Chryseobacterium oryzae: MTP08_12150
Help
Entry
MTP08_12150 CDS
T08538
Name
(GenBank) T9SS type B sorting domain-containing protein
Organism
corz
Chryseobacterium oryzae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
Ig_7
Reelin_subrepeat-B
CHB_HEX_C
SCVP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOE37793
LinkDB
All DBs
Position
2672408..2676238
Genome browser
AA seq
1276 aa
AA seq
DB search
MMKKLLSSLFIILNLFIFAQEDCVSAIAVCGNSNINYTPSGIGNINESLGGCLSYENHSV
WYKFTIATSGTLTFDLIPTGPVDYDWAIYGPNVTCNNRGTPIRCNASAALTSTGMNMTNT
NTSSAAGSTSPYCKYMDVVAGQTYYLYVDNWSTTVYTFNLTWGGTATFVSPFTNPAMAPN
PFIPPGSPGPNANSPREINICGNNTTFNFSTLTPGILNNNPNFIVYYYNSANNAATGTNP
ITAPTTVNTSTTYYYTISYQDINNPITAANSCKQTNAIIFKDKSLTTSITASSTKLCPGG
NITLTSSNPTGNTWSTGATTPSINVTSPGTYTLTSSNGICTSPQASVVITQDTDPNPQIS
GNLTLCEATSTILTASSTGTGNTYTWSNGATTPSITVTTPGTYSVIVKTPANCSYTKSVT
VVQGNVPVVQNASLTMCSNSSSAIFDLTAAQPQMSSTSGINFSYYLNQSDANAGNSNTIS
NPTAYSSGNGVVYVRISTSTCAKVAQIQLNITQLSTPTITASSSKICLGGSVILTSSQAT
GNVWSTGATTQSITVTSPGTYTLTSNSGTCTSQPATVNITADADPNVQITGNLVLCDSPN
TLLTASSTGTGNTYTWSNAATTPSITVTTPGTYTVVVKTPANCNYTKTVTVVQGNVPVVQ
NSSLNICSDSPIGIFDLTSAQTSISSTPGVSFSYYLNQADALAQNNNTIANPAAYSSGSN
TIYVLVKSTSCSKIASLQLMVNIKPIVVITKSANSICNNTPVILTSNFPTGNLWSNGSTS
QSITITNPGTYSLTNNNGTCTSEPVSVNIVQEADPNLQISGQLTFCEGTSTILTATAAGT
GNTYNWSNGSTTATTTVNTGGNYSVTVTTANGCQYTKAVNVVMDPLIVVNINTPGEINCT
TSQITLNATSSVYQSGATFLWTATTGGVIVSGANTLTPVVSNSGTYTLTITSATTNGCIK
QASVNVIKNTTPPIITISTSKLKICKGETITLVANGANTYTWTGLSGTGNTQVVSPSSTT
VYSVTGVGSNGCAASSPATITITVVPEIVSTISNIEFCKGDKGILDAGTGPNYTYLWSTG
ETTQTISTSTAGTYSVTINNGACSRTFTALAKYIPIPEITDIIYDNKTITINVKKTGTQP
LEYSIDNGVTWQSSNVFSVYRNNLYTVKVRFRGADCETSTEFYTFSMNNVITPNADGKND
VIDFSEISKYGKFEGGIFDRYGKNIFKISSATPIWNGKELGRPLPTETYWYKLFWEDRIT
KKPVQTSGWILLKNRD
NT seq
3831 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaaaaactactttcttccttattcatcatactcaatctttttattttcgcacag
gaagactgtgtttcggcaattgctgtctgtgggaattcaaatattaattacaccccatcg
ggaataggaaatatcaatgagtctcttggcggatgcctttcatacgagaaccattctgtt
tggtacaaatttactattgcaaccagcggaacgcttacttttgacttaattccaacaggt
cctgtggattatgactgggcaatttacggtccgaatgtcacctgcaacaacagaggaaca
ccgataagatgtaatgcttcggctgcgcttaccagcacgggaatgaatatgaccaatacg
aatacttcgtcagccgcaggaagtaccagtccgtactgtaaatacatggatgttgttgca
gggcagacttattatttatatgtagataactggtctacaactgtatatacatttaattta
acttggggaggaacagcaactttcgtatcccctttcactaaccccgcgatggcacccaat
ccatttattccgcccggctctcccggacctaatgcgaattctccaagagaaattaatatc
tgcggaaacaatactacatttaatttcagcacattaactcctggaattttaaataacaat
cctaattttatagtttactattacaatagtgccaacaatgcagcaaccggaactaatcct
ataacagcaccaacaacagtaaatacttctacaacctactattacactattagttatcag
gacatcaacaaccctataactgctgcaaattcttgtaagcagactaatgcaattattttt
aaagataagagtttaactacttctataacagcttcatctacaaaactatgccccggagga
aatattactttaacctcaagtaacccaaccggaaatacttggtctacaggtgcaaccact
ccatctattaatgtaacttctccaggaacatatactttaacttcaagcaatggtatttgt
acaagcccgcaagcttcagttgttattacacaggataccgatccgaatcctcagatttcg
