Colwellia sp. MT41: CMT41_03960
Help
Entry
CMT41_03960 CDS
T04159
Name
(GenBank) cytochrome C biogenesis protein CcmF
KO
K02198
cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
Organism
com
Colwellia sp. MT41
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
com00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
com02000
]
CMT41_03960
Transporters [BR:
com02000
]
Other transporters
Others
CMT41_03960
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CcmF_C
Cytochrom_C_asm
DNMT1-RFD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALO36544
UniProt:
A0A0S2JKP3
LinkDB
All DBs
Position
940743..942782
Genome browser
AA seq
679 aa
AA seq
DB search
MPELIPELGHLALIIAFAFSICLSLIPLIGVHSPEHSSLKKLMTYAKPLAYGMFFFTGIS
LIILGYSFVIDDFSVKYIANHSNTHLPYYFKVSAVWGGHEGSLLLWVFSLTAWTAAVARF
SNGIEEEFISRVLAVMGMIAIGFIAFTLLTSNPFERLWPNVPMEGRDLNPLLQDVGLIIH
PPLLYFGYVGFAVSFAFAVAALMAGKMDAAWARWSRPWTIGAWTFLTIGIALGSWWAYYE
LGWGGWWFWDPVENASFMPWLVGTALIHSLAVTEKRGIFKNWTILLAIFAFGLSLLGTFL
VRSGVITSVHSFAADPGRGIFILVLLAIAMGGALTLYAFRANKVASFSRFAFYSRETALL
LCNVILVIATVTVLLGTLYPLLVDALGYGKISVGPPYFNAVFIPIMSILFIFMGVGPLIR
WKKAKKGELRKQLFKPSVFSIAFGLMFPVVYGGEFNALVAMGITLATWVFLIVVKEVKNQ
YQLAGKITTSHLGMATAHAGIAITIVGVTIVSMYETETNVKMFLNDRVTVSGYEIEFKGI
KHVEGPNYSAEQGQINIYKINGSGESDFVTLLQPERRQYRVQTMGMTEAGIDAGLFRDVY
VALGDPLPGGAWAIRVHYKPFVRWIWLGALFMGLGGILSILDKRYRRKKPVVAKSAVVAD
SLINPLAISPTSTAKVSET
NT seq
2040 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctgagcttatacctgagcttggtcacttagcccttattattgcttttgcattttct
atttgcttaagcttgattccgttaataggtgttcatagcccggagcatagttctttaaag
aagcttatgacctatgctaaaccactggcctacggtatgtttttctttaccggtatcagt
cttattattctcggctacagttttgtcattgatgatttctccgttaaatatattgccaat
cattctaatacccatttaccctattactttaaagtaagcgctgtttggggcggtcatgaa
ggctcattattattgtgggtcttctctttaaccgcatggactgctgcagttgcacgtttt
tcaaacggtattgaagaagagtttatctcccgtgttttagcggtaatgggtatgattgct
ataggttttatcgcttttaccttattaacatcgaacccatttgaacgtttatggccgaat
gtacccatggaaggccgggatttaaaccccctattacaagatgttggtttaattatccac
ccgcccttactctattttggctatgttggctttgctgtctcctttgcttttgctgttgcc
gctttaatggctggcaagatggatgccgcttgggctcgttggtctcgtccttggacaatt
ggtgcttggacgttcttaaccataggtatagcgctaggtagttggtgggcatactatgaa
cttggctggggcggttggtggttctgggatccagttgaaaatgcatcctttatgccttgg
cttgttggtacggcactgatccactctttagcggtaacagaaaaacgtggtatctttaaa
aactggactattttactggcaatatttgcttttggcttaagtttattaggcaccttctta
gtacgctcaggggtgattacctcggtacactcctttgcggccgatccgggtagaggtatc
tttattttagtgctgttggcgatagctatgggtggagcgttaaccctgtatgccttcaga
gcgaataaagtggcgagtttttcacgctttgctttttactcccgagaaacagcactatta
ttgtgtaacgtcattttggttattgctacggtaaccgtactgcttggcaccttgtatcca
ttattggttgatgccttaggttacggcaaaatctcagtgggtcctccttattttaatgcc
gtttttatcccgataatgagtattcttttcatctttatgggtgttggtcctttaattcgt
tggaaaaaagctaaaaaaggcgagttacgtaagcaattatttaaaccctcggtatttagt
attgcctttggtttaatgtttccagtggtttatggtggcgaattcaatgccttggtggcc
atggggattaccttagcaacttgggttttcttaatcgtggttaaagaagttaaaaatcag
tatcaattagccggaaaaataaccaccagtcatttaggtatggcaactgcgcacgcgggt
attgctatcactattgttggcgtcactatcgtttccatgtatgaaactgaaaccaatgta
aaaatgttcctcaatgacagagtcactgtttcaggttatgagattgagttcaaaggcatt
aaacatgtcgaggggccaaactatagtgctgagcagggacaaatcaatatctataaaatt
aatggttcgggcgaaagtgactttgttactttactccaacctgagcgtcgacaataccgt
gtgcaaaccatgggcatgactgaagcaggtattgatgccggtttatttcgtgatgtctat
gtcgccttaggtgatccattacctggtggtgcttgggcaatacgtgtgcactataagcca
tttgttcgttggatttggttaggtgctcttttcatggggcttggtggtattctttcaata
ctggataaacgctatcgccgtaaaaagcctgtggtggctaaatcagcggtagtggcagat
tcacttattaatccgctagccatttcacctaccagtacggcaaaagtgtcggagacataa
DBGET
integrated database retrieval system
