Colwellia sp. Arc7-635: EKO29_01790
Help
Entry
EKO29_01790 CDS
T06022
Name
(GenBank) TonB family protein
KO
K02172
bla regulator protein blaR1
Organism
cov
Colwellia sp. Arc7-635
Pathway
cov01501
beta-Lactam resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cov00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
EKO29_01790
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
cov01002
]
EKO29_01790
09183 Protein families: signaling and cellular processes
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
cov01504
]
EKO29_01790
Peptidases and inhibitors [BR:
cov01002
]
Metallo peptidases
Family M56
EKO29_01790
Antimicrobial resistance genes [BR:
cov01504
]
Gene sets
beta-Lactam resistance modules
beta-Lactam resistance, Bla system [MD:
M00627
]
EKO29_01790
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M56
TonB_C
TonB_2
Peptidase_M48
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZQ82898
LinkDB
All DBs
Position
complement(407393..409351)
Genome browser
AA seq
652 aa
AA seq
DB search
MQESLINNPLLAALAITLIHFLWQGALVALVLKVLLSLISYQKSQLRYALSSMAMLANLI
LPFITFFIVYDIEYRQASNFVDALPLLDQHFYLEQIQANVWYVEWLEYLPAIAMVWLAIV
TTLSLKLIIELYHVNKLPLQGSIAVDKALQIRFDTLINKVGLSKNIVLLLSSKTNVPMAI
GWLKPVVLIPFSMLSGLSPAQLDMLLLHELAHIRRHDYLVNFLQTLVDILLFFHPAVSWV
SKQMRNEREYCSDDIAVQHSGSSVAYAHTLADTASLCQKHRQHTIPNMAMAASGGDLKQR
VVRLLDQQHCTKTTNSGKWLASFTILLTFVFVFSKHMLILPVIDLQSGSISIYNSAKELN
KNTIAYVPLAFEHLKANSSLASQLLAIDSLNTDEKTSSVAEQTVASLPEQKIQSVNIQPS
TLIIETNAVSHKANPDYYNELPIVIAGSSNTKNSVKHHTELKVQTQAKQDIKMSKAKSAA
ELAIESSETKHNSKKTNAYSQQLASLLVEPSTSQSPHFSTLNKAHYAKANRKSLVNGTLN
AANFSPKKANNTTYKYTKQTATDIAAKLINSVEPKYPSSAKRKGIELEIMVEFNIDKNGR
VRDLKFESKSKVNYFRNTIRNAMEKWRFLPAKENGRAVESKMSKIFSFSLLT
NT seq
1959 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaggaaagcttaataaacaatccattattagctgctttagccataactcttatccac
tttttgtggcagggagctttagttgcgttggtgttaaaagttttactgtcgttaatttca
tatcaaaagtctcaattgcgctacgctttgagctccatggctatgctagccaatttaatt
ctgccgtttatcactttttttattgtttacgatattgaatatcgccaagcaagtaacttt
gttgatgccctccccttactcgaccaacacttttatttagaacaaatacaagccaatgtt
tggtatgtggagtggttagaatatttacctgcgattgcaatggtttggttagcgattgtt
acaacactttcacttaagcttatcatcgagctctatcatgttaataaattgcctttacag
ggatctattgcggttgataaggcactacaaatccgctttgataccttaattaataaagtt
gggttatcaaaaaatattgttttattattgtcgagtaaaaccaacgtgcctatggccatt
ggttggttaaagccagtcgtgctgatcccatttagtatgctatcaggtctatcgccagca
cagctagatatgctattactgcatgagctagctcatattagacgtcacgattatttggtt
aattttttacaaacacttgtcgatattttattgttctttcacccagcagttagttgggtt
tcgaaacaaatgcgtaatgaaagagaatactgtagcgatgatattgctgtacaacatagt
ggtagttcagttgcctatgcgcataccctagcagacacagcatctctatgccaaaagcac
cgtcaacataccattccaaatatggccatggcagcatctggcggagatttaaaacagcgg
gttgtgcgtttactcgatcaacaacactgcactaaaacgacaaattcaggaaaatggtta
gcatcttttaccattttattaacctttgttttcgtattttcaaaacacatgctgatattg
cccgttatagatttacagtcaggtagtatttcaatttataactcagctaaagagttaaat
aaaaacaccattgcttatgttcctcttgccttcgaacacttaaaggctaatagctcgctt
gcgagtcaactgttggccattgatagcttaaatacagatgaaaaaacatcaagcgttgca
gaacaaacagtagcgtcattgccggaacaaaaaatacaaagtgttaacattcaacctagc
acactaatcattgaaacgaatgctgttagccataaagctaacccagactattataacgaa
ttaccgattgtgatagccggttcgagcaacacaaaaaattcagtaaaacatcacactgaa
ctaaaagttcaaacccaagctaaacaagatattaaaatgagtaaagcgaagtctgcggct
gaattggccatagagtctagcgaaactaaacataatagcaaaaaaacaaacgcttattct
caacagcttgcatctttattagttgagcccagcacttcacagagtcctcattttagcacc
ttgaataaagcacattacgctaaagctaatagaaaaagtttggtgaatggcacactgaac
gctgcaaattttagccctaaaaaagcaaataatactacctataaatacacaaagcagacg
gccactgatatcgcagcgaaacttattaattcggttgaacctaaatatccttcttcagca
aaaagaaaagggatagagttagagataatggttgaatttaatattgataagaatggtcgt
gtcagagatcttaagtttgaaagtaaaagtaaagtaaattactttcgtaacaccattcga
aacgcgatggaaaaatggcgctttctaccagccaaagaaaatggccgtgcggtagaaagc
aaaatgtcgaaaatattttcgtttagcctattaacgtga
DBGET
integrated database retrieval system