KEGG   Candida orthopsilosis: CORT_0H02450
Entry
CORT_0H02450      CDS       T02488                                 
Name
(RefSeq) Cdc39 protein
  KO
K12604  CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
cot  Candida orthopsilosis
Pathway
cot03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cot00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    CORT_0H02450
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:cot03019]
    CORT_0H02450
Messenger RNA biogenesis [BR:cot03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     CORT_0H02450
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     CORT_0H02450
SSDB
Motif
Pfam: Not1 CNOT1_CAF1_bind CNOT1_HEAT_N CNOT1_TTP_bind DUF3819 ARM_Cnot1 CNOT1_HEAT NOT1_connector
Other DBs
NCBI-GeneID: 14542433
NCBI-ProteinID: XP_003871479
UniProt: H8XBA6
LinkDB
Position
8:538024..543909
AA seq 1961 aa
MSFKNLLQEVGFENVVPEKLLPSLLQIKPNEVDQGIALVLAEILIPGSQGFVYTAAPVSL
PESNAKGAQLQACFRTIEESDNLSVNWYEVFNYLQQNLFESSQRNVQPSVASVSQFLSSL
DFKQDPIDIFLNYEWWFDKTLLYILQTCDASQGGYDIALSKNLSLCFEEDRQTFGQPQLR
RNILKFINVGKLELQVITKVQAQQVQQNLSEQDHKLNAYLNQVFERDYRVFPEYVLTAAL
SVIEKTPFINDLIDTLFYLLMDNDSPALPKVVRTLQEQGLVVGKILDYYNSRNTFAAAEK
TVAVSSKLNILDQVLQQLESIDVKLAVKFLIESSFFNYDYRKKLESKLNDQQLKSLVYSS
LLDVITERAQRDYETVQQHQQHQQQEQLPIQTQTKPLPMLKLETTYYLLEKLKSSNGLVD
LEKLKNLQILLLTTYPRLINFGNGHDEAILANEAKSSFFPVDVELEMKEYYSKMYNKALD
IPEIVNVLIKMKSSDDPHQQDVFACMIHSLLDEYKFFGEYPLAALASTSLLFGALLENDL
IHGTTLTVALNFIWESCNQSPDSKMFKFAVQSLYNFKSKLHEYPIYCKHLLECRSLSTHA
KMYKIVKDAANGIPCGAGTSGSKSGSTPSTTPEVGPKYQSINYVEQTIGSAQQVDPPEEI
RDKLLFSVNNMTSENLRVTEIGEVLKEEYFAWFADYLVADRAKAEPNNHALYSNLVRTLD
NAIFKEYVMNITMKEVYHLIRNSKDSRTDRNKLKNLGAWLGRITLAEDKPLRRDLIAIKF
LLVESYDFDSLSLILPFVCKILSQIENSKVFKPPNPWVLGIFQVLSELYQFADLVLQLKF
EVEVLLKLFDMKIEDIEPSQLIRKHDKDPSRLAAAFGLLPQAGENLASEMARLNIEQPQT
LSNFNTMAQLPSQTFDKPFQQLQAPGQLMVPQQQQQPQQASSMQSYQQQPQQGQVESGVD
TSFSTLVGNTIFTQHANLRRALQASLTRAVRECAMPILNRVSEAVLVTTEFLIKKDFATE
KDVGKIRRSYHRMAQQLSHSMVLCSGKKMLADTIEATMLQLLGNNPSEIPIMELNSAIQS
NVGLCVDIVDKIAATNVTDLIDERMKPYILKRERHAGDDIFVEEGTPDYSLRLPEPLGLN
PKGLSPQQLNIYEHFGELRNESLDGLRAAGLTPTGAPAILAHPQPQQLAQQQPQAQMQGP
SQLGQDFPVQQQTSLVQEDIIPLEQLFTAITQYCEKAVSLVSEVSESKLSDLPPNHPIMA
TLTQALAMAQSNALKYSDLLLRAAQYAVNCLFTQVHNNPMSNEIYVVILDKLCEFSPSTA
KDVIWWLVNSSDQRKFNMPVILSLLKVQLIQPIKLDESISKLIKESHNPAIVKFGASLLL
NVFTAEESVRPIALRSEFAKTLDALYEYKKLQLTSEEDKQAQIEVDKLFDVLNTAKPATS
ELYTQLGYVFTEWVRLLSHGDQDTRAAQEKFVAGLVESGILNNADYFKTFWKAGIDISTL
VFATEQELRSRTQHEAYLSIDCLAILIVRIVLSVEDEQQAVHCLKKIIAVIVLNLVTDHE
NKSAWNDRPYFRFFSSLLSAWSDASILDQDATKKLDVDFYTFLGDIFNSLQPIVLPGFTF
SWIALISHRLFLPQILELPDKVGYGIGVKLLTSLLKFQQTYQNKESNHDVLNVVFKGINR
IFVGLIHDYPEFLVECHYQLVTAIPRGYIQLKNIVLSATPKDIIVPDPFTQGLKVERLPE
INDAPVIYYKPIEDLAKVGLKKPVENFLRIPAPGLMRTIYNGLKLIQPKTTDEFGYTETT
TFNAKLINALVLHVGMNAVAERSPTNRGFNTKTSQVALLVDLMNYGSNEFKYIMLNGIAN
QLRYPNSHTHWFIGIILHFFSSNSIWNSSTSTKLAVQEIITRVLLERRIVNKPHPWGLTI
LFTELVKNESYGLFELPFVKNSIDEIKTIFDTLSTNVKGSS
NT seq 5886 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcattcaaaaatttattacaggaggttggctttgaaaatgtagtaccggaaaagtta
