Cellulophaga omnivescoria: PBN93_02590
Help
Entry
PBN93_02590 CDS
T08738
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
comn
Cellulophaga omnivescoria
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBU89917
LinkDB
All DBs
Position
complement(594349..598944)
Genome browser
AA seq
1531 aa
AA seq
DB search
MENFTLVLSRSFNKKKAPLFTFLLVFIFSTLTVHANFGPGVDTDGDGVFDHIDIDDDNDG
IIDTIEGDGDVDKDGIPNRLDIDSDNDGILDNIEAQLSVGYIAPSGIDSDGNGLDDAYEE
TPGSCGGLTPIDTDGDTRKDYLDIDSDNDGILDNVEAQTTKEFTPPCGMDSAPKNGLDDH
YEDYCGTGQGITPVDTDGDSHPDFRDIDSDDDGIIDNIEAQTTDGYIAPKGKDANCDGLD
DAYQSCPGLGLTPVDTDGDKKPDFRDIDSDNDGITDNTEAQGGNAIISPCSCDTDGNGLD
DAYETTPGSGEGITPTNSDSDSNSDFRDIDADNDGIPDNVEGQTTDGYIAPSGNDSDMDG
LDDAYEGSGDEGITPNNHDGEDTPDYIDLDSDNDTVPDNNEGNDFNFDGEPDQTFTGVDT
DGDGLDDGYEGTDVNDGFDVNDEINDPANDLPDTDGTEDVNYRDLDDDGDGINTPDEDAD
GNGDPTNDDTDGDGTPDYLDPTDDRKDTDGDGVPDAVDLDDDNDGILDAVEDPNLDGDND
PLTDPLDTDGDGIPNHLDIDADDDGIPDNVEGQTTDGYIAPSGNDSDMDGLDDAYEGSGD
EGITPNNHDGEDTPDYIDLDSDNDTVPDNNEGNDFNFDGEPDQTFTGVDTDGDGLDDGYE
GTDVNDGFDVNDEINDPANDLPDTDGTEDVNYRDLDDDGDGINTPDEDADGNGDPTNDDT
DGDGTPDYLDPTDDRKDTDGDGVPDAVDLDDDNDGILDAVEDPNLDGDNDPLTDPLDTDG
DGIPNHLDIDADNDGIPDNVEGQTTDDYIAPSGNDSDMDGLDDAYEGSGDEGITPNNHDG
EDTPDYIDLDSDNDTVPDNNEGNDFNFDGEPDQTFTGVDTDGDGLDDGYEGTDVNDGFDV
NDEINDPANDLPDTDGTEDVNYRDLDDDGDGINTPDEDADGDGDPTNDDTDGDGTPDYLD
PTDDRKDTDGDGVPDAVDLDDDNDGILDAVEDPNLDGDNDPLTDPLDTDGDGIPNHLDID
ADNDGIPDNVEGQTTDGYVAPSGNDSDMDGLDDAYEGSGDEGITPNNHDGEDTPDYIDLD
SDNDTVPDNNEGNDFNFDGEPDQTFTGVDTDGDGLDDGYEGTDVNDGFDVNDEINDPAND
LPDTDGTEDVNYRDLDDDGDGINTPDEDADGDGDPTNDDTDGDGTPDYLDPTDNTPGTDT
DGDGVPDAVDLDDDNDGILDTVEDENIDEDNDPLTNPTDTDGDGIPNHLDIDADDDGIPD
NVEAQTTAGYIAANNDDAATYLANDGVNSAYLGGLTPNNHDGEDTPDYIDLDSDNDTVPD
NNEGNDFDFDGIPDQQYTTIDTDGDGLDDGYEGTDVNDGFDVNDEINDPANDLPDTDGTE
DVNYRDLDDDGDGINTPDEDADGDGDPTNDDTDGDGTPDYLDNMDDSTPDENAVVVMQMV
TPNSDGKNDFLWIDNVDLVPNNSLKIYNRWGIAVFEADGYNNINNVFDGKSKGRSTVKAG
EVLPSGVYYYIFNYEQNGNNNTDSGYLYVSK
NT seq
4596 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaactttactttagtattaagcaggtcttttaataaaaaaaaggcacctctgttt
acgtttttacttgtatttatattctctacattaactgtacacgccaactttggtcctggt
gtagatacagatggtgatggcgtttttgatcacatcgatattgatgatgataatgacgga
attattgatacgatagaaggagatggagatgtagataaggatggaatacctaatagatta
gatattgattctgataacgatggtattttagataacattgaagcacaattatcagttggt
tatattgctccaagtggtatagattctgacggtaatggtttagatgatgcttacgaagaa
acaccaggaagctgtggtggtttaacacctatagatacagatggtgatactagaaaagat
tatttagatatagattctgacaatgacggaattttagataatgttgaagctcaaactaca
aaagaattcaccccgccttgtggtatggattctgctccaaaaaatggactagacgaccat
tatgaagattattgtggtacaggacaaggaattactcctgtagacacagatggagattct
cacccagactttagagacatagattctgacgatgatggtattatagataatattgaggca
caaacaacagatggttacatcgctccaaagggtaaagatgcaaattgtgatggtttagat
gatgcgtaccagagttgcccaggattggggttaactcctgttgatacagacggagataag
aagccggattttagagatatagattctgataatgatggaattacagataatactgaggct
caaggaggtaatgcaataattagcccttgttcttgtgatacagatggtaatggtttagat
gatgcttatgaaactacgcctggatcaggcgaaggtataacaccaacaaattcagattca
gattctaattcagactttagagacatagacgcagataacgacggtattccagacaacgta
gaaggtcaaacaaccgacggttacatagcaccaagcggaaacgattcagatatggatggt
ttagatgatgcttatgaaggatcaggagacgaaggaattacaccaaacaatcacgatggt
gaggatacaccagattatattgatttggatagtgataatgacacagtaccagataacaat
gagggtaacgactttaattttgacggagaaccagaccaaacatttacaggagtagataca
gatggagatggtttagatgatggttatgaaggaacagatgtaaacgatggttttgatgtt
aatgatgaaattaacgatccagcaaacgatttaccagatacagacggtactgaagatgta
