Colwellia sp. PAMC 20917: A3Q34_17665 Help Entry A3Q34_17665       CDS       T04511                                  Name (GenBank) ligand-gated channel protein   KO K02014   iron complex outermembrane recepter protein Organism coz  Colwellia sp. PAMC 20917 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:coz00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:coz02000]     A3Q34_17665 Transporters [BR:coz02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    A3Q34_17665 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  TonB_dep_Rec_b-barrel Plug STN Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AOW78508 LinkDB All DBs Position complement(4122142..4124994) Genome browser AA seq 950 aa AA seqDB search MCTCLIFTSGAFAESLINFTVKEQRADKALISFALQANKTILFSYDLTKEHYANELKGKY SVKDGLQQLLKNTNLTAVIDNAGQLSIKLHKHLRSNITMNKSTMLKAALVPLMLSAASQT ALAQEPAQVSEQEVEKISVIGSRVAGRSAEDLPVPVDILSAEALLNTGQTEVGRMLQAIA PSFNFSSSSISDGTDALRPATLRGLGPDQTLVLINGKRRHQASLIHINTSVGRGTAGTDM NAIPAASIKRIEVLRDGAAAQYGSDAIAGVINIILKDQSEGGSVGVSYGENSAGDGETTN IDISKGFALGDNGFLNTTLNIRDRGYSDRAGLHGSCQFSGCTQLDNGDLLLGDPREATAT RETFRIGDADSEQIGLTINTGYDLADGHLYGFVTYSSRDNESAAFFRHNANGGGNAQLQD GDATIPAGFLPKINTEIKDISYNFGYKTEFSNDSSLDLSYTYGENNIDYTTRDTINSSYA NSLIYTSALSANEIRSSIPREAFAYGLELTLQTINMDYTQNFDWFSLAMGTEFRTDEFRV KAGDEYSYRDYDTDELGNSLYATDRSAGTQGFGGTAPLQSVDESRDVISFYIDTEAEVTD NLIISTAVRYDDYDGFGDSTNFKLAANWSITDDVSLRGATSTGFRAPSMQQLYTDNISTQ FQTNPNGGDQIAVQIGTFRNDSILAQAIGIPELKEEVSTNFSIGSVVRVTEEINLTVDFY SIEIEDRIVLSNSLGNGLSSALDAALVSSGAGAGQFFLNGADTKTKGVDIIATWNTEVMS GTLDLTFAANFSETEVTDTYTPAGSALGGISPEDVFSEQAISIIEEWQPQDRISLSGLYK IGDFTVNLAFNRYGEYTVLDGERQTYGAEVLTDLRVNYQFNDELSFNFGGNNIFDVYPDK NEIGNSRSGTIVDANGNVVVSSPGVFTYSRRSAPFGFNGAYFYAGAEYRF NT seq 2853 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atatgtacctgtcttatattcacgtctggagcatttgccgaaagcttgatcaactttaca gtgaaggaacagcgtgctgataaagcgctcatttcatttgcattacaggcaaataaaacg attttattttcctatgacttaacaaaagaacattatgcaaatgagttaaagggcaaatat tcggttaaagacggtttacaacaacttttaaaaaacaccaacttaaccgctgttatagat aacgctggtcaactgagcataaaactacataaacatctcaggagtaatataacaatgaat aaaagcacaatgctcaaagcagctttagttccactaatgctaagcgcagcaagtcaaaca gcacttgcccaagagcctgctcaagtcagtgaacaagaagtagaaaaaatttcagttata ggaagccgtgttgctggtcgttctgcagaagacttacctgttcccgtagatattttgtct gctgaagctttgcttaacactgggcaaacagaagtcggtagaatgttacaagccatagcc ccatcatttaacttttcaagctcatcgattagtgatggaactgatgcattgcgccctgct accttgcgtggcttaggtcctgatcaaacattagtgttaatcaacggcaaacgccgccat caagcgagtttaattcacattaacacctcagttggacgtggtactgctggtacagatatg aatgctattcctgccgcatctattaagcgtattgaagtattacgtgacggcgccgctgct caatatggttcagatgcaattgccggtgtcattaatattattcttaaagatcaaagtgaa ggtggaagcgttggtgtttcttatggcgaaaactcagctggcgatggtgaaactacaaat attgatatttctaagggttttgcacttggcgataatggcttccttaataccacgttaaat atacgtgatagaggctactctgacagagcaggcttacatggttcatgtcaattttcaggc tgtacccagcttgataatggcgatttattattaggcgacccgcgtgaagctaccgccact cgtgaaacatttcgtattggcgacgcagactctgagcaaatagggctaacaataaatact ggctacgatttagctgatggtcatttatatggttttgtgacttattcaagccgtgataac gaatcagcagctttctttcgccataatgcgaacggcggaggtaacgcacagcttcaagat ggtgatgcaactattcctgctggatttttacctaaaatcaatactgaaataaaagatatt tcatacaactttggttataaaactgaatttagtaatgattcatcattagatttatcatat acctatggtgaaaacaatattgattacacgactcgggatacaataaattcatcttatgct aattcactcatctacacctcagcactatccgctaatgagattcgtagctcaattcctcgc gaagcgtttgcttacggcttagaactcaccttacaaactattaatatggattacactcaa aattttgattggttttctttagctatgggtaccgagtttcgcacagatgaatttagagta aaagccggtgatgaatattcataccgagattatgataccgatgaactcggcaatagctta tatgcaacagaccgcagtgcaggaacacaaggatttggtggtacagccccactacaatct gttgatgaatctcgtgatgtaatttctttttacatcgacacagaagcagaagtcactgat aacctaattattagcacagcagttcgctacgatgattacgacggttttggtgatagtact aatttcaaacttgctgctaattggtcaattactgatgatgtatcattacgtggcgccaca agtactggctttagagctccgtcaatgcaacaactttatactgataatattagtactcaa ttccagacaaatcctaatggtggtgaccagattgcagtacaaattggtactttccgaaat gacagtattctagcgcaagctattggtattcctgagctaaaagaagaagtatcaaccaac tttagtattggctctgttgtgagagttaccgaagagattaatttaactgttgatttttat tctatcgaaattgaagaccgcattgtgttaagtaattcattaggtaacggattatcgtca gcacttgatgcggcattagtttcatctggagcaggtgcagggcaattctttttaaatggt gctgacactaaaacaaaaggtgttgatattatagcaacatggaatacagaagtgatgtct ggcacattagacttaacatttgccgcaaatttctcggaaacagaagttactgatacttat actccagcaggtagcgcattaggtggaatttcacctgaagatgttttttcagagcaggcg atttctattattgaagaatggcaacctcaagaccgcataagtttaagtggattatataaa attggtgatttcacagttaacttagcctttaatcgttacggtgagtacacggttcttgat ggtgaaagacaaacgtatggcgctgaagtattaacagatttacgcgtgaattatcaattt aacgatgagctttcatttaacttcggtggaaataacatttttgatgtgtaccctgataaa aatgaaataggaaattctcgctctggcactattgttgacgccaatggtaatgttgtcgtt agtagtcctggtgtgtttacttattcacgccgttcagcaccttttggttttaatggtgcc tatttctacgccggtgctgaataccgtttctag

DBGET integrated database retrieval system