ttacccagtcttttacaaattaaaccaaatgaagtagatcaaggtattgcgttggtattg
gcggaaattctaatacctggctcacaagggtttgtgtataccgctgcaccggttagttta
cctgaatctaatgctaaaggtgctcaattgcaagcatgttttagaaccattgaagaactg
gataatctcagtgtcaactggtatgaagttttcaactacttgcaacagaatctctttgaa
tcaagtcaaagaaatgttcaaccttcagtagccagtgtatcacaattcctatcatcattg
gatttcaaacaggatccaattgatattttccttaattatgaatggtggtttgacaagaca
ttattgtatattttacaaacttgtgatgcctctcaaggtggttatgacattgcattgtcc
aaaaacttactgttgtgttttgaagaagatcgtcaaacttttggtcaaccacaattgaga
agaaatatattaaagtttattaatgtgggaaaattggaattgcaagttataaccaaagta
caagcacaacaagtacaacaaaacttgagtgaacaagatcataaactcaatgcatatttg
aatcaggtatttgagcgtgactatagagtattccccgaatatgtgttgacagcagcattg
tcagttattgaaaagaccccatttatcaatgacttgatagataccttgttttacttgttg
atggataatgattcaccggcattacctaaagtggtgcgtacattacaagaacaagggctc
gttgtgggtaaaattcttgactactacaatagtagaaacacttttgccgctgctgaaaag
acagttgctgtgagctcaaaattgaatatcttggatcaagtattgcaacaattggagagc
attgacgtcaaattagcagtgaagtttcttattgaatcatcgttttttaattatgattac
agaaagaagttggagtcgaaattgaatgatcagcagttgaagagtttggtttatctgtcg
ttgttggatgtgattactgagagagctcaacgagactacgaaacggttcaacaacatcaa
caacatcaacaacaggagcaattaccaatacaaacacaaaccaaacctttacccatgttg
aaacttgaaactacttattaccttcttgaaaaattaaaaagcagtaatggattagttgat
ttggagaagttgaaaaatttacaaatattattgttgaccacgtatccaagattgatcaat
tttggcaatggtcatgatgaagccatacttgcaaatgaagccaaatcaagtttcttccct
gttgatgttgaattggaaatgaaagaatattattcgaaaatgtacaacaaggctcttgat
ataccagaaatcgtcaacgttttaatcaagatgaaatcaagtgatgacccccatcaacag
gatgtgtttgcatgcatgatacattccttgttggatgaatacaaatttttcggtgagtac
ccgctagctgcactagcatcaacgtcgctactttttggagccttattggaaaatgatttg
attcatggtacaactttaacagtggctttaaattttatttgggaatcatgtaatcaactg
ccagattcgaaaatgtttaagtttgcagttcaatctttgtacaatttcaaatcaaaattg
catgagtatccaatatattgtaaacatttattggaatgtcgttcgttatcaacccatgct
aaaatgtacaaaatcgttaaagatgcagctaatggtattccttgcggtgctggaacgagt
gggtccaagagtggaagtaccccaagtacaactccagaagtaggaccaaagtatcaatcg
attaattacgttgaacaaacaattggctcagctcaacaggttgatccgcccgaggaaatt
agagataagttgctcttttctgttaacaatatgacttcggagaatttacgagttaccgaa
attggtgaggtgttgaaggaagaatattttgcttggtttgctgattacttggttgctgat
cgagccaaagccgaacctaataatcatgcattgtattcaaatttggtgcggactttagac
aacgccattttcaaggaatatgtaatgaacatcaccatgaaggaagtgtatcaccttatc
agaaactcaaaagattcacgtactgataggaacaaactcaagaaccttggtgcttggttg
ggaagaatcaccttggctgaggataaaccattgagaagagacttgattgcgataaaattt
ttgcttgtcgagtcatatgattttgattcattgagtttgatcctcccttttgtttgtaaa
atcttgagtcaaattgaaaactccaaagtatttaaacctccaaatccttgggttttgggt
attttccaagtcttgtctgaattgtatcaatttgctgatttggtgttacaacttaaattt
gaagttgaagtattgttgaaattgtttgatatgaagattgaagatattgaaccaagtcaa
ttgattagaaaacatgataaagatccaagtcgtttggctgccgcgtttggtctcttgccc
caagctggtgaaaatcttgcttcggaaatggctcgtttgaatatagaacaaccacaaacg
ttgtctaatttcaatactatggctcaattgccatctcagacatttgataaaccgttccag
caattacaagcccctggacaactaatggtaccacagcaacaacaacagcctcaacaggcc
agttcaatgcaatcttaccaacagcaaccacaacaaggacaagtggaatctggggtggat
accagtttcagtactcttgttgggaatactattttcactcaacatgccaacttgagaaga
gcccttcaagcatcattgacaagagctgttcgtgaatgtgccatgccgatattaaataga
