Chryseobacterium oranimense: N0B40_09360
Help
Entry
N0B40_09360 CDS
T08904
Name
(GenBank) fibronectin type III domain-containing protein
Organism
cora
Chryseobacterium oranimense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
fn3
Ig_Rha78A_N
Por_Secre_tail
GBD_T9SS_assoc
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWX62487
LinkDB
All DBs
Position
complement(2013227..2016430)
Genome browser
AA seq
1067 aa
AA seq
DB search
MCLVFLTMGITAQTTVTIGTGASTATAGTNGDPIYRSSGASTYHYSKSVQLLTATDLAGA
SVVSGASINSIGYYKTTAFNVSGSNAWTLNVYLKNSSATALASGTAWDTMTGGATLFYSA
TINSTNNFPAAAGWVTFANNTANTFSYAGGAIEVYIDWVPSGTLTSPYTGGAFQWKYDTT
TSAQAMGTSNSAAIAGTTTSYTTQTRRYQTQLTYTATACSGAPNPGNTLATAISTTCSAP
YSTTLSLQNSTAGTGVSYQWYNNAGAIAGATNSTYTATVSAADSFYCAVTCSGSGITTNS
TPVSVSGPAAAISALPWTENFDNMSNIGSGIVPSCWTNVTGSKAWASMNTASVSYNVPKS
TPNYMTIAYSNTNASQLWTPAFQLTAGTSYDFSFYYNTGGTSSSYIGYTGNVLVNNSIST
TGATDLGAFITATQGTTAGAAGYVKVTKTFVPATSGVYMFAINVSSTSAPWYLGVDDFTL
ETTPSCVAPTALTSASVTASGATVSWTAPATAPANGYHIYYSTSNTAPTSGTTPSTTSTT
TSAPLSSLASATTYYVWVRSNCGSGATSSWSGPTSFTTACNATNIPYTQDFESVTTPALP
SCTSLENAGTGNNWTTSSPAANGFTSKTLTYLYNSSSAANAWFYTQGINLTAGVSYRIKY
RYGNNSTTYVEKLKVAYGTSASSASMNNTLADYSNINTGTSTSAFVDFTPATSGVYYFGF
NAYSASNQYNLYVDDINVDITPTCTEPTAITSSNITTTSADISWTAPATAPGNGYEIYYS
TTNTAPTSTTPATITGITGTTKTLTPLSSGTAYYVWVRSVCSATDNSVWSSVVTFTTLTP
PPANDDCSGATPLTVGTSFAQNAVTNTNAGATATSDATAVHACQTTGYKDVWYSVVVPAS
GNVTIETAAATGSNVTDTVMGVYTGSCGTLTSVGCNDDISSGTNNFSKISLTGQTPGTTL
LIGVWNYSSTTTGQFKIAAYDAALATSEVSQPKNDLKAYPNPFADVLNISDISKVKSVSI
VDVAGRVVKTIDTPSSALHLGDLKQGLYLVTLNMKDGSKQTIKAIKK
NT seq
3204 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgcttagtctttctcaccatgggaataacggcacaaactactgtaaccataggtaca
ggagctagtacagctactgccggtactaatggtgatcctatttaccgttcgagtggtgcc
agtacatatcattattcgaaatcggtacaactgcttactgctactgatttagcaggtgca
tctgttgtttcaggagcatcaatcaatagcattggatactataagacaacagcctttaat
gtatctggttctaatgcctggaccttaaatgtgtatcttaaaaatagttctgccacagcc
ttagctagcggtacggcttgggatacaatgactggtggggctaccttgttttacagtgct
acgattaatagtactaacaacttccctgcagctgcaggttgggtgacctttgcaaataat
acagcaaacactttcagctatgcaggaggtgctattgaagtatatattgactgggttcct
tcaggaactcttacaagcccttatactggaggagcgttccaatggaaatatgacactact
acatctgctcaggctatgggtacaagtaattcagcagctattgctggaacaactacttct
tatactactcaaaccagaagatatcagacacagcttacttatactgcgacagcatgttct
ggtgctcctaatcctggaaatactcttgcaacagccataagtacaacgtgttctgctcct
tactcaactacattaagtttacaaaactctacggcaggaacaggggtttcttatcaatgg
tataataatgcaggggcaattgcgggagcaacaaactcaacatatactgcaacggtaagc
