Colwellia sp. PAMC 21821: A3Q33_13595
Help
Entry
A3Q33_13595 CDS
T04816
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
colw
Colwellia sp. PAMC 21821
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_3
GGDEF
Phosphonate-bd
Vpu
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARD45246
LinkDB
All DBs
Position
3209439..3212234
Genome browser
AA seq
931 aa
AA seq
DB search
MTVLLALPVSAQNIKQTYRIAINKTSYPYHFIDKEQQADGMMVELWQLWAKKQNVQLEFV
ALNWQQTIKQVQERELDIHAGIFKSTERAKHLDFSMTFFTQSRHLFLHHSIAHLKNISQL
TPYTVGVVDGSTHAISIKSKYPNLTLRSFSNRNALYRAAMEGEILMMAGVEKLSKNFSEY
ELLNQQFPAFAKVTYDTGGYSAAVAKGESQLIDFIKQGMEKISDQELLTIKKKWLISDKS
ENVITFSYSNNQMPFSGTSLAGNAQGFFVELWQIWAKANDQDIEFILVDSNESTQTDNSL
ADIYIPNVTSEKNSSESVLGPVIYNIDYGLFLSNNINKILHISEIENKNIGVVSSPSFVK
DIQNKANSAVIINFDNYEAMFEAAERGELDVIAGQSDIVENYLIKYKLQSIYLKFNGYVF
KRDIHAVFNTVNPELSQLIVEGFGENVLADLATLEKKWHLDKTSAFFKRQLAVLALTEPE
EQWVKDNNVVKFGITKNWIPVEFIDKYGEVKGINPDIFQLMSSRLNIKIDYVVHESFNEL
YQALLVGDVDVIGSVVATQERKKEVLFTDSYWSMPWVILHPRELGKQLNLADFSGKRLAI
AKGYYLVSIIRKNFPLIDLRLVDDNEEGLLAIQKGIVDGYIDSLSSGTELLKRESLVSLS
MSVLEEVDKNGNHLAVNKSLPMLANILNKAVLSISDLDSQQIYEKWFDVNIETGLDKSVV
LRVALQVGALITLIIIIIMVWNRRLYLEIKNRKKLEKKMQYMATHDDLTGLANRVLLKDR
LNSAISFHQRQKLLVAVLFIDLDGFKDINDTHGHDVGDELLIEVATRLTGCVRESDTVVR
FGGDEFVLLLTGLHNQDEAAYVADKVLKLIQQPIKLSEVSATIGCSIGIAMFPDDGDSDN
ELLKIADSLMYDVKAAGKNHYAFNRKDDSAV
NT seq
2796 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagtgcttttggcgctgcctgtttctgcgcaaaatattaaacaaacttatcgtatt
gccattaacaaaacctcttacccttatcattttatcgacaaagaacaacaagccgatggc
atgatggtcgaactttggcaattatgggcaaaaaagcaaaatgttcagctggaatttgta
gcacttaattggcaacaaaccatcaaacaagtgcaagagcgagaattggatattcacgcc
ggtatatttaaaagcactgaaagagctaagcacttagattttagtatgactttttttacc
caaagccggcacctttttctacatcattcaatagcacatttaaaaaacatatcacaactt
acgccctataccgtaggtgttgttgatggttcaactcatgccatttcaattaaaagcaag
taccccaatttaacgttaaggtctttttctaatcgtaatgctctgtatcgagctgccatg
gaaggtgaaattttgatgatggcgggtgttgaaaagctgtctaaaaatttttcagagtat
gaattacttaatcagcaatttcctgcgtttgcgaaagttacttatgacaccggtggctat
agtgcagcagtcgctaaaggagaaagtcaacttattgattttataaagcaagggatggaa
aaaatttctgatcaagagctattaaccattaagaagaaatggctaataagtgacaagtca
gaaaatgtgattacattttcatattcaaataatcaaatgcctttttcaggaacatctctt
gctggtaatgctcaaggtttttttgttgagttgtggcaaatatgggcaaaagctaatgac
caagatatcgaatttatccttgttgattcgaatgaatctacccagactgataatagcctt
gccgatatttatatacctaacgtgacgagtgagaaaaatagctctgaaagtgttttaggg
ccggttatttataatattgattatggtttgtttttatcgaacaatatcaataaaatactt
catatatctgaaattgagaataaaaatattggcgtggtatcttcaccgagctttgttaaa
gatattcaaaataaagccaatagtgctgtcattattaattttgataattatgaggcgatg
tttgaagctgcagagcggggtgaacttgatgttatcgcaggtcaaagtgatattgttgaa
aattatttaattaaatataagctacagtccatctacttaaaatttaatggttatgttttt
aaacgtgatattcatgcggtgttcaatacagttaacccggaattaagccaactaatagta
gagggctttggtgaaaatgtattagctgacttagccacgttagaaaaaaagtggcattta
gataagacatcggcgttttttaaacgccaattagctgttttggcattaacagagccagaa
gaacagtgggtaaaagataataatgtcgttaaatttggcataaccaaaaactggatacct
gttgagtttattgataaatatggtgaagttaagggaataaatccggatatatttcagctg
atgagtagtcggcttaacattaaaattgactatgttgttcatgaaagttttaacgagctt
tatcaagcattattagtcggtgatgtcgatgttattggtagtgttgtagccacacaagaa
cgtaaaaaagaagtgttatttactgactcatattggagtatgccgtgggttattttacat
ccacgtgaactcggtaaacaattaaacttagccgactttagtggtaagcgcttagccatt
gctaaaggttactatttggtatctattattaggaaaaactttccactgattgacttaaga
ttagtagacgataatgaagagggtctattagctattcaaaaaggtatagttgatggctat
attgatagcttatcatcaggcactgagttactgaaaagggaaagtttggttagcttgtca
atgtcagtccttgaagaagtggataaaaatggtaaccatttagcggtcaataaatcgtta
cctatgctagcaaatatccttaataaagcggttttaagtatttcagatcttgatagtcag
caaatttatgaaaaatggtttgatgtgaatattgaaactggcttagataaaagtgttgta
ctgcgtgtagcgttgcaagtgggggcactgataaccctcatcatcatcattattatggtt
tggaaccgccgtttatacttagagattaaaaaccgtaaaaaattagaaaaaaaaatgcaa
tatatggccactcatgatgacctcactggccttgctaatcgtgttttattgaaagataga
ctcaacagtgcgatttcttttcaccaacgacaaaagcttttagtggcggtgctatttata
gaccttgatggctttaaagatattaatgacactcatggtcatgatgtaggtgacgaactg
ttaatcgaagtggcaacacgcttaactggttgtgtgcgagagtctgacacggttgtgcgg
tttggcggtgatgaatttgtgctgttacttacggggttacataatcaagatgaggctgca
tatgttgctgataaagttttaaagttgattcaacaaccgataaaattatctgaagtaagt
gcgacgattggctgtagtattggtattgcaatgtttcccgacgatggtgattcagataac
gagctattaaaaatagcagattcgttaatgtatgacgttaaagccgcggggaaaaatcat
tatgcctttaatcgtaaagacgactctgctgtctaa
DBGET
integrated database retrieval system
