Colwellia sp. MT41: CMT41_04875
Help
Entry
CMT41_04875 CDS
T04159
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
com
Colwellia sp. MT41
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
com00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
com02044
]
CMT41_04875
02035 Bacterial motility proteins [BR:
com02035
]
CMT41_04875
Secretion system [BR:
com02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
CMT41_04875
Bacterial motility proteins [BR:
com02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
CMT41_04875
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4P_PilY1
PQQ
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALO34137
UniProt:
A0A0S2JDM2
LinkDB
All DBs
Position
1144844..1148545
Genome browser
AA seq
1233 aa
AA seq
DB search
MLGIEEMYEDYKMNNFLAKSLLALMLATASDITLSEDIDLYISDVVRQAGKSTKVLIIFD
TSGSMGDVHTVSAKFDPELTYPATDSAHAYLDRALYFNKGGIDNNTTIPSHHNDARRFDA
VINSCKKSIDILAVEGYYTGHIREYTYKGHKGTWGEIRDNNSLSGIEIIDCEDDAYIIDS
EGVVDLGSTYNAEGLLPGYPVNDLGTKKSPISHNPLKTTTNVDWASASYVTLYTAKYLRW
YHGQTVGNLTETLMDTAITSISGVIKTTPSVDFGLELFNFNAGDGSASGNGGRIVLGIQK
MTTSNKADLLNIINNQITPNGATPLCESVYEASQYFAGAGVEFGDDDINYPSYNYHKNIP
PPDTDIVKSNGDYLSPFNNCASSIAHIILITDGVPTNDHRADSKITALKTKVLRVDSNGT
PVYDANGQPIYDDKNFIGSSYHWNNYSKDDSYLPALAGWMSEYDINTNLDGKQTVVTHTI
GFSGGADAARSLLVETARQGKGEYFHADSGLQLTQALISILNRLPQSNDRLASASVAANS
FDRTQTLDSVYYAMFEPQTGARWQGNLKKYKVKDGKITGVGGTEAICEVNDRNTFCQNAQ
SFWSPQVDGDIVGKGGVVAWFNSQKPSDRTLYMDGGVGSLITFDRTNLEAAFTDADTGVV
SLAAMLGVADLVDSNGDSIESAAVDEMLAWATGADVDDENNDNEFDDMRADVFGDPLHSK
PLVVNYGTSIRIVIGTNSGALHMFKDSGATVEESWAFMPKEFIHNIKPLRDNYASSNKVY
GIDGEITLHLYDKNGNGKIDSGTDKAWIFFGLRRGGSSYYALDITTPDAPKLMWHIDSGT
DGFEELGQSWSQPKVGYSALNTSGDTASPVLFIGGGYDVNKDSDGLATSDTKGRAIYMLD
AETGNILWSALPQNGTTVFPGSHSIASAIGLLDSTGNGLVDRLYIGDTGGSIWRVDMPDD
ETKHISVFELATFGGGDDDQRFFYEPTIVRALISEIIETEVSDGQGGKKTITVHQEIPYD
AVLIGSGDRSDPLGTDTSDTLYMIKDSNIITQTFSDSSTPPVPTAGFTKDDLYPYTYDPF
GNASTPQAKADLQLLVSKKSGWYIDLLQSGEKATAAGLVINGIAYFTTYTPAPDGTIIDC
KPPEGSGWLYAVDLALGIRKNLYLQDVRDDDNRVYKINNDWLGAPTLIVIPESDGDPTTV
DKAKGDIIVGDEVINVGFSLGTTRTYLYSTENQ
NT seq
3702 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaggcattgaggaaatgtatgaggattataaaatgaataattttttagcgaaaagc
ctgttggcgttaatgctcgctacagcatctgatataacgttaagtgaagatattgatctt
tatattagtgatgttgttcgacaggctggtaagagtactaaggtactgattatttttgat
acttcaggcagtatgggtgatgtgcatacggtatcagctaaatttgaccctgaactaaca
tatccggcaactgattcagctcatgcttatctggatcgagccctatattttaataagggt
ggaattgataataacaccacaattcctagccaccacaatgatgctcgcaggtttgatgct
gttattaatagctgtaaaaagtcaatagatattttagctgtcgaaggttactatactggt
catattcgagaatatacctataaggggcacaagggtacttggggtgaaattcgcgataat
aacagcttaagtggtattgaaataatagactgtgaagatgatgcttatataattgatagt
gaaggcgttgttgatctcgggtctacatataatgccgaaggcctgcttcctggctatccc
gtgaacgatctaggcactaaaaaatcccccatatcccataacccgctgaagaccaccact
aatgttgactgggcttcagcgagttatgttaccttatatacggctaaatatctacgctgg
tatcacggtcaaactgtgggtaatcttacagaaacgcttatggatacagccataacaagt
atcagcggtgttataaagaccactccgtcagttgacttcggtctagagttatttaacttt
aatgccggtgatggtagtgctagtggtaatggaggccgtattgttttaggcatccaaaaa
atgactacatccaataaggccgatttactcaacattataaataaccaaataactccgaat
ggagcaaccccgctttgtgaatctgtttatgaagcctcacaatattttgctggtgcaggg
gtagagttcggtgatgatgatatcaattatccttcttataattatcataaaaacataccg
ccaccggacaccgatatcgtcaagtcaaacggtgattatctcagtcctttcaataactgt
gcttcgagtattgctcatattattctgatcactgatggtgtaccgactaatgatcataga
gcggatagtaaaattactgctctgaagaccaaagtgctgcgtgttgatagcaatggcact
cctgtttatgatgccaatggtcagcctatttatgatgataaaaatttcattggaagctca
taccattggaataactatagtaaggatgatagttacttaccagcgctagcaggctggatg
agtgaatacgatataaatacaaatttagatggtaagcaaacggtagttactcataccatt
ggctttagtggtggtgcggatgctgcaagatctttactagtagaaacagcaagacaaggt
aaaggggaatatttccatgctgatagtggtttgcaactaacacaagctttaatcagtatt
cttaatagattaccgcaatctaatgatcgtttggcttcagcctcggtggcggctaacagc
tttgatagaacacaaacccttgattctgtttattatgctatgtttgaaccgcaaactggg
gctcgttggcaggggaatttgaaaaaatataaagtcaaggatggcaaaataaccggcgtg
ggtggtactgaggcaatttgtgaagttaatgatcgcaacacattttgtcaaaatgcacaa
agtttttggtcacctcaagttgatggtgatattgttggtaaaggaggtgtggtggcgtgg
tttaatagtcaaaaaccaagtgatagaacgctttacatggatggtggcgtcgggtcctta
attacatttgaccggacaaaccttgaggctgcttttactgatgccgataccggcgtggtg
agtttggccgctatgttgggggtggctgatcttgttgacagtaatggtgactcgattgaa
agcgccgctgttgatgagatgcttgcttgggcaaccggtgctgatgttgatgatgagaac
aatgacaacgaatttgatgacatgcgagccgatgtttttggtgacccactacactccaaa
cctttagtggttaactatggaacgagtatacgtattgtgattggtactaactcaggtgcc
ttgcatatgtttaaagatagtggtgccacagtagaagaaagttgggcatttatgccaaaa
gaattcatccataatataaaacctttacgtgataattacgcatcttcgaataaagtctac
ggtattgatggtgaaattacattgcatttatatgataaaaatggcaatggtaaaatagac
agcggcaccgataaagcatggattttctttggtttacgccgagggggcagctcatattat
gctttagatattaccacaccagatgcacctaagttgatgtggcatattgatagtggtaca
gatggttttgaggaacttggtcaatcttggtcacaacctaaagtcggttattcagcactt
aatacttcaggtgacactgctagccccgtgctctttattggtggtggttatgatgttaat
aaagatagtgacggcttagcaacttctgatactaaaggtcgagcaatttacatgcttgac
gcagaaaccggcaacatattgtggagtgcgttacctcagaatggtactacagtctttcca
ggctctcatagtatagcttctgctatcggcttgcttgatagtaccggtaatggcttagtt
gatcgcttatatattggagatacgggtggtagtatctggcgagttgatatgccagatgat
gaaacaaagcatatttcagtatttgagttggctacatttggggggggagatgatgatcag
cgcttcttttatgagccgacaattgtgcgagcacttatttctgaaattatagaaacagag
gtttctgatggtcaaggcggtaaaaaaactatcacagttcatcaagagatcccttatgat
gctgttttaattggctcaggagatagatcagaccctttaggtactgatacttcggacact
ctctatatgattaaggacagtaatataatcactcaaacattttctgatagtagtactcct
ccggtccctacggcaggatttactaaagatgatttatatccctatacctatgatcctttt
ggaaatgcttccaccccacaagcaaaagcagacttgcaactgttggtaagtaaaaaatcg
ggttggtatatcgatttattacaaagtggtgaaaaagccactgcagcggggttagttatt
aatggcattgcttattttactacttacacgcctgcgcctgatggaactattattgattgt
aaaccaccggaaggaagtggatggttatatgcggtagatcttgccttaggtattagaaag
aacttgtaccttcaagatgtgcgtgatgatgataaccgtgtttataaaatcaataatgac
tggttgggagcgcctactttaattgtgatacctgaaagtgatggtgacccaacgacagtg
gataaagctaaaggagatattattgttggtgatgaggtcattaatgtaggtttttcttta
ggaactacacgcacctatctttatagtacggagaaccaataa
DBGET
integrated database retrieval system