gctgctgattctttctattgtgctgttacatgttcaggctctggtataacaacaaattca
actcctgtttcagtatcaggtcctgctgctgcaatatcagcgctcccttggactgaaaac
tttgacaatatgtctaatatcggttcaggaattgtgccttcttgctggaccaatgtaaca
ggttcaaaagcatgggcttctatgaatacggcttcggtttcctataatgtgccgaaatca
acgccgaactatatgacaatagcatacagtaatactaatgcaagccagctttggacacct
gctttccagttaactgctggaacttcttatgatttttctttctattataatacaggagga
acgagttcatcttatataggatatacaggaaatgttttggtaaataattctatttctact
actggtgcaaccgatttaggagctttcataacggcaactcagggtacaacagccggagct
gcagggtatgtaaaagttactaaaacatttgtgcctgctacttcaggcgtatacatgttt
gctataaatgtatcttctacaagtgctccatggtatttaggggttgatgactttacatta
gaaactacaccgtcttgtgtagcacctactgctttaacttcagcttctgttactgcttcc
ggagcaacagtttcctggacggctcctgctactgcacctgctaatggatatcatatctat
tacagcacaagtaatacagctcctacttccggtacaacaccaagtacaacaagtactaca
acttctgcaccgctaagtagtttggcatcagctacaacctactatgtttgggtacgttct
aattgtggttcaggggctacaagttcttggtcaggaccgacaagttttactactgcatgt
aatgctactaacattccttatactcaagattttgaaagtgtaacaacacctgcgttacca
tcttgtacatcattagaaaatgccggaacaggtaataactggactaccagctcacctgct
gctaatggatttactagtaaaacgttgacttatttatataattcttctagtgcagcaaat
gcatggttttacactcaaggaattaacttaacagctggggtttcttatagaattaaatac
agatatggtaataatagcacaacttatgttgaaaaactaaaagttgcttatggtacttct
gctagcagtgcaagtatgaataatacattagcagattattcaaatattaatacaggtaca
tcaacgagtgcgtttgtagatttcactccggcaacatcaggtgtttattattttggattt
aatgcctattcagcaagtaatcaatacaatttatatgtagatgatatcaatgtagatatt
acgccaacttgtactgaacctactgcaataacatcttccaatatcactactacaagtgcg
gatatttcttggacagctccggctactgcgcctggcaacggatatgaaatatattatagt
acaacaaatacggctcctacaagtactactcctgctactattacaggtattacagggaca
actaaaacacttacgcccctaagtagtggtacagcttattatgtgtgggtaagatctgtt
tgtagtgccactgataacagtgtttggtcttctgttgttacatttacaacattaacacct
ccacctgctaacgatgattgctctggagctaccccattgacagtaggaacttcatttgca
caaaatgccgtaactaatactaatgctggtgctacagctacatccgatgctacagctgta
catgcctgtcagacaacaggttataaagacgtgtggtattctgtggtagttcctgcaagt
ggaaatgtaactatagaaactgctgctgctactggtagtaatgttaccgatactgttatg
ggagtttatacaggttcttgcggtacattaacttcagttggatgtaatgatgatatctca
tctgggacaaataatttctctaaaatttcattaacaggacaaactcctggaactacactg
cttataggtgtgtggaattattcatcaactacaacggggcaatttaaaattgcagcttat
gatgcagcattagcaacttcagaagtttcacaacctaagaatgaccttaaagcatacccg
aatccttttgcagatgtcctgaatatttcagatatctctaaagtgaaatcagtatcaatt
gttgatgttgcaggaagagtggttaaaactattgataccccttcttcagctcttcattta
ggagatttaaaacaaggattatatcttgtaactcttaatatgaaagacggatcaaaacaa
acgatcaaagcaattaagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
