Coprobacter secundus subsp. similis: Cop2CBH44_17180
Help
Entry
Cop2CBH44_17180 CDS
T06867
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
copr
Coprobacter secundus subsp. similis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
copr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
copr02000
]
Cop2CBH44_17180
Transporters [BR:
copr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Cop2CBH44_17180
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
FG-GAP_3
CooC_C
Read-through
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCI63365
UniProt:
A0A7G1HUD0
LinkDB
All DBs
Position
complement(2168251..2171418)
Genome browser
AA seq
1055 aa
AA seq
DB search
MKKTHLRGCNFSRSMRTFVFSIRIVTLIAVLGLSLGRAQAADMISVLQQTLGDISGSVLD
KSGEPIIGASVLVKGTTTGTVTDFDGKFILKNVPQNAILVFKYVGMKTIEVPIKGKTLFR
VVLESDAIDIDEVVVVGYGTQKKVNLTGAVSAVKFDEQLSSRSLPNVSMALQGKVPGLAI
SQNSGVAGDKGMTMLIRGMGTVNDANPLIVVDGMPDVDINRLNMDDIESVSVLKDAASSA
VYGSRAANGVILITTKSGKGSKSKINASASYSIGIPVHAWEYMSDYARSLTLLQRNAAVS
TAPDNFRFKNGTIDQWMAMGMIDPLRYPNTDWYDVILRTGGIQKYNISASGSNDKSNYFV
SVGIMDEDGLLMNNDYTQYNARMSYDMKIFPNLTIGTKFSGNWSKMQYANTNDFQGTINA
ASMKFAVAGITPYDPVTGYYGGAMAYGEDSQVFNPYSAYTNQLSQKDRQEANGNISLSWD
IIKGLNARVDYTINYYNQFRYQADIPTRAYDFQKGVLTDRRFVEDNAGVSNYTNTGYKTQ
LNARLGYDVTIKKNHNLSVMAAFSREYWFNRYQMSSAKDRIHSDLHEINATLNVDPSVEG
YSSAQGLMSFIGRINYAAFNKYLFEVNLRSDGSSKFLYGYRYSFFPSGSVGWIFSEEPFI
NRWAGSWLSRAKLRASYGKLGNNSAVGEYEQLETLSSSSYFVNGALIKGLVNKKMINRDL
TWEETAVTNVGLDLGFLKNHLSVEIDYYDRFTTKMIRPSDFSILLSGAYSSPRKNIGNMR
NKGVEVNVTYQGAKGDFNYMVNVNASYNATILEKWNEYLGSNTTYTNKDGNADYVFVGMP
YNYVSAYEAIGIAHTWNDIYNATPQGARPGDLLYKDLNGDGKIDDSDKRVYPRLQRDRPT
TNFALNSNFEWRGIDLSIMFQGAAGRKAFWLPSNNNTSLGNNEGRTATTWDLWNKTWSVE
NRDGGWTRLGGGNNRKESTFYLDNLAYLRLKNVQLGYSIPKSVIQKIRISNIRVFFSADN
LLTFSKFRGLDPEKLNVNDGYPLMKTFTFGLNVEI
NT seq
3168 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaactcatttaagaggctgtaattttagtcgcagtatgaggacttttgttttt
agtatacggattgtgactttgatagcagtattgggattatctttagggagagcacaagca
gcagatatgatatctgttcttcagcagaccttaggagatatatccggttccgttttagat
aagagtggagaacctattatcggggcatcggttctggtaaaaggaacgacgacaggaact
gttacggattttgatggaaaatttatattgaaaaatgttcctcagaatgcaattttggtg
tttaaatatgtgggaatgaaaacgattgaagttccgattaaaggtaagactttatttcgt
gtagttctggagagtgatgcaatagatattgatgaagtggtggtcgttggttatggtacc
cagaagaaagtcaatctgacgggtgccgtatcggcagttaaatttgacgagcagttgtcc
agccgttctttacctaatgtatctatggctctccagggaaaagtccctgggctggcgatt
agtcagaactctggtgttgctggagataaaggaatgactatgttgattcgagggatgggg
acggtaaatgatgccaatcctttgattgtcgtggatggtatgcctgatgtggatattaac
cggttgaatatggatgatatagaaagtgtttcggtgttaaaggatgcagcttcttcggct
gtttatggatcaagagctgcgaatggagttattttgattacgactaaaagtggtaagggc
tcgaaatccaaaattaatgcatcggcatcttattcgatagggatacccgttcatgcttgg
gagtatatgagtgattatgctcgttcgttgactttgttgcaacgaaatgcggcagtctct
actgctcctgataattttcgtttcaaaaatgggacaattgatcaatggatggctatgggt
atgatagaccctttgcgttatcctaatacagattggtatgatgttatcttgcggacagga
ggtatccagaagtataatatttcagcttcaggaagtaatgataaatctaattattttgtt
tccgtagggataatggatgaggatgggcttttaatgaataacgattatactcagtataat
gcgagaatgagttatgatatgaaaatatttcctaatctgacaatcggaacgaaattttca
ggaaactggtcgaaaatgcagtatgctaatacaaatgactttcaaggaacaatcaatgcc
gcttcaatgaaatttgctgttgcgggtattaccccttatgacccggttactggatattat
ggaggtgcaatggcatatggagaagattctcaggtatttaatccttattcggcatataca
aatcaattgtcccaaaaagatcggcaggaagcaaatggtaatatttctttaagttgggat
atcattaaaggtttgaatgccagagtggattatacgattaattactataatcaattccgg
tatcaagccgatattccgacacgagcttatgattttcaaaagggagtattgaccgatcgt
cggtttgtagaggataatgccggtgtttccaattataccaatacaggttataagactcaa
ttaaatgctcgattgggatatgatgtgactattaagaagaatcataatttaagtgttatg
gcggcatttagccgggaatactggttcaatcgttatcaaatgtcgtcagctaaagaccgg
attcattccgacttacatgaaataaatgcgacattaaatgtagacccgtctgtagaagga
tattctagtgcgcaaggattgatgtcttttattggtcgtatcaattatgcagcattcaat
aaatatctttttgaagtgaatcttcgttctgatggttcgtctaagttcttatatggttat
agatatagctttttcccctctggatcggtaggatggatattttcagaagagccatttatt
aatcgttgggctgggtcatggttatcccgggccaaattacgtgcatcttatggaaagttg
ggtaataatagtgccgtaggggagtatgaacaacttgaaacattgagctcgtcttcttat
tttgttaatggagctcttattaaagggctggtgaataagaaaatgattaatcgggatttg
acatgggaagaaactgcagtgacgaatgttggattagacttgggctttttgaaaaatcat
ttatctgtcgaaatagattattatgaccgatttacgacaaaaatgattaggccttctgat
ttttctattcttttatcaggagcttattcttctcctcgtaaaaatattggcaatatgcgt
aataagggagttgaagtaaatgtgacttatcaaggagccaaaggtgattttaattatatg
gtaaatgtaaatgcttcttacaatgcgaccattttggagaagtggaatgaatatttggga
agtaatacgacttatacgaataaagacgggaatgcggattatgtttttgtaggtatgcca
tacaattatgtttcggcttatgaggcaattggaatagcgcatacatggaacgatatttat
aacgccacaccacagggagctcgtcccggagatcttttatataaggatttgaatggagat
ggcaagatagatgatagcgataagagagtttatcctcgcctgcaaagagaccgcccgaca
actaattttgctttgaatagtaattttgagtggagaggcattgatttgtcaattatgttt
caaggtgctgcaggaagaaaagctttttggttaccatccaataataatacgtcattgggt
aacaatgaagggcgaacagccacaacttgggatttgtggaacaagacgtggtcggtggaa
aatagagacggaggatggactcgtttaggtggaggcaataatcgtaaagaatcaactttt
tatcttgataatttagcttatttgagattaaaaaatgtgcagttggggtatagtattcca
aaatctgtaatacaaaaaataagaataagtaatatacgtgtttttttctcagctgataat
cttttgactttttctaaattccggggactagacccagaaaagttaaatgttaatgacggt
tatccattgatgaaaactttcacattcggtctcaatgtcgagatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