ggaaatttaactttatgtgaagcaacttcaacaattcttacagcttcttcaacaggaacc
gggaatacatacacttggtctaatggcgctacaacaccttccataacagtaactacacct
ggaacatatagtgtaattgtaaaaactcccgcaaattgcagttacacaaaatctgtaacc
gtagtacaaggtaatgtaccggtggttcaaaacgcgagtttaacaatgtgttccaacagt
tcttcagctatattcgatcttactgcagctcaaccgcaaatgagttcaacctccggaata
aatttttcatattaccttaatcaatcggatgctaatgcaggaaattcaaatacaatttct
aatcctacagcttattcatctggaaacggagttgtatatgtgagaatcagtacttctact
tgtgctaaagtcgctcaaattcaacttaatattactcaattaagcacgccaaccataaca
gcttcttcatcgaagatatgtttgggaggaagcgttattttaacttcaagccaagcaacg
ggaaatgtttggtccacaggagcaacaacccaatcgattactgttacttcaccgggaact
tataccttaacttcaaacagtggaacatgcacaagtcagcccgctacggttaatattaca
gcagatgctgatcccaatgtgcaaattacaggaaatcttgtattatgcgactcacccaac
acgctattaacagcatcttcaacaggcacgggaaatacgtacacatggtctaatgccgct
acaacaccatcgataacagtaactacacctggaacatatactgtagttgtaaaaactccc
gcaaattgcaattacacaaaaactgtaaccgtagtacagggtaacgtacctgtagttcaa
aactcatctttgaacatttgttctgattctccaattggtatatttgatttaacttctgct
cagacaagtattagttcaacacctggagtaagtttttcatattacttaaatcaggcagat
gcattggctcaaaataataatactattgcaaatccagcggcatattcctcgggaagcaat
acaatctatgtgcttgtaaaatctacatcttgttctaagattgcttctttgcagctcatg
gtgaatattaaaccaattgttgttattaccaaatcagcgaattccatttgcaacaataca
ccggtaatacttacttctaatttccctaccggaaatctatggtcgaatggctctacatcg
caatcgataactataacaaatcccggaacttattcattaaccaataataacggaacttgt
actagtgaaccagtttcagtgaatattgtacaagaagcagatcctaatcttcagatatct
ggacagttaactttttgtgaaggcacctctacaatactaacagctacagcagccggaacg
ggaaatacatataattggtctaatggatctacaactgccacaacaacagttaatacagga
ggaaattacagcgttactgttaccactgctaatggatgccaatataccaaagccgtaaat
gttgtaatggatcctctaattgtagtaaatattaatactccgggcgaaattaattgtact
acttctcagataactctaaatgcaacctcttcggtttatcaatcgggagcaacttttttg
tggacagcaactacaggaggagttattgtttcaggagccaatactttaacccctgttgtt
tctaattccggaacatatactcttactattaccagtgctacaacgaatggatgtattaag
caagcatcggtaaatgtgattaaaaatacaacacctccgattatcacaatttcaacttca
aagttaaaaatttgcaaaggcgaaaccattaccctcgtagccaatggagcaaatacatac
acttggactggcttatccggaaccgggaacacacaagttgtaagcccaagctcaacaacg
gtttacagcgttacgggagttggatccaatggctgtgccgcttcatctcccgccacgatc
actataacagttgttcctgaaattgtttccacaatttcgaatattgaattttgtaaagga
gacaaaggtatcttagatgcaggaacaggtccaaactatacttatctttggagtacagga
gaaacaacacagacaataagcacttcgacagcaggaacttattcggtaacaataaataac
ggtgcatgctcaagaacatttaccgcattagccaaatacatcccaattcctgagattaca
gatattatttatgataataagaccataacaatcaatgttaaaaaaacagggacccagcct
ttagaatactctattgataatggtgtaacgtggcaatcctctaatgttttcagtgtgtac
cgaaacaatttatatactgtaaaagttagatttagaggagctgattgcgaaacttctaca
gaattctatactttttcgatgaataatgtgataaccccaaatgcagatggaaaaaatgat
gtaatcgattttagtgaaattagtaagtacggaaaatttgaaggtggaatttttgatcga
tacggaaaaaatatttttaaaatttcttctgctacacctatttggaacggcaaggaatta
ggaagacctcttcctaccgaaacctattggtataaacttttttgggaagaccgaataact
aaaaaaccagtacaaacgtcaggctggattttattgaaaaacagagactaa
DBGET
integrated database retrieval system
