Carica papaya (papaya): 110823882
Help
Entry
110823882 CDS
T05151
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
cpap
Carica papaya (papaya)
Pathway
cpap03015
mRNA surveillance pathway
cpap03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpap00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
110823882
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
110823882
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
cpap03041
]
110823882
Spliceosome [BR:
cpap03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
110823882
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
zf-RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110823882
NCBI-ProteinID:
XP_021910071
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
493 aa
AA seq
DB search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NT seq
1482 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctggggtatacggtggtcaggatggcggcgatggtaccgctccatcctacggtgat
ggcggatatggtggacccggtggttacggtggtggtgggggatatggaggaggcggcggt
ggaggaggatatgatggtggcggtggcggtggctatggaggacgaggtgatggtggttat
ggtggaggcggtggtggtcgtagtggaggtcacggtggtcgtggcggcggatatggagga
ggtggtggcagaggaaatcgaggaggtggaggagcataccaaggcggggaccgcggtggc
cgaggaggtggtggtagaggtggtggccggggaggtggaagcggcagggacggtgactgg
ctttgccctaaccctagctgtgggaatttgaactttgccagaagagttgagtgtaacaaa
tgtggtgcaccctctcctgcgggtgctggtgatcgtagtagcaacatgggtggtagtggt
ggtggtggttataacaggggtggaagcggtggcggttatggtggtaatcgtggtggtagg
ggtgatggtggtaggaataataactatgacagtggaagaggtgatggtggtaggagcaac
aactatgatggtggccgatatgatgggaggagtggaggcaatagagatagttcatatggt
ggtaatcaaggaagggatgatggtggttatggccaggttcctccacctgtcatcccatct
tatggcggttctgggggaaactatccaccaccacctaatgcttatggtgggaatgaaaat
tatggaatggaagcagttcctccaccagtaagctatactggtggcccaacatcatatccc
ccatcttatgggggtcctgcggggggctatggtggcgatggcccaggtgatgcaaggagc
ggtggtagaggtggccctcctggtgggttcgatggtgggtatggcgctggtggtccacga
catcagggaggtggttatggtggagcttctgttgatccccctgttaaagtcaagcagtgc
gatgagaattgtgatgattcttgtgacaattcaagaatatacatctcaaatctgcctcca
gatgttactactgaagagctgagggaactttttggtggaattggacaagttggaagaatc
aagcagaagcgtggctataaggatcagtggccatggaatattaaaatatacaccgatgag
aagggaaataataaaggcgacgcatgcttggcttatgaagatcctggggctgcccactct
gcgggtggcttttacaacaattatgatatgaggggttataaaatcaatgttacaatggca
gagaagtctgcgccaagggctccgccagcatatgaccacaggttgcttctctatccatgg
caggacatcatttggattgctgctttttgtttaagcttgttgcgtttttcagccattgtt
tttgcttatatgtgctatttcttgