Colwellia sp. PAMC 20917: A3Q34_06270
Help
Entry
A3Q34_06270 CDS
T04511
Name
(GenBank) polysaccharide biosynthesis/export protein
KO
K01991
polysaccharide biosynthesis/export protein
Organism
coz
Colwellia sp. PAMC 20917
Pathway
coz02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
coz00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
A3Q34_06270
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
coz02000
]
A3Q34_06270
Transporters [BR:
coz02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
A3Q34_06270
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLBB
SLBB_2
Poly_export
Caps_syn_GfcC_C
LysM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOW76498
UniProt:
A0A1D8RTT0
LinkDB
All DBs
Position
complement(1470583..1473282)
Genome browser
AA seq
899 aa
AA seq
DB search
MMNITRYLIATFLLFALSLNLHAQQVSAQQIEQFKKLPKSQQQALAKSMGVDLNAIEAQL
SGSNTQNAPINTQVMPRDINSLNNENLKAKDAEETEKAEAIFKTLPRFGLDVFANSPTTF
SPVMDIAIPEGYILGTGDSVSIQVFGKENREMQLTVTREGELVFPNLGPISVAGLTFSEL
KTFVVNKIQQKIIGVNVVVSLAELRSMRIFVLGEAYKPGPYTLSSLSSVTHAIFAAGGVS
DIGSLRNIQVKRSGKLIQQVDLYDLLIEGDSSSDILLQSGDVVFIPPQGKSVSIAGEVRR
PAIYELSQSDDFSNVIKMAGGLLPAAYPKSTIVERYNKSDLRSILNIDLSDKTQKTEKVQ
AGDFIRVLKSSDLYVDSITLIGAVARPGKYQLQQNMLLSDVITNADAHLLPYADLNYGIV
VREIDSARNIEILQFNLANVFADKNSKSNIQLSSNDKIIIFSKAFKFSEEQFLLDELAYT
QEELLAKERNLAIETSKKKEFWETHEQNDVMAETKDEKIYTSIDNIDSGAEHENVTIREM
ALFSRQRLLVPIVNKLRYQAGAGEAVKLIEIDGEVKFPGVYPLGKGARVIDLILAAGGVK
ESAYLSRAELTRNEMSGINSVKTSKNIHLVNALNNIDEDNILLKSKDRLNIHRIPSWSEN
HVIELRGEVLFPGKYTVRRGDSLSSIILKAGGLTAFADPNGSVFSRTKLKQLERQNLMKV
SADLRIEMATKSLSSNSGVTSYSEIQSLLADLSKVEPLGRLVINLPQVIAKNDYDIAIEG
GDVLYIPTQNRSINVMGQVQVNSSHMFDSSSSVEDYITQSGGLKKRADDERIYIISSNGS
IQMFEESNWFSGGADSALKPGDSIVVPLDSEYMNNLTLWTTATTIMYNTAVAIAAISGL
NT seq
2700 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaacattactcgctatcttatagcaacctttttactttttgcgctttctttaaat
ttacatgcccagcaagtgtctgctcagcaaattgaacaatttaaaaagttacctaaatct
caacaacaagcattagccaaaagtatgggcgtcgatttaaatgctattgaggctcagtta
tcaggaagtaatacacaaaacgctcctattaatacacaggtaatgccacgcgatataaat
agcctgaacaatgaaaaccttaaagccaaagatgccgaagaaacagagaaagctgaagcc
atttttaagaccttgccacggtttggtttagatgtctttgcaaattcgccaacaacattc
tcaccggttatggatattgccattccagaagggtatatcttaggtacaggagactcagtt
tcaatacaggttttcggtaaagaaaatcgtgaaatgcaattaacggtgacacgtgaaggt
gagttggtttttcctaacctgggccccattagcgttgcgggattaacattttcagaatta
aagacttttgttgttaataaaattcaacaaaaaattatcggtgttaatgtggtggttagc
ttagccgaattacgctctatgcgtatatttgttttaggtgaagcatataaacccggcccc
tatacgttaagttcattatcttcagttacccatgccatttttgctgcaggtggtgtcagt
gatattggctcattaagaaatattcaagtaaaacgttcaggaaagctaattcaacaagtc
gatctatatgacttattaattgaaggtgattcatcaagtgatattttgttgcaatcaggc
gatgtggtttttattccccctcaaggcaagtctgtgtcaattgccggcgaagttagacgt
cctgctatttatgaattgagccaatcagacgacttttctaatgtcattaaaatggctggc
ggacttttacccgcggcttacccaaaatctaccatcgtagagcgttataacaaaagcgat
ttacgcagtatcctaaatattgatttatctgataaaacccaaaaaactgaaaaagttcaa
gcgggcgattttattagagtgttaaaaagctcagacttatatgtcgattcaattacttta
ataggcgctgtagcgcgtccaggtaaataccagttgcaacaaaatatgttgttatccgat
gttattaccaatgctgacgctcacctattaccttacgccgatttaaattacggcattgtc
gttagagaaattgatagtgcccgtaatattgaaatattacagtttaatttagccaatgtt
tttgctgataaaaattctaagagcaatattcaactcagcagtaatgataaaattatcatt
ttttctaaagcctttaagttttctgaagagcaattcttattagacgagctcgcctacact
caagaagagctattagcgaaagaaagaaatttagcgattgaaacgagtaagaaaaaagag
ttttgggaaacccatgagcaaaatgatgttatggctgagaccaaagatgaaaaaatttat
acctctatcgataatattgacagtggagcagagcatgaaaatgtcactattcgtgaaatg
gcattgttttctcgccaacgtttactggtacctattgttaacaagcttcgataccaagca
ggagccggtgaagcggtaaagttaattgaaattgatggtgaagttaaatttccaggggtt
tatccattagggaaaggggctcgggtaatcgatttaattttagccgccggcggcgtaaaa
gagtcagcttatttatcaagggctgagttaacacgtaatgaaatgagtggtattaactct
gtaaaaacctctaaaaatattcatttagtgaatgccctcaataatattgatgaagataat
attttgctaaaaagtaaagatcgccttaacattcaccgtatcccttcatggagtgaaaac
catgttatagagttgcgcggcgaagtgctttttccgggtaaatacacagttcgtcgtgga
gacagcttatcaagtattattcttaaagcgggaggcttaaccgcttttgcagatcccaat
ggctctgttttttcaagaacaaagttaaaacaacttgaaagacaaaacttaatgaaagta
agtgccgacttacgtattgaaatggcaactaagtctttatcaagcaacagtggggtaact
tcatatagtgaaattcaatcgttattagcagacctctctaaggtagagccgctagggcgt
ttagttattaatttaccgcaagttatagccaaaaatgattatgatattgcgatagagggc
ggcgatgtactgtacatccccactcagaatcgttcaattaatgtcatggggcaagtgcaa
gtaaatagctcacacatgtttgactcatcaagcagtgtcgaagattatataacgcaaagc
ggtggcttaaaaaaacgtgctgatgatgagagaatttatattatttcatcaaacggtagt
atccaaatgtttgaagaaagcaattggtttagcggcggtgctgactcagctttaaaaccg
ggtgattcaattgttgtaccacttgattcagagtacatgaacaatttaaccttgtggaca
acagcgacaaccattatgtataacacagcggttgccatagcggcaattagtggactttaa
DBGET
integrated database retrieval system