Colwellia sp. MT41: CMT41_18035
Help
Entry
CMT41_18035 CDS
T04159
Name
(GenBank) sensory box protein
Organism
com
Colwellia sp. MT41
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
Reg_prop
PAS_3
Y_Y_Y
SGL
PAS
PAS_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALO36429
UniProt:
A0A0S2JKA6
LinkDB
All DBs
Position
complement(4256792..4261366)
Genome browser
AA seq
1524 aa
AA seq
DB search
MFKTLLITLLLILSVLLTIFMVPTSYAAIKNLSLDHLSVDDGLSQGSIHAIIQDKTGFIW
LATENGVNIYDGNKVRQLPGPNNSFEDVAIYTLLEDKNGLIWLNVDGRKLYSYNPKTNIY
RHIPIKSSPNSNYYIADLLNSNDNKIWLLTSKTLGFYNQVTNEYQQVIDLAAELAGDLAL
FKMSLHDGVMYIGSKVGIFAYNIEKNHWKKLPQIPADITAQSNTEELNKIYTVHADINQT
LYLGSYDGFFAINVTDIKAYITGESSLPNYQRLIENMAAWQTLSDGNTLYIAADKGLYSI
NTVDNSSEFLFGFSDYFDNISDDNIPTLIKDNQGVFWLGSRAMGAYQWNPRRELVKNYGY
KKNNAASLSYNEVWHTLPDDLNDDFLWVATSNGLNLIDLAKQRVTRYLVNNDSKSIYTKS
HIYSLLGLTAEQLLISTAKGVYLFDKQQGIELELPFNNEINQLLAVEQYDILKEDEFLWL
VNEKGLFKINLSTNEIDTLSEISEQFPPEKLLALLGTLPNSDWFLLTSNDGLWGFNANTR
EFVQLYKLSGILPGEYTSIDNWAIDKNQILWLSFSGKGLVGLTLPDFKEQYFYHKGNSII
GNNIYGVMADEAGDIWFSSHNGLFMLDSNSQNISHFTRKDGLGATEFNGRAYAKLPNGRF
VYGSMEGISIFEPLKLKKVHHSENFNVKVTAVALLSRKLALPLTIEDNAVINLHYDDVGI
RIDFSTFSYGNEKNISYKYHVTGINNIDYPATREGHITFPSLASGKHTLSIQAKSPYSGE
YSTPVHINFNVSFAPWRSPLALAFYFMVFLLMTLTWYRYRKGQQQLLLDAHEQVKYRENR
LQLALTGSNSEVWDWQADENLMFGKRIVLDLGYKEEALFYSFSKHVALIHPEDHDDFLRS
WQLFISSASLEDNFSCTYRLKTADGQWLWYKDLGKTVAVDANNNPIRVTGSYTNITKSRA
NEERAQYYGDAFQQTQDWVFIIDEKISKVTANKSMRVVFDWPEEEFDFNAKLLGISQKRR
SFYHKLMLSLNEGEHWRGEELIETPNKGEYHVIINVTVGRNSVSNALHYLFVLTDISAQK
SAENELRLLANYDHLTGLPNRTLLLERIKHAIDFSHRKTKSLALFFIDLDRFKQVNDSLG
HDKGDLLLQEITKRLEDVLRIDDTVARIGGDEFVVLLESFANNNQLGSIAEKIIGVIGNP
VDLDKNIVSVGASIGIALYPNDGHNSDELLRHADVAMYHAKQAGKNNFKFYTAQMNIDAM
ERLSKESALKLAVKNKEFINHYQPIIDAHTGKAVGVEMLMRWQTPTGLVPPNDFIPLSEE
LNLIITMTESALQQACKHLKEWHAIRADFYVSINLSVQHFVEADIVSYIRELLADYQLPA
KSLRVEITESTLILQPENAITTMRKLSELGVILALDDFGTGFSSLSYLKQLPLDIIKIDR
SFVAGIGINEADEAIVDTTLVLAKRLNMYCIAEGVETVEQLHYLVAKQCHYIQGYLYSKP
IPPEKIMQNLLLNKTEIISTTRGF
NT seq
4575 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaagacgttacttattaccctgttattaatattaagtgtattacttaccattttc
atggtgccaaccagttatgccgcaataaaaaatctctccttagaccacctatctgttgat
gatggtttatcacagggtagtattcatgcaattatccaagataaaaccggtttcatatgg
ctagccacagaaaatggcgtcaatatttatgatggtaataaagttaggcaattacctggg
ccaaataatagttttgaagatgttgctatctatacgttacttgaagataaaaatggtttg
atttggttaaatgttgatggtcgaaaactttatagctataaccctaaaactaatatctat
cgacatataccaataaaaagctcgcccaattcaaactattatattgctgatctgcttaac
agtaatgacaataaaatatggctattaacctctaaaacactcgggttttataatcaagtt
accaatgaataccagcaagtaatagacttggcagcagaattagccggtgaccttgcatta
tttaaaatgtcattgcatgatggtgtgatgtatataggctcaaaggtaggcatttttgcc
tataatattgagaaaaatcactggaaaaaattacctcaaatacccgctgatatcactgca
cagtcgaacactgaagagctcaacaaaatatataccgtacacgcggatattaatcagacc
ttatacctaggctcttacgatgggttttttgctatcaatgtcactgatattaaagcatat
attaccggcgaatcatcattacctaactaccaacgacttattgaaaatatggcggcatgg
caaacattgtctgatggcaatactctttatatagctgctgataaaggtttgtattcgatc
aatacagtcgataatagcagtgaatttttgtttggttttagtgattattttgacaatatc
agtgatgacaacataccaaccttgattaaagataatcaaggtgttttttggttaggttca
agggctatgggtgcctatcaatggaatcccagaagagaattagttaaaaattacggttat
aaaaaaaataatgcagctagtttaagttataacgaagtttggcatactttacctgatgac
ttaaatgatgattttctctgggttgcaacgtctaatggtttgaatctaattgatttggca
aaacagcgtgttacccgatacttagtgaataatgactctaaaagtatatacaccaaaagt
catatttatagcctgttaggtttgacagctgagcaactacttatttctactgctaaaggt
