Colwellia sp. Arc7-635: EKO29_14515
Help
Entry
EKO29_14515 CDS
T06022
Name
(GenBank) marine proteobacterial sortase target protein
KO
K07114
Ca-activated chloride channel homolog
Organism
cov
Colwellia sp. Arc7-635
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cov00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cov02000
]
EKO29_14515
Transporters [BR:
cov02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
EKO29_14515
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VIT
VWA_3
VWA_2
VWA
VIT_2
vWA-TerF-like
VWA_CoxE
DUF2201
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZQ85086
LinkDB
All DBs
Position
3357079..3359259
Genome browser
AA seq
726 aa
AA seq
DB search
MFNSNKKIILNDYQDSYFYRQKRSKKRIKFLKFILLFVILSVAIALIAPLTRAETVTNLF
NNPIINTNNAIANEEGTQGLLAVDNALIHGPQLIFDHPNGNKRVALPVDITANIEVSGLV
AYAKIQQVFINPYDMALEGKYQFPLPENSAVKHLKVKMADKEIIGEIMEKQAAKEVYNQA
KKQGKKASLVQQQRPNLFTNNIANIPAQSRVVVTLEFIMPVTFTDHTASLTLPLVMTARY
QSENSQKSPAQQNTTFIAPMAKMLADSQAAINVTLNAGTGVSNINSTSHKIKSKVLNNEQ
SSYLITLLDTQALANRDFTLNWQLQPNSTAQVSSFTEQVGNEYFTLLTFFPPQIEPAETL
ARDIIFIIDTSGSMQGNSMAQAKTSLEQAILQLNEKDSFNIIAFSNTVDLLFPTTNMASQ
RNVGKAQQFIDHLQADGGTEMYRPLSQALVMAKDSKQTAQAIRQVVFITDGAVANEFELM
QLLDGAQRNFRLFTVGIGAAPNGYFMKKAAQFGRGSYVFIQNSDDVQTKMSALMTKINHP
AITNIELLFDNQIHQQVDVYPKRIADLYIGEPMQVTVKSALPITSIQIMGDTAALPWYQQ
LIIDDSQSSHGISTLWARRKIEDLLDSLVTGADKEQVKEQVIRTSIAHQTLSPYTSFIAI
EKQPELMPLTAKTSEKNAKLKMNALAKAHENLMVAMPKTALGWHQQLFFGLLLILLAPLT
LRVWSK
NT seq
2181 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaactcaaataagaaaataatactaaacgactaccaagactcctatttttatcga
caaaagcgcagtaagaaacggattaagttccttaaatttatattacttttcgttatattg
tctgtcgcaatcgcgctgattgctcctctaacacgtgctgaaacagtcactaatttattc
aataatcccatcataaataccaacaacgcaatagcaaatgaagaaggtactcaagggttg
ctggccgtagataacgctttaatacatggtccacagttaatatttgatcatcctaatggc
aacaagcgtgtagcattacccgtcgacataaccgctaatattgaagtcagtggtttagtg
gcttacgctaaaatacagcaagtatttatcaacccttatgatatggcacttgagggtaag
tatcagtttcctttaccggaaaactctgcggtaaagcacttaaaggtaaaaatggctgat
aaagaaattattggcgaaataatggagaaacaagctgcaaaagaagtttataaccaagcg
aaaaaacagggcaaaaaagcaagtttagtacagcaacaacgaccgaacctcttcactaac
aacattgctaatattccagcacaatcaagggttgtggtaactttagagtttatcatgccg
gtaacatttacggatcacaccgcaagtttaacactacctttagtcatgaccgctcgttac
cagagcgagaatagccaaaaatcgccagcacaacaaaacacgacctttattgcacccatg
gcaaaaatgctggccgatagccaagcagcaatcaatgtaacgcttaatgccggcacgggc
gtatctaacattaatagcactagccataagataaaaagcaaagtattaaacaacgagcaa
tcgtcatatttaattacgctattggacactcaagcgctagcaaatcgtgactttaccttg
aactggcaacttcagcccaatagcaccgcacaagtcagcagcttcaccgagcaagtgggt
aacgaatacttcactttgctaacattttttccaccacaaattgagccagcagaaacgtta
gcacgtgacattattttcattatcgatacttcagggtcaatgcaaggcaactcgatggca
caagcgaaaactagtcttgaacaagctattttacaattaaacgaaaaagacagtttcaac
attattgcctttagtaatactgtcgatttactgtttcctacaacaaatatggcatcgcag
cgtaacgtcggtaaggcacagcaatttattgatcatttacaggccgatggtggcacagaa
atgtatcgaccattaagtcaggcccttgtcatggcaaaagatagcaagcaaacagcacaa
gctattcgacaagtggtttttatcaccgatggcgcggtggccaacgagtttgagcttatg
cagctgcttgacggtgctcaacgcaattttcgactatttaccgtaggtattggcgccgct
cccaatggctatttcatgaaaaaagccgcccaatttggtcgtggcagttatgttttcatt
caaaatagtgatgacgtacaaaccaaaatgtcagcactgatgacaaaaatcaaccaccct
gccatcaccaatattgaactgctatttgataatcaaattcatcaacaagttgacgtttat
ccaaaaagaattgctgatttatatatcggcgaaccaatgcaagtcacggtgaagtcagcc
ttaccgatcaccagtatacaaattatgggcgacaccgcagccctgccttggtatcaacaa
cttattattgatgacagtcagtcttctcatggcatatcaacgctttgggcacgccgaaaa
atagaagacttgttagattccttagtgactggtgccgataaggaacaagtaaaagaacag
gtgattagaacctctatcgctcatcaaacgttatcgccatacaccagttttattgccata
gaaaaacaacctgagcttatgcctttaacagctaaaactagtgaaaagaatgcaaaacta
aaaatgaatgctttagccaaagctcatgagaacttaatggtcgctatgcctaaaacagca
cttggttggcatcaacagttatttttcggtttgttactgatactacttgctcctttaacc
ttgcgtgtttggtcgaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