aactacagagatttagatgacgacggagacggcataaatacaccagatgaagatgcagat
ggtaatggtgacccaactaacgatgatacagatggtgatggtacaccagattatttagat
cctacagatgatagaaaagatacagatggagatggtgttccagatgctgtagatttagat
gatgataatgatggtattttagatgcagtagaggatccaaacttagatggcgataatgat
ccgttaacagatccacttgatacagacggagacggtataccaaatcatttagatatagat
gctgacgatgacggtattcctgataacgtagaaggtcaaacaaccgatggttacatagca
ccaagcggaaacgattcagatatggatggtttagatgatgcttatgaaggctcaggagac
gaaggaattacaccaaacaatcacgatggtgaggatacaccagattatattgatttggat
agtgataatgacacagtaccagataacaatgagggtaacgactttaattttgacggagaa
ccagaccaaacatttacaggagtagatacagacggagatggtttagatgatggttatgaa
ggaacagatgtaaacgatggttttgatgttaatgatgaaattaacgatccagcaaacgat
ttaccagatacagacggtactgaagatgtaaactacagagatttagatgatgacggagat
ggcataaatacaccagatgaagatgcagatggtaatggtgatccaactaacgatgataca
gatggtgacggtactccagattatttagatcctacagatgatagaaaagatacagatgga
gatggtgttccagatgctgtagatttagatgatgataatgatggtattttagatgcagta
gaggatccaaacttagatggcgataatgatccgttaacagatccacttgatacagacgga
gacggtataccaaatcatttagatatagatgcagataacgatggtattccagataacgta
gaaggtcaaacaactgatgattacatagcaccaagcggaaacgattcagatatggatggt
ttagatgatgcttatgaaggatcaggagacgaaggaattacaccaaacaatcacgatggt
gaggatacaccagattatattgatttggatagtgataatgacacagtaccagataacaat
gagggtaacgactttaattttgacggagaaccagaccaaacatttacaggagtagataca
gatggagatggtttagatgatggttatgaaggaacagatgtaaacgatggttttgatgtt
aatgatgaaattaacgatccagcaaacgatttaccagatacagacggtactgaagatgta
aactacagagatttagatgacgacggagatggcataaatacaccagatgaagatgcagat
ggtgatggtgacccaactaacgatgatacagatggtgacggtactccagattatttagat
cctacagatgatagaaaagatacagatggcgatggtgttccagatgctgtagatttagat
gatgataatgatggtattttggatgcagtagaggatccaaacttagatggcgataatgat
ccgttaacagatccacttgatacagacggagacggtataccaaatcatttagatatcgat
gcagataacgatggtattccagataacgtagaaggtcaaacaactgatggttatgtagca
ccaagcggaaacgattcagatatggatggtttagatgatgcttatgaaggatcaggagac
gaaggaattacaccaaacaatcacgatggtgaggatacaccagattatattgatttggat
agtgataatgacacagtaccagataacaatgagggtaacgactttaattttgacggagaa
ccagaccaaacatttacaggagtagatacagatggagatggtttagatgatggttatgaa
ggaacagatgtaaacgatggttttgatgttaatgatgaaattaacgatccagcaaacgat
ttaccagatacagacggtactgaagatgtaaactacagagatttagatgacgacggagat
ggcataaatacaccagatgaagatgcagatggtgatggtgacccaactaacgatgataca
gatggtgatggtacaccagattatttagatcctacagataatacacctggtacagataca
gatggagatggtgttccagatgctgtagatttagatgatgataatgatggtattttagac
acagtagaagatgaaaatatcgatgaagataatgatcctttaactaaccctacagataca
gacggagacggtataccaaatcatttagatatagatgctgacgatgacggtattcctgat
aacgtagaagcgcaaacaacagctggttatattgctgctaataatgatgatgccgcgact
tacttagctaatgatggtgtaaatagcgcatacttaggtggcttaacaccaaataatcac
gatggtgaggatacgccagattatattgatttggatagtgataatgacacagtgccagat
aataatgagggtaacgattttgattttgatggaattccagatcaacagtatactactata
gatacagacggagatggtttagatgatggttatgaaggaacagatgtaaacgatggtttt
gatgttaatgatgaaattaacgatccagcaaacgatttaccagatacagacggtacagaa
gatgtaaactacagagatttagatgacgatggagatggcataaacacaccagatgaagat
gcagatggtgatggtgacccaactaatgatgatacagatggtgatggtactccagattat
ttagataatatggatgatagtacacctgatgaaaatgctgtagttgttatgcaaatggta
acaccaaatagtgatggaaaaaatgatttcctttggatagataacgtagacttagttcct
aacaattccttaaaaatttacaacagatggggtattgctgtttttgaagcagatggatac
aataacattaacaatgtttttgatggtaaatctaaaggtagatctacagtaaaggctggt
gaagttttaccttcgggagtttattactatatcttcaactacgagcaaaatgggaataac
aatacagatagtggttatctatacgtaagtaaataa
DBGET
integrated database retrieval system