Commensalibacter melissae AMU001: D9V35_02380 Help Entry D9V35_02380       CDS       T05684                                  Name (GenBank) collagen-like protein Organism coq  Commensalibacter melissae AMU001 SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Gp77 Collagen CD1375-like Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AYN86425 LinkDB All DBs Position 495368..499825 Genome browser AA seq 1485 aa AA seqDB search MNCDQGSRIIIVPAGCLGHREIDLQCKSPLESVYYQFSMVNRLSPSDAISCVSAQPSDET LSVDRITVSGQTFRARISGGTMNTKTGIRFLVTTRANEEREFVVTLPIMPEGIMGSGEAG NYVLGDTGPQGPQGCAATVTVGKVLPTEPDGDPKIVNSGTEVDAVLDFTLPRGQVGPQGE RGQAATVKIGNVVTGAAGSDAAVENRGDEHNAVLDFTIPEGRQGIQGIQGKAGTQILLSN RDPVARDAKENIVWLNDVTGDLFETVSRGGDAYSWHKSGNLKGEAGSIIYTGTVDPVYNE VYKKSDLYFNITNSNLFTFNDNQWVRLANLKGDQGERGSLWFFAQEDPVTSSSYRVGDSF LNTASNDLFVFNGTNWQKVGNLQGKQGGIGPQGLQGDTGPQGLQGIQGEKGEAGKDGRDG FDGTRIITSQQDPDQGSAPLNPNVVWINTTSWEVKRTIPHGDSWDWVSLGSIRGPRGGIG PQGLQGDTGPQGLQGIQGEKGEAGKDGRDGFDGTRIITSQQDPDQGSAPLNPNVVWINTT SWEVKRTIPHGDSWDWVSLGSIRGPRGDTGPQGLQGLQGEKGAKGDDGSRWYSGHNLPDA TIGLNDPRGMPRAGDQYLYLDEKTGEASAYIYTNDKTWGGPLGKVAGPQGKAATVRAVEQ VRPLRPDEAATIKNIGDEHDAILQFSIPKGEKGDVGPIGKEGAAATIRIGTVTTTDPDVQ ASVRNSGSENTAVLEFSIPKGEKGDSYTNDGSTELNVKSIQSDGGKVGTDGAGKLSAEML DYTIKVPTPSHQDASLGKVVDKVLNNVSFSTFTNIYQEKKENNDLDVKCVAIGSDREKAI DNWTPLFDKNSRIDGNGIKCFDKETGEWVVPEDGILDINYDIAFGDISGKKYVPIVEAET FFNIDMVINNELNKVNEIIEVVDQQEITSYIKPLKENLDLVSEETKDNQIKVDNKTDLKS FFLKREYPIIDSGNWKTVKIKQGINKGKIAWFDTISNKYLKKAINNDYVFTEEIVEAYAG PVILIDVDVTISSGTEVSGISLLTNVNNERQEPYVLVIEENAKISYSNIFYRNVISRGKS YHNTYSSSMVELYNNAISLKDTLIVVGEVKAKFCSTSKTCTSTKDYSSGDNSFWFGTDGY PIGLKGYNNAEFICPIVPLLSEGSPVSHPSYWLFEDKSKCLYNNAMDTGEIISWVKEHSK QRFISNKTLMYLGDSTNNNLVIDVEEVKDSSENIVLDKEGYPVLVNVYRVDNGDEIYRGN EPLNLVNWNEIRLKNGAVLDNIIIFRTYQYGTGLYLEKNCVIKNSEIYGYTLIDSTTSRS SNNYYISSGEVSYDIKSISENDCFYDINETKFPISLFDRDIIYYDSNVKKITEGKSDNSK IFYITIGGSRKSVAELALRGGKLINPSISFFYQGSINVIDEMINFKEIVVEPEPVIVTNN IKGQLKRIVKKGDRIKLLGYWSSQIQEFSSFPLGLNKVRTTLNLI NT seq 4458 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaactgtgatcaaggcagtcgaattattatcgttccagctggatgtttgggacatcgt gagattgatttgcaatgtaaatcaccattggaaagtgtctattaccagttttcaatggtc aatcgcctttctccctctgatgcaatcagctgtgtaagtgcccaaccttcagatgagaca cttagtgttgaccggattacggtatctgggcagacctttagggcacgtatcagtggaggg acaatgaataccaaaaccggtattcgttttttggtaaccacacgtgcaaatgaggaacgt gagtttgttgtgacattgccaattatgccggaaggaatcatgggcagtggcgaggctggc aattatgtattgggggatacgggtccccagggtcctcaaggatgtgccgcaacggttacg gttggcaaggttctgcctacagaacctgatggggatccaaagattgtcaattcgggaacc gaggtggatgccgttctggatttcaccttgccccgtggtcaggttgggcctcagggtgag cggggccaggccgcgacggtaaagattggaaatgttgtgacaggtgcggcagggagtgat gctgctgttgagaacaggggtgatgagcataacgctgttcttgattttaccattcctgaa ggtaggcaaggcatacaggggatacaggggaaggcaggcacgcaaattctgttgtccaat cgtgatcctgttgcccgtgatgccaaggaaaatattgtctggctcaatgatgtcacagga gatttgtttgaaactgtttcccggggcggggatgcatatagctggcacaagtctgggaat ttgaagggggaggctggcagtatcatatatactggtactgtggatcccgtttacaatgag gtttataaaaagagtgatctctatttcaatattaccaacagcaacctgttcacatttaat gataatcaatgggtcaggctggccaatctgaaaggggatcagggagagagaggttctcta tggttttttgcccaggaggatcctgtaacctcttcaagctatagggtcggggatagtttc ctgaatacagcttccaatgatctgtttgttttcaatggcacgaattggcaaaaggttgga aaccttcaaggtaaacaaggtggtattggcccgcagggattgcagggtgatactggcccg cagggactgcagggcattcagggagagaaaggggaagcaggcaaggacggcagggacggt tttgatggaacccgcatcatcaccagccagcaggatccggatcagggaagcgccccccta aacccgaatgttgtatggatcaacacgacgagctgggaggtcaagcgcaccattccgcat ggagatagctgggattgggtcagtcttggcagcatcaggggtccacgtggtggtattggc ccgcagggattgcagggtgatactggcccgcagggactgcagggcattcagggagagaaa ggggaagcaggcaaggacggcagggacggttttgatggaacccgcatcatcaccagccag caggatccggatcagggaagcgcccccctaaacccgaatgttgtatggatcaacacgacg agctgggaggtcaagcgcaccattccgcatggagatagctgggattgggtcagtcttggc agcatcaggggtccacgtggtgataccggcccgcagggattgcaggggttgcagggtgag aaaggtgcaaaaggggatgatggctcacgctggtatagtggtcataacttgcctgatgcg acaattggtcttaatgatccccgtggtatgccaagagcgggggatcaatatctttatctt gatgaaaagactggtgaggccagcgcctatatatacaccaatgacaagacctggggcggg cctttaggaaaagttgcgggaccccagggaaaagcggcaactgtcagggctgttgagcag gtgcggcctttaagacccgatgaggcggcaaccatcaaaaatattggcgatgaacatgac gcgatcctgcagttcagcattccaaaaggggagaagggggatgtgggcccgatcggaaaa gagggggccgcagctaccatacgtataggaaccgtgaccaccacagatccggatgtccag gcatccgttcgcaattcaggatcagaaaataccgccgtgctcgagttctccattcccaag ggagaaaagggggacagctatacgaatgacggatcaactgaactcaacgtcaagtcaatt cagtcagatggcggaaaggtcggaacagatggcgcgggtaaattatccgctgaaatgttg gattataccataaaggtcccaactccatcccatcaggatgcctctttgggtaaagtcgtc gataaagttttaaataatgtatccttttcaacatttacaaatatttatcaagaaaaaaaa gaaaataatgatttagatgttaaatgtgttgcaattggatctgatcgtgagaaagcaatt gataattggacacctctttttgataaaaatagtagaattgatggaaacgggattaagtgt ttcgataaagaaactggtgaatgggtcgttcctgaagacgggattttggatattaattat gatattgcttttggtgacatatcaggaaaaaaatatgttcctatagtagaagcggaaact ttttttaacattgatatggtaatcaacaatgagctgaataaagttaatgaaattatagaa gtggttgatcagcaggaaatcacttcttacattaaacctcttaaagaaaatttagactta gtttctgaagaaacaaaagataatcaaataaaggtggataataaaacagatttaaaatcc ttttttcttaaacgtgaatatccaattatagattcaggcaattggaagactgttaaaatc aagcaaggtatcaataaaggtaaaattgcctggtttgatacaatttctaataagtattta aaaaaagctattaataatgattacgtttttacagaagaaattgtggaagcttacgcaggg ccagtaattttgattgatgtagatgtgacaatatcatccggtaccgaagtgtcagggatc agtttattaacgaatgtaaataatgaaagacaagaaccatatgttttggtcattgaggaa aatgcaaaaatttcatattcgaatatattttatagaaatgtgatatcaaggggtaaatca tatcataacacgtattcaagtagcatggttgaattgtataataatgcaatatctttaaaa gataccttgatagttgtgggagaagtgaaagctaaattttgttcaacaagcaaaacgtgt acaagtacaaaggattattcctcgggagataattctttttggtttggaactgatgggtat cctataggattaaaaggttacaataacgctgaatttatttgtccaattgttccattattg tcagaaggtagtccagtatctcatccatcttactggttatttgaagataaaagtaaatgt ttatataataatgcaatggatacaggtgaaataatttcatgggttaaggaacatagtaaa caaagatttatttccaataaaacattgatgtatttaggagactcaaccaacaacaattta gtaatagatgttgaggaagtgaaagatagctctgaaaatattgttcttgataaagaagga tatcctgtcttggttaatgtttatcgtgttgataacggtgacgagatatacagaggaaat gaacctttaaatttagtcaattggaatgagataagattaaaaaatggagcggtcttagat aatataattatttttagaacttatcaatatggcacgggattgtatctggaaaaaaattgc gtaataaaaaattctgaaatttatggatacactctaattgattctacaacaagtcgatca agtaataattattatatctcttcaggagaagtttcttatgatataaaatcaatttctgaa aatgattgtttttatgatataaacgaaacgaaatttccaatttcgttatttgatcgtgat ataatctattatgacagtaacgtgaaaaaaataactgagggtaaaagtgataatagtaag attttttatattacaataggtggcagtagaaaatcagtagcggaattagccttaagaggt ggaaaattaataaatccttccatttcatttttctatcaaggttcgataaatgttattgat gaaatgataaattttaaggagatagttgttgaaccagaacccgttattgtgactaataat attaaaggtcaattgaaaagaattgtaaaaaagggggacagaataaaattgttaggttat tggtcttcacaaattcaggaattttcatcgtttcctttaggattaaataaagttagaact acattaaatttaatataa

DBGET integrated database retrieval system