Cellulophaga omnivescoria: PBN93_16040
Help
Entry
PBN93_16040 CDS
T08738
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
comn
Cellulophaga omnivescoria
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
comn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
comn02000
]
PBN93_16040
Transporters [BR:
comn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PBN93_16040
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBU89369
LinkDB
All DBs
Position
complement(3634649..3637684)
Genome browser
AA seq
1011 aa
AA seq
DB search
MKTKLSLLFTFCFCLVSFAQQNNVSGTITEQGTGFPIPGVSIIIKNTIKGVVSDFDGNYT
ITNVPENAILQFSYLGYVTQEIKITNQQTLNVVLTEDVSKLDEVVVIGYGGQKKKDITGA
VSIVSSETIEELRPVDAAQALQGTSAGVSVTAPSGSPGGQFNITIRGVNSNGDNGPLVII
DGYKGDLNSINPSDIESFSILKDAQAAIYGIEGANGVVLVTTKSGRKNSALKISYNGYTG
IQQTTRQLPYLNATEYALLLNESYAANGQDLPYADVSNLGTGTDWQDELFESAPITNHNI
SLTGGGEKNTYYFGGSILEQDGIIASDKSNFTRANVKVKLGFDVTDKLKFTTSANYFNNV
RKTIGENALGSPLFNALNYAPTYTLDQEDASGFLGNEVINPLSQIANTYNKYNGNSIEGT
FQLDYEPLDGLKITSRIGLKSYNDTQKSFAPIVNYGSGKVFNTDRSSVTQTKNTNNSYTW
DTFITYNRTFAENHNATVTLGTSAQRAWGDNLQGTGFDVPNNSWEFADISLANGLSEAKS
TSSYIYDSRLSSFFTRLQYDYKGKYLLSAMVRRDGTSDFSPSNRIDYFSSATAGWIVSDE
AFLEDSDVINFLKLRASYGSLGNNVGVDLYRALLSGEATYVLNNGLVTGTANGRIPNPEA
TWETADKLDIGLDLNLFNNKLQFTADYFVEDRNDLLIANFPVSGILGASAPGAGLPTVNA
GTTRTKGVEFFVNYKESFSDNLSVDLSYNVTKVNGEVTSVNNDIVSEGGSFSVGQPAITR
MEVGQPIGYFYGLKTDGVFQNQAEVNAAPSQEGLGSAAAPGDLKYVDTNNDGEITIADRT
YLGKAQADYIMGLNLRVKYKNLDFGTYMYAELGKEMVRNYERDQPNINRSSLYLNRWTGE
GTSNTVPRATIGATTNRLFSDFFVEDASFLRIQNIQLGYTLPDEFLQKIGVSKLRIYGSV
NNAFTFTKYNGYDPAAQGVNQNGNLDVFSSGIDYGFYPVSRQFILGLNLSI
NT seq
3036 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaaaacttagcttattatttaccttttgtttttgtctcgtatcctttgcacaa
caaaacaatgtttcgggtacaattacagaacaaggaacaggtttccccattcctggagta
agtataattattaaaaatactattaagggagtggtatcagattttgatggaaattacacc
attactaatgtgccagaaaatgcaattcttcagtttagttatttggggtatgttacccaa
gaaattaaaataactaaccaacaaacgttaaatgttgttttaacagaagacgtttctaag
ttagatgaagttgttgttattggttatggaggccaaaaaaagaaagacattacaggagcc
gtttctattgtaagttcagaaacaatagaagaacttagacctgtagatgcagcacaagca
ttacaaggtacatctgctggtgtatctgtaacggcaccatctggttctcctggtgggcaa
tttaatattactattagaggtgtaaactctaacggagacaatggtcctttggtaattata
gatggttataaaggagatttaaacagtattaatccaagtgatattgagtctttttcaata
ttaaaagatgcacaagctgccatttatggtatagaaggtgcaaacggagttgtacttgtt
actactaaaagtggtagaaaaaactctgcgcttaaaattagttacaacggttatactggt
atacaacaaactaccagacaattaccgtatttaaatgcaacagaatacgcattgttatta
aatgagagctatgctgcaaatggtcaagatttgccgtatgcagatgtaagtaatttaggc
actggtacagattggcaagatgagttgtttgagtctgcaccaattaccaaccataacata
tcacttacaggtggtggcgaaaaaaacacctattattttggtggttctattttagagcaa
gatggtattattgctagtgataaatctaattttactagagcaaacgttaaagttaaattg
ggttttgatgttacagataaattaaaatttaccacatctgctaactattttaataatgtt
agaaaaacaataggagaaaatgcattagggtctcctttatttaacgcgcttaactatgca
ccaacgtacactttagatcaagaagatgcatcaggctttttaggtaatgaggttataaac
cctttatcacaaatagcaaatacctacaacaagtataacggtaattctatagaaggtact
tttcagttagattatgaacctttagacggattaaaaattacttctcgtataggtttaaaa
tcatataatgatacgcaaaaatcatttgcaccaattgtaaactatggttctggtaaagtt
tttaatacagaccgtagtagtgttacacaaacaaaaaacaccaacaactcatacacttgg
gacacttttattacttacaacaggacttttgcagaaaatcataacgctacagttactttg
ggtacaagtgcacaaagagcttggggagataatttacaaggtaccggttttgatgtgcct
aacaactcttgggagtttgcagacatatcattagcaaatggtttaagcgaagcaaaatct
acaagttcttatatttatgattctagattatcatcattctttacaaggttacagtatgat
tataaaggaaaatatttactttctgcaatggtgcgtagagatggtacatcagacttttca
ccaagtaacagaatagattatttttcttctgctacagcaggttggatagtttcagatgaa
gctttcttagaagattcagacgttataaactttttaaagcttagagctagttatggctct
ttgggtaacaatgtgggagtagatctttatagagcattacttagtggtgaggctacttat
gttttaaataatggtttagtaactggtacagcaaacggaagaattcctaaccctgaagct
acttgggaaactgcagataaattagatattggtttagatttaaacttgtttaacaataaa
ttacagtttactgcagattattttgtagaagaccgtaatgatttattaatagcaaacttt
cctgtgtctggtatattgggagcttctgctcctggtgcaggtttaccaacggttaatgct
ggtactacacgtacaaaaggtgttgagttttttgtaaactacaaagagagtttttcagat
aacctatctgtagaccttagttataatgttactaaagtaaatggcgaggtaacatctgta
aacaatgatattgtatcagaaggtggttcttttagtgttggccagcctgcaattacacgt
atggaagttggccagcctattggttatttttatggacttaaaacagatggtgtttttcaa
aaccaggcagaggtaaatgcagcaccatcacaagaaggtttaggttctgctgctgctcct
ggagatttaaaatatgtagataccaataatgatggtgaaattaccattgcagacagaaca
tatttaggaaaagcacaggcagattacataatgggactaaatttaagagttaagtacaaa
aatttagattttggaacctatatgtatgcagagttaggtaaagaaatggttcgtaattat
gaaagagatcaacctaacataaacagatctagtctttatttaaatagatggacaggagaa
ggcactagtaatacagtaccaagagcaaccataggagcaactactaacaggttattctca
gacttttttgttgaagatgcatcttttttaagaatacaaaatatacaattaggctacaca
ttaccagatgagtttttacaaaaaataggtgttagcaaattacgtatatatggttctgtt
aacaatgcatttacgtttacaaagtacaatggttatgaccctgctgcgcaaggcgttaat
caaaacggaaatttagatgtattctctagcggaattgattacggattttacccagtttca
agacagtttattttaggtttaaatctttctatataa
DBGET
integrated database retrieval system