Colwellia sp. Arc7-635: EKO29_04815
Help
Entry
EKO29_04815 CDS
T06022
Name
(GenBank) heme lyase CcmF/NrfE family subunit
KO
K02198
cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
Organism
cov
Colwellia sp. Arc7-635
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cov00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cov02000
]
EKO29_04815
Transporters [BR:
cov02000
]
Other transporters
Others
EKO29_04815
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CcmF_C
Cytochrom_C_asm
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZQ83426
UniProt:
A0A3S9Q3J7
LinkDB
All DBs
Position
1088886..1090871
Genome browser
AA seq
661 aa
AA seq
DB search
MIPELGHFALIIGLAFALCLSIVPLIGVAQNNQQLINSAKPLSFGLFLFVGISICLLAYS
FTVDDFSVKYIAGHSNSLLPYYFKISAVWGGHEGSMLFWVFALTGWTFAVSIFSKQLEKE
FVARVLAIMGMIAVGFILFTLLTSNPFERLLPNFPMEGRDLNPLLQDIGLIIHPPMLYMG
YVGFSVAFAFAIAALMAGKMDAAWARWSRPWTVAAWSFLSVGIALGSWWAYYELGWGGWW
FWDPVENVSFMPWLAGTALIHALAVTEQRNTFKHWTLLLAIFTFSLNLLGAFLVRSGVIT
SVHSFAVDPGRGMYLLVLLAIAVGGSLTLYAIRAANVSSPSRFTFYSRENAILIAMSILV
TATVTILLGTLYPLIIDAMGMGKISVGAPYFNAVFIPMMIALFLFMGIGPLIRWKKARKG
ELSKHLNKISVFSVLFGAAWPFLFAGEFSFSAFVGMSLGCWIVLAVVKDVLNNAKQADGS
WKFSAVPLNHIGMAVAHAGIAITVVGVTMVSTYEKEVNVKMSPGESVNLSGYTIEFAGTK
DVLGPNYSAIQGQINVSLDGEFVTLLKPEQRTYKVQSMGMTEAGIHTTLLRDIYVALGDP
LGQNSWSMRLYYKPFIVWIWLGGFIMAIGGFLAILSKRYRKRVLIKEQKIAQANPTVLQE
A
NT seq
1986 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcccagagctcggtcatttcgcactcattatcggattagcttttgctttatgctta
agtattgtgccgctgattggtgtcgcacagaataatcagcagctaataaatagtgcaaaa
cccctaagtttcggtttatttttgtttgtaggtattagcatctgtttattagcctacagt
tttacggtcgacgatttttcagttaaatatattgctggccattctaatagtttactgcct
tattattttaaaattagtgctgtctggggcggacatgaaggctctatgttgttttgggtt
tttgctttaacaggctggacctttgctgttagtattttcagtaagcaattagagaaagaa
tttgttgcacgtgttcttgctattatgggcatgattgcggttggctttattttatttacc
ttacttacctcaaacccattcgaacgcttattaccaaacttccctatggaagggcgtgac
ttaaatccgttattacaagatattggcttaatcattcatccaccaatgctttatatgggc
tatgttggtttctctgttgcttttgcctttgctattgccgccttgatggccggtaaaatg
gatgctgcatgggctcgctggtctcgtccttggactgttgccgcgtggtctttcttgtca
gtaggtatcgcattgggtagctggtgggcttattacgaacttggttggggcggttggtgg
ttttgggatcctgtagaaaacgtttcatttatgccttggcttgcaggtacggctttaatt
catgccttagctgtaacagaacagcgtaatacctttaaacattggacattattactggct
atttttactttctcattgaatttattaggcgcttttttagtacgttctggtgttattacg
tcggtgcattcatttgcggttgatcctgggcgtggcatgtacttgctagtattattggcg
atagcagttggtggttcattgacgctttatgctattagagccgccaatgtcagcagtcca
agccgctttacattttattctcgggaaaatgctattttaattgccatgtcaatattggtt
acggcaacggtgactattttattaggtacgctttatcctttaattattgatgctatgggc
atgggaaaaatttcggtaggtgctccttatttcaatgctgtgtttatccctatgatgatc
gctttattcctatttatggggattggtcctcttattcgctggaaaaaagcacgtaagggc
gagctgtcgaaacatttaaacaaaatttctgtctttagtgtgttatttggtgccgcttgg
ccatttttattcgccggagaatttagctttagcgcttttgttggtatgagtttgggttgt
tggatcgttttagccgtggtcaaagatgtgcttaataacgctaagcaagccgatggtagc
tggaaattttcagccgtaccattaaatcatattggtatggctgtggctcacgccggtatc
gcgattacggttgttggtgtcactatggtatcgacctatgaaaaagaagttaacgtaaaa
atgtcaccaggtgagagtgtaaacttgtccggctatacgattgaattcgctggtactaag
gatgttttaggtcctaattacagtgctattcaaggacaaattaatgtctcacttgatggt
gagtttgtgacgctattaaagcctgaacaacgtacgtataaagtacaaagtatgggcatg
actgaagcaggtattcataccacgttattacgtgatatctatgttgctttaggagatcct
ttagggcaaaactcttggtcaatgcgtttatattacaaaccctttattgtctggatttgg
ctgggtgggttcattatggcaataggcggcttcttagcgatattaagtaagcgttaccgt
aaacgagtgctgataaaagagcaaaaaatagcgcaagctaatccgacagttttacaagag
gcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