gtgtatttatttgataaacagcaagggatagaattagaattaccctttaataatgaaatt
aatcaactgcttgcagtggaacagtatgacatattaaaagaagacgaatttctttggtta
gtaaatgaaaaaggactctttaaaataaatttaagcaccaatgaaatagatactttaagt
gaaatttccgaacagttccctcctgaaaaattattggctttattaggtacattaccgaat
agtgattggtttttactaacaagcaatgatggtttatggggttttaatgcgaatacacga
gagtttgtacagctttataagttgtcaggcatattgcccggagaatatacctctatcgat
aactgggccatagataaaaatcaaatattatggttgagttttagtggtaaaggtctggtt
ggtttaaccttgcctgactttaaagagcaatatttctaccataaaggcaattctattatt
ggtaataatatttacggtgtaatggccgatgaggcaggagatatctggttctctagccat
aatggtttatttatgttggactccaatagtcaaaatatcagtcatttcacccgtaaagat
ggccttggcgcaactgaatttaatggtagggcttatgcaaaattacccaatggtcgtttt
gtctatggttcaatggaaggtattagtattttcgagccgttaaaactaaaaaaagtacac
catagcgaaaactttaacgtcaaagtgaccgctgtagcattgttatcccgcaagttagcc
ctacctttgaccattgaagataatgccgttattaaccttcactatgatgatgtaggtatt
cgcattgatttttccaccttttcttatggcaatgagaaaaacatcagttataagtatcat
gtgacggggataaataatattgactaccccgcaactagagaaggccatattacctttcct
agcctagcatcaggcaaacataccttatctattcaggctaagtcaccctactcgggagaa
tattcaacgcccgtacatattaactttaacgtcagctttgctccttggcgttcacctttg
gcattggctttttatttcatggtgttcctactaatgacgctaacttggtatcgttatcgt
aaaggccagcaacagttgttgcttgatgcgcatgagcaagttaagtatcgagaaaatcgt
ttacaactagccttaacgggtagtaatagtgaggtttgggactggcaagctgatgaaaat
ctaatgttcggtaaacgcattgtgttagatttaggctacaaagaagaagcgttattttat
agtttttcaaagcatgttgcccttattcatcctgaggatcatgatgattttcttcgtagc
tggcaattatttattagcagcgccagtttagaggataacttttcttgtacctatcgtttg
aaaacagcagatggtcagtggctttggtacaaagacttaggaaaaacagtcgcggtagat
gctaataataaccccattagagttactggttcttatactaatattaccaagtctcgtgct
aacgaagagcgcgcgcaatattacggtgatgcatttcagcaaactcaagactgggtattt
attattgatgaaaaaatatcgaaagtaacggcaaacaaatcaatgcgagttgtttttgat
tggcccgaagaagagtttgattttaatgcgaaattattaggtattagtcaaaaacgccgc
agtttctaccataaattaatgctgtctttaaatgaaggcgaacattggcgtggcgaggag
ttaatcgagacccctaataagggcgagtaccacgttattatcaatgtgacggtaggtcga
aactcagtgagtaacgctttgcattatttgtttgtattaactgatattagtgcacaaaaa
agtgccgaaaatgaattaaggttattagcaaattatgatcatttaacggggttgcctaat
cgtactttattgcttgaacgtattaaacatgcaatagacttttcccaccgaaaaacaaaa
tcattggcactgttttttatcgatttagatcgctttaaacaagtgaatgattccttaggg
catgataaaggtgatttgttgttgcaagaaattactaagcgtttagaagatgtcttacga
atagatgatacggtggcacgtattggtggtgatgaatttgttgttctattggagagcttt
gctaataataatcaactgggcagcatagctgaaaaaattattggtgtcattggtaacccc
gtagatttagataagaatattgtcagtgttggcgccagtattggtattgctttatatcct
aatgatggtcataactcagacgagctgttacgccatgctgatgttgctatgtatcatgcc
aagcaagcagggaaaaataactttaagttttatactgcacaaatgaacattgatgccatg
gagcgcttaagtaaggagtcggcgttaaaattagcggtaaaaaataaggagttcattaat
cactaccaaccaataattgatgcacataccggtaaggcggtaggtgtagagatgttaatg
cgttggcaaacaccgacgggtttagtgccacctaatgactttattcctttatcagaggag
ctaaatttaattatcactatgacagagtctgcacttcaacaggcttgtaaacatctaaaa
gagtggcatgccatacgagcagatttttacgtgtcgataaacctttcggtacaacacttt
gttgaagcggacattgtttcatatattcgtgaattattggccgattaccaattgccagcc
aaaagtttacgcgttgaaataacagaaagtacgttaattttacaacctgaaaatgccata
accactatgcgtaaattatcggaacttggcgtgattttagcgctagatgactttggcaca
ggcttctcgtcattatcttatttaaaacaattacccttagatatcataaaaatagatcgc
agttttgttgctggtattggcattaatgaagccgatgaagcgattgttgataccacgtta
gttttagccaaaaggcttaacatgtactgcattgctgagggtgtggaaacggttgagcag
ttgcactatctagttgccaaacaatgccattatatacaagggtatttatatagtaagcca
ataccgccggagaaaattatgcaaaatctgttgttaaataaaacagaaattatctctact
actcggggtttttga
DBGET
integrated database retrieval system
