Clostridium pasteurianum DSM 525 = ATCC 6013: CPAST_c01640
Help
Entry
CPAST_c01640 CDS
T03811
Name
(GenBank) helicase, SNF2/RAD54 family protein
Organism
cpae
Clostridium pasteurianum DSM 525 = ATCC 6013
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
ERCC3_RAD25_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJA46264
UniProt:
A0A0H3IZ09
LinkDB
All DBs
Position
165280..168549
Genome browser
AA seq
1089 aa
AA seq
DB search
MFDIKEETVKYWVDDLVYKKAEDYYKNDKVKSINVTKNYNKSLNINETKIESVVMGEDKK
FSNEILFNDKTGVNSVKCECREFHNYNLNDRICPHLAAAMFKYIRDKSSITGHINSIRTK
LLIDQIKNGMISVETNKKKLSLEIKLEITPWSEKGSNLQLKIGEDRLYVVRNMREFISAY
IGKGENIEFGKGFTFDSNIHYFDEEDKKIIDIIEEIYEDDKRNLQMEYSYYNNSNRILVG
KRAHLTDIKVKRFLDIIENREINVILKGEEYKNVKVIQKDIPLEFELLHNNNEIELIQKG
SIPSPVTINGEYFFYEGFIYKVEEKKRNLYIPFYNTFLKEKKNVIKFDLEDSEKIASYVI
PGLEKITDNVVIDTSLQEKFYKEPLNVKVYLDRSNDMVMAKIKFCYGNIIINPLSKDSGR
LKNSILIRDVETELSIIKLFKSYKFQKYGDEFINNEEEQIVDFLNDGVKELQDFCEIYYS
NSFKNFKIYGTSYYSGGIKLNENDLLEFNFEIEGVEKSELKNIFEALRQKKKYYRLKKGG
FVPLESEEIKNIGNMIDFLDIKDSQLQKDKIIIPKYNSMYIDENIKLHNMDYIKRDNKFT
QLINSIKYVKDIDFFVPKELERIMRKYQKFGFKWLKSLARCGFGGILADEMGLGKTLQVI
SFLASEKKSGNNIPSIVICPTSLVYNWLSEIQRFYPDLKVLVISGSREERKNSIENYKGH
DILITSYPLIRRDIEYYHSIDFKYCILDEAQQIKNPNSINAKSVKEIKAENYFALTGTPI
ENSLTELWSIFDFIMPGYLMSHTKFIKKYEAPIVKGNDKNSLGELNKHIRPFILRRLKSE
VIKELPPKIEHKITVEMAEEQKKVYAAYLQNAKEQIDSNIKEKGFNKSKLMILSILTRLR
QICCDPSIFIENYKGDSGKLAALDNIIDNSINSGHRILLFSQFTSVLKNIGTFLSEKNVE
YMYLDGQTKMEERGHMVNEFNKGKGDIFLISLKAGGTGLNLTGADVVIHYDPWWNPAVEQ
QASDRAHRIGQKKTVEIIKLIAMGTIEEKIYDLQEKKRDIIKSVMDSENSEETIISKMSE
EEIRELLTS
NT seq
3270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgtttgatatcaaagaggaaactgtaaaatattgggttgatgatcttgtatacaaaaag
gcagaggattattataaaaatgataaagtaaaaagtataaatgttactaaaaattacaac
aagagtcttaacattaatgaaaccaaaatagaatctgtagttatgggtgaggataaaaag
ttttcaaatgaaatattatttaatgataagactggggttaatagtgtaaaatgtgagtgc
agggaatttcataattataatttaaatgatagaatctgtccacacttagcggcagctatg
ttcaaatacataagagataagagtagtataactggacatataaattccataagaacaaaa
ttactgattgatcaaataaaaaatggaatgataagtgtagaaaccaataaaaaaaaattg
agcttagagataaagttggagataactccatggtctgaaaaaggttcaaatcttcaattg
aaaattggagaagatagattgtacgtagttaggaatatgagggaatttataagtgcttat
attggtaaaggcgaaaatatagagtttggaaaagggtttacctttgattcaaatattcat
tattttgatgaagaagataaaaaaattatagatattatagaagaaatctatgaagatgat
aaaagaaatttgcaaatggaatattcctactataataatagcaataggattttagttggt
aaaagggcacatcttacagatataaaggtaaaaagatttttagatataatagaaaataga
gaaataaatgtaattttaaagggtgaagaatataaaaatgttaaagttattcaaaaagat
atacctttagaatttgagttgctacataataataatgaaatagaacttatacaaaaaggc
agtattccctctcctgttactataaatggagaatattttttctatgaaggatttatctac
aaagtagaagagaaaaaaagaaatttatatatacctttttataatacatttcttaaagaa
aaaaagaatgttataaaatttgacttagaagacagcgaaaaaattgcttcctatgtaata
ccaggtctggaaaaaataacggataatgtggttatagatacaagccttcaagaaaaattt
tacaaggaaccattaaatgttaaggtatacttagatagatcaaatgatatggtaatggca
aaaattaaattttgttacggaaatataattataaatcctttgagtaaagatagtggcaga
ttaaaaaattccatacttataagagatgtagaaacagaattaagtataattaaactattt
aaaagttataagtttcaaaaatatggtgatgaattcataaacaatgaagaggaacaaatt
gttgattttttaaatgatggtgtaaaagaattacaggatttttgtgaaatatactattca
aactcctttaaaaattttaagatatatggtacttcttattattcaggaggaataaagtta
aatgaaaatgatctattagaatttaactttgaaatagagggcgtagagaaaagtgagctt
aaaaatatatttgaagctttaagacagaaaaaaaaatattatagattaaaaaaaggagga
tttgtacctttagagtcagaggaaataaaaaatataggaaatatgatagattttctagat
ataaaagattcccaattacaaaaggataaaattataattcccaaatacaattcaatgtac
atagacgaaaatataaaattacataatatggactatattaaaagagataataaatttact
cagcttataaacagtataaaatatgtaaaagacatagatttttttgttcctaaagaactt
gaaaggatcatgagaaaatatcaaaaattcggttttaagtggttgaaatctctagctaga
tgcggtttcggaggtatattagcagatgaaatgggacttggaaaaactctacaggtgatt
agctttttagcttctgaaaaaaaatcaggaaataatataccaagtattgtaatatgtcca
acttctttagtttataactggctttcagaaattcaaagattttatccagatctaaaagtt
ttagttatatctggatcaagagaagaaagaaaaaattctatagagaattataaaggtcat
gatattttgataacatcttatccgcttataagaagggatattgaatattaccattctata
gattttaagtattgtattttagatgaagctcagcagataaaaaatcctaattctattaat
gcaaaatcagtaaaagagataaaggcggaaaattactttgcccttactggaacccctatt
gaaaattcccttacagagctttggtccatatttgattttattatgccgggatatcttatg
tcacatactaaatttataaaaaaatatgaagcacctattgtaaaaggaaatgacaaaaat
tccttaggggaactaaataagcatataagaccttttatattaagaaggcttaaaagtgaa
gttataaaagaacttccccctaaaattgagcataagataactgtagagatggcagaggag
caaaagaaggtatatgctgcatatctgcaaaatgctaaagaacaaatagatagtaatatt
aaagaaaagggatttaataaaagtaagcttatgatactgtctatattaactaggttaagg
cagatttgctgtgatccctctatatttatagaaaattataaaggtgacagcggaaaactt
gcggcgttagataatataattgataatagtataaattcaggtcatagaatattgctattc
tcacagtttaccagtgtattaaaaaatataggaacatttttaagtgaaaaaaatgtagag
tatatgtatttggatggacaaacgaagatggaagaaagaggtcatatggtaaatgagttt
aataagggaaagggagatatatttcttatatctttgaaagcaggaggaaccgggcttaat
ttgacaggagcagatgtagttatacactatgatccttggtggaatcctgctgttgaacaa
caggcctctgacagggctcataggattggtcaaaagaaaacggtagagataataaagctt
atagctatgggaactattgaagaaaagatatatgatcttcaagagaagaaaagggatata
ataaagagtgttatggatagtgaaaattctgaggaaactataatttcaaaaatgtcagaa
gaagaaataagggagttattgactagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
