALGSWWAYYELGWGGWW
FWDPVENVSFMPWLAGTALIHALAVTEQRNTFKHWTLLLAIFTFSLNLLGAFLVRSGVIT
SVHSFAVDPDRGMYLLVLLAVAVGGSLTLYAFRAANVSSPNRFTFYSRENTILVAISILV
TATVTILLGTLYPMIIDAMGLGKISVGAPYFNAVFVPMMIALFLFMGIGPLIRWKKARKG
ELSKHLNIISITSVLFGAAWPFIFAGEFSISAFIGMTLGCWIVLAVLKDVFNNAKQADGS
FKFSAVPLNHIGMAVAHAGIAITVIGVTMVSTYEKEINVKMAPGESTNLSGYTIAFEGTK
NILGPNYSAIQGQVKVSIDDEFVTLLKPEQRTYKVQRTGMTEAAIHTTLWRDIYVALGDP
LEQNAWSMRLYYKPFIVWIWLGAFFMAIGGFLAILSKRYRKRVLATEQASKQDKPVVLQE
A
NT seq
1986 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcccagagcttggccatttcgcactcattatcggatttgcttttgcactatgtcta
agcatagtgccactgattggtgtagcgcagaacaaccaacaattaattaatagtgccaaa
ccgttaagttttggtctgtttttgtttataggcattagtatatttttattagcctatagc
tttacgcaagatgacttttctgtcaaatatatcgctaatcactccaatagcttactacca
tactacttcaagattagtgcagtttggggagggcatgaaggctcaatgcttttttggatt
tttgcgttaacttgctggactttcgctgtcagtgtttttagtaaacaattagaaaaagag
tttgttgcacgtgttttggcggttatgggcatgatcgcggtgggttttattttatttaca
ctactaacctctaacccgtttgaacgtttattaccaaactttccgcttgaaggacaagat
ttaaatccattattacaagatattgggttaatcattcatccgccaatgttgtatatgggt
tatgttgggttttcagttgcctttgcctttgctattgctgccctaatggcagggaaaatg
gatgccgcatgggctcgttggtcacgtccttggacggtagctgcttggtcatttttatca
gtaggtatcgccttaggtagctggtgggcatattatgaacttggttggggcggttggtgg
ttttgggatcctgttgagaatgtttcatttatgccatggctggccggtactgccttgatt
catgcattagcggtaacagagcagcgtaacacctttaagcattggacattattactggct
atttttaccttctcattgaatttattaggtgcatttctagtacgctctggcgtcattact
tccgtacattcatttgcggtagaccctgaccgcggcatgtacttgctggttttgttagcg
gtagctgttggtggttcacttaccctttatgcatttagagctgcaaatgttagtagtcct
aaccgtttcactttttattcacgtgagaatactattctagtggccatatcaatattagtg
actgcgacggttactattttattaggcacgctttaccctatgattattgatgcaatgggt
ttagggaaaatatctgttggagcgccatattttaacgctgtttttgtacctatgatgata
gcactgtttctatttatgggtattggaccgcttattcgctggaaaaaggcgcgtaaaggt
gagttgtctaagcacttaaatattatctctattactagtgtgttatttggtgccgcgtgg
ccatttatctttgccggtgaatttagtattagcgcatttattggtatgaccttaggttgc
tggattgtcttggcggtgttaaaagatgtgtttaataatgctaaacaagctgacggcagt
ttcaagttttcagccgttccactaaaccatataggtatggctgttgctcatgctggtatt
gctatcaccgtgatcggtgtaactatggtttcaacctatgaaaaagaaattaacgtaaaa
atggcacctggcgagagtacaaatttgtcaggttacactatagcgtttgaaggaactaag
aatattttagggccaaattatagtgcgattcaagggcaggttaaggtttcaattgatgat
gagtttgttaccttattaaaaccagaacaacgtacttacaaagtacaacgtaccggcatg
accgaagctgcgattcataccactttatggcgtgatatttacgttgcattaggtgacccg
cttgagcaaaacgcttggtcaatgcgtttatattacaaaccgtttattgtttggatatgg
ttaggcgccttttttatggcaataggtggtttcttagccatattgagtaaacgctaccgc
aaacgcgtattagcaaccgaacaagcatctaagcaagataaacccgtagttttacaagag
gcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