gtatcggaagcagtattggtgactaccgagtttttaatcaagaaggatttcgctaccgaa
aaggatgttggtaaaattagaagatcgtaccataggatggcccaacaattgtcacatagc
atggtgttgtgttcaggcaaaaagatgcttgctgataccatcgaggcgacaatgttgcaa
cttcttggtaacaatcctagcgagatacctataatggaattaaacagtgctattcaatca
aatgtgggactttgtgttgatattgtcgataaaattgctgcaactaatgtaactgatttg
attgatgaaagaatgaaaccatatattttgaaacgtgagcgtcatgctggtgacgatata
tttgttgaagaaggtacacctgattattcattgagattgccagaaccattgggattgaat
ccaaaaggattgagtccccaacaattgaatatttatgagcattttggtgaattgagaaat
gagctgcttgatggtcttcgtgctgctgggttaactccaactggtgcaccagcaattctc
gcacatcctcaaccacaacaacttgctcaacaacagccacaggcacaaatgcagggtccg
tcacaacttggtcaagatttccctgtgcaacaacaaacatcgcttgttcaagaggatatc
atacctttggaacaattgtttactgctattactcaatattgtgaaaaagcggtgctgtta
gtatctgaagtgtcggagagtaaattatccgatttgcctccaaaccatccaattatggca
actttaactcaagcattggccatggcccaaagcaatgcgttgaagtattctgacttgtta
ttgagagctgcgcaatatgctgtaaactgcttgtttactcaagtgcacaataatccaatg
agtaatgaaatatatgttgttattcttgacaagttgtgtgaattttctccctcaacggct
aaggatgttatttggtggttagttaattcatcagatcaaaggaaattcaacatgccagtg
attttgtctttattgaaagtgcaattaatccaacctatcaagcttgatgaatcgattagc
aaattgattaaggaatcgcataatccagcaattgtcaaatttggtgctagtttgttattg
aatgtgttcactgctgaggaatcagtacgtccaattgcattgagatcggagtttgccaag
actttggatgcattatatgaatataagaaattgcaattgactagtgaagaagataagcaa
gctcaaattgaagttgataaattgtttgatgtgttgaatacggcaaaaccagctacatct
gaattgtatacgcagttgggttatgtctttactgaatgggtgaggttattgagtcatggt
gatcaagatactagagctgcacaagagaaatttgttgctggattagttgagctgggaatc
ttaaacaatgctgattacttcaagacgttttggaaagcaggcattgatatatcgacactt
gttttcgctactgagcaagaacttagaagtaggacacaacatgaagcatacttgtcaatt
gattgtttggccattttgatcgtgaggattgttttgagtgttgaagatgaacaacaagca
gtccactgtttgaaaaagattattgctgtgattgtattgaatttggtaactgatcatgaa
aataaatcagcttggaatgatcgtccatattttagatttttttcatcattgttgtccgct
tggagtgatgcgtcaatattggatcaagatgcaacaaagaagcttgatgttgatttctat
acctttcttggtgatattttcaattcattacaacctattgttcttcccggttttacattt
agttggattgcattgattagtcatcgtttgttcttaccacaaattcttgaattacctgat
aaagttggatatggaattggtgtgaaattgttgacttcgttattgaagtttcaacaaact
tatcaaaacaaggaaagtaaccatgatgtgttgaatgtggtattcaagggaatcaataga
atctttgttgggttgattcatgattatcctgaatttttagttgaatgtcattaccaattg
gttactgctattccaagaggatatattcaattgaaaaatatcgtgttgtcggccactcca
aaggatataattgtaccagatccatttacccaaggcttgaaagttgaacgattaccagaa
attaatgatgctccagtcatttactacaagccgattgaggatttggcaaaagttggttta
aagaaaccagtggagaatttcttgcgcattccagcacctggattaatgagaacgatatac
aatggacttaaattgattcaaccgaagacaacagatgaatttggatatacagaaacaacc
acattcaatgctaaattaatcaatgcattggtgttacatgtgggaatgaatgcagttgct
gaaagaagccccacaaatcgtgggttcaatactaagacttcacaagttgcattgcttgtt
gatttgatgaattatggatccaatgagttcaaatatatcatgttgaacggtattgctaat
caattgaggtaccccaacagccacacccattggtttattggaatcatcttacactttttc
agttcaaattcaatttggaattcatcaacaagtaccaaattggcagttcaggagattata
actagagttcttttggagagaagaattgtcaataagccacatccttggggattgactata
ttgtttactgagttggttaagaatgagagttatgggttatttgagttgccatttgttaaa
aactcgattgatgagatcaagactatatttgatactttgtctactaatgtcaagggatca
agttga

DBGET integrated database retrieval system