Cellulophaga omnivescoria: PBN93_11655
Help
Entry
PBN93_11655 CDS
T08738
Name
(GenBank) LacI family DNA-binding transcriptional regulator
Organism
comn
Cellulophaga omnivescoria
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Peripla_BP_1
Peripla_BP_4
Peripla_BP_3
LacI
HTH_5
HD_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBU88526
LinkDB
All DBs
Position
complement(2598886..2599872)
Genome browser
AA seq
328 aa
AA seq
DB search
MIHTRPTLSQISKALDLSISTISKSLSDSPEISISTKQKVQEFARKCNYRPNSFAASLRR
GYTKNIGLIIPSVLNPFYAKVLVGIEKYLDENDYKLFTSISNESAEKESHYLSFLGSGYV
DGVIICVSKETAITNNYQHINTLITEGTPLVLFDRISNLKKCDSVVIDDYKASFKATEHL
INNKKCKKPIMVTLINQLEHGKLRASGFIDALKKHNIPTEKSIIAAANIDELATKIKLAL
QQNKADGIYGANDLALVQAMTIGNTLHTNKIAYTGFCNNSKTGWNTALKIINQNAEKMGK
EAAKLVLERIKTKNNKEFYTRTITTEFV
NT seq
987 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatacacaccagaccaacattatcacaaatatctaaagccttagacttatctatttct
accatttctaagtcgttatctgatagtcctgaaataagtattagcaccaaacaaaaggta
caagaatttgctcgtaaatgtaattacaggcctaatagttttgccgccagtttaagaaga
ggatatactaaaaatattggtttaattataccaagtgtattaaacccgttttatgcaaaa
gttttggttggtatagaaaaatatttagatgaaaacgattataaactgtttacaagcatt
agcaatgagtctgcagaaaaggaatctcattatttaagttttttaggcagtggttatgta
gacggcgtaattatttgcgtatctaaagaaactgcaattaccaacaattaccaacatatt
aacactcttattacagaaggcacaccactggttttgtttgacaggattagcaatttaaaa
aaatgtgatagtgtagttattgacgactacaaagcatcctttaaagcaaccgaacattta
attaataataaaaagtgtaaaaaaccaataatggttactttaataaaccagttagagcat
ggcaaattaagagcaagcggttttatagatgctttaaaaaaacacaacatacctacagaa
aaaagtattattgctgctgccaatatagatgaattagccactaaaataaaacttgcatta
cagcaaaataaagctgatggtatttacggtgctaatgatttagctttagtacaagctatg
acaattggtaacaccttacatactaataaaattgcatatactggtttttgcaataattct
aaaacaggatggaatactgctttaaaaattataaatcagaatgcagaaaaaatgggaaaa
gaggccgccaaattggttttagagcgcataaaaacaaaaaataataaagaattttataca
agaacaataacaacagaatttgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system