Commensalibacter melissae AMU001: D9V35_08505
Help
Entry
D9V35_08505 CDS
T05684
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K08676
tricorn protease [EC:3.4.21.-]
Organism
coq
Commensalibacter melissae AMU001
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
coq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
coq01002
]
D9V35_08505
Peptidases and inhibitors [BR:
coq01002
]
Serine peptidases
Family S41: C-terminal processing peptidase family
D9V35_08505
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PD40
Peptidase_S41
PDZ_Tricorn
Tricorn_C1
DPPIV_N
Beta-prop_EML_2
DUF5050
eIF2A
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYN87523
LinkDB
All DBs
Position
complement(1873172..1876537)
Genome browser
AA seq
1121 aa
AA seq
DB search
MRGFGMNRWNRLIVNTILFHVGMIGCAGTFFPGLAQESQTLNNQVLMRYPTLHGNKIVFS
ARGNLWQVSKSGGMAVRLTSEQGEDLMPRFSPDGQWLAFTGSYQGNRDVYLMPAAGGEVK
RLTYHSDIVASAPERWGPDNMVVTWTPDSKSIVFLSRRNAWNSWMSLPFSVSIKGGLPKA
LPLDRSGFLSYDSDGKKIAYTRIYRDFRTWKRYDGGLAQDIYIYDFDTKKLEQITHWKGT
DTIPMWYQDKIYFLSDRDANRRVNLWVYDKTTGKKRQVTHFTDYDIDFPSLGDQGIVFQQ
GGHLYVLDLPSEHLHEIHVIVPDDGIKIMRHHVFLTDDVRKTDSAQQPDFSIAPNGKRAA
FAARGNIFTVPVENGAIRNLINASNVDADHPVWSPDGKWIAYTTDSDGEQNIAVRPSLGG
AERLLTHFKSGYYYAPRFSPDGKQLAFSDGNHNLWTVDFEGKSVKKIATDIHAEIHDFSF
SPDSHWLVYSLTQSNQQRAIWAYNFATNKFVQLTSGNNNDYLPLFSADGKYLYFVSNRHE
NTVFADNEMNALTVKSAGIYVATLQVATPSLFAPRSDEGITDKDRVIREKDGKTISSIQI
DEKGLEDRIVPLPIEGGMITDMQIAGDKVYYLMSPPQTISSEFPGEKPALHVYDVKQRKD
TIIEQGIQNYSLSYDGQKFLYNKNNQWVISDAKEKHTEDKSLKLESLTSFVIPSEEWREM
FDNAWRLQRDLFVNPQMNGQNWHEIHDRYAKLLPLAGSRSDINYLIGQMVGEIGNSHTYV
GGGDQQNLIKTVPTALLGVDFAYDAQKQRYYLAKIYSGDNSRKAYRSPLSEPGFNIHAGD
YLLRVNGQEVKSDTNPYRFFVGLENPVQLSFEDRQTKAVKNVTVNTIKSELSLREKDWIE
HNRRLVDRLSGGKIAYIYLSDMEELGLQQFIRQFYAQLDRQAVIIDDRWNGGGFIDEILL
ERLRRILVGMTTNREKMTHSLPEQLIVGPKVTLINQYSASDGDIFPYYFRKYGLGKLIGK
RTWGGVRGIRGFWSLRDGGYITIPEESLYGLQSEWIIENHGVDPDIEIENTPDELQHGHD
RQLETAIDYLLKELRDHPVSMPQSPSWKTAYPENGIPFNRK
NT seq
3366 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgcgtggatttggcatgaacagatggaataggttaatagtaaatacgatattgtttcat
gtcggaatgatcggttgtgcaggaactttttttccaggtcttgcccaggaaagtcaaact
ttaaacaatcaagttctcatgcgttatccaactttacatgggaataaaattgttttttcg
gcacggggtaatctttggcaggtttcaaaatcaggtggaatggccgttcggttgacttcc
gaacagggggaggatttgatgccgagattttcaccggatggtcaatggctagcttttaca
ggaagctatcaaggcaatagagacgtctatcttatgcccgctgcgggtggagaggtcaaa
cgattaacctatcattctgacattgttgcttctgcaccggaacgttggggacctgataat
atggttgtcacctggacacctgattcgaaatcaatcgtatttttatctcgtcgcaatgcg
tggaacagctggatgagtttgccgttttccgtatccataaaaggtggattgccaaaagcg
cttcccctggatcgttctggatttttaagttatgattctgatggaaaaaaaattgcttat
acccgtatctatcgtgattttcgaacctggaaacgttatgatggtggtctggcacaggat
atttatatttatgattttgatacaaaaaaactggaacaaataactcattggaaaggcaca
gataccattccgatgtggtatcaggacaaaatttattttttatctgacagggatgcaaat
cgacgcgttaatttatgggtttatgacaagacgacaggaaaaaaacgccaggtaacgcat
ttcaccgattatgatattgattttccgtcattgggtgatcaaggcattgtctttcaacag
ggcggtcatttatacgtgcttgatcttccatcggagcacctgcatgaaatccatgttatt
gtaccggatgatggtataaaaatcatgcgtcatcatgtgtttttgactgatgatgtacgt
aaaactgattctgcccaacaacctgatttctcgattgctccaaatggaaaacgggccgct
tttgccgcaaggggaaatatattcaccgttcctgttgaaaatggagctatccgaaatttg
attaatgcaagtaatgtagatgcagatcatcccgtctggtcaccggatgggaaatggatc
gcctatacaacagatagtgatggtgaacagaatattgctgttcgtccatctctgggaggg
gccgaacggcttttaacccatttcaagtcaggttattattatgctccgcgtttttctccc
gatggaaaacagcttgccttttcagatggcaaccataatttatggacagttgattttgag
ggtaaatccgtaaaaaaaattgccaccgatattcatgcggaaatacatgattttagtttt
tctcctgacagtcattggttggtttatagtttaactcaatccaatcagcaacgggcaatt
tgggcttataactttgctacgaataagtttgttcagctaacatctggaaacaataatgat
tatttgccactattttctgctgatggaaaatatttatattttgtttccaatcgtcatgaa
aatactgtttttgctgacaacgaaatgaacgccctgacggttaaaagcgcgggaatatat
gtggcaaccctacaggttgcaaccccatccttattcgcccctcgttctgatgagggaatt
acagataaagatagggttataagagagaaggatggaaaaacgatctcttcaattcagatc
gatgaaaaaggattggaagatcgaattgttcccctaccaattgaaggtggcatgattaca
gatatgcagattgcaggggataaggtttattacttgatgagtcctccacaaacgatttct
agtgaatttccgggtgaaaaacctgcgttgcatgtttatgacgttaaacagaggaaagat
actataattgaacagggtattcagaattatagtctttcgtatgacggtcagaaattttta
tataacaagaataaccagtgggttattagtgatgccaaggaaaaacatacggaagataaa
tcattaaagcttgaatccttaacaagttttgtcattccgtctgaagagtggcgggaaatg
tttgataatgcctggcgtctacagcgtgatcttttcgttaatccccaaatgaatggacag
aactggcatgaaattcatgaccgttatgccaaattattgccattggctggatcaaggtcg
gatatcaattatcttattggtcagatggttggagaaatcggtaattcacatacatatgtt
ggaggtggagatcaacagaatttgataaaaacagttcccacagccttattgggggttgac
tttgcctatgatgcacagaagcagcgttattatttggcaaaaatatattccggggataat
agccgcaaagcctatcgcagtcctttatccgaacccggatttaatattcatgcaggtgat
tatctgttaagggtaaatggtcaagaggtaaagagtgataccaacccttaccggtttttt
gtcgggctcgaaaatcctgtccaactctcttttgaggatcggcaaacaaaagccgtgaaa
aatgtaacagtcaatacgattaaaagtgaactgtcattaagagagaaagactggattgaa
cataatcgtcgactggttgatcgtttatcaggtgggaaaatagcctatatctatctttca
gatatggaagagcttggattgcagcagtttatccgtcagttttatgcccagctggataga
caggccgttattattgatgatcgctggaacggtggcggttttatcgatgaaattcttctt
gagcgtttaaggagaatcttggtgggaatgaccacaaaccgtgaaaaaatgactcattcc
ttgcctgaacagttgattgttggacctaaggtcacgttaatcaaccagtattctgcatct
gatggtgatatctttccttattattttcgtaaatatggtttgggtaaactgattggcaag
cgaacctggggtggcgtacgtggtattcgcggtttttggtcgctaagggatggaggatat
attactattccagaagaaagcttgtatggattacaatcagaatggattattgaaaatcac
ggggtcgatccagatattgaaattgagaatactccagatgaattacagcatgggcatgat
agacaattggaaacggcaatagattatttgctaaaagagttaagagatcatcctgtatct
atgcctcagtctccttcctggaaaaccgcttatcctgagaacggtatcccctttaacagg
aaatag
DBGET
integrated database retrieval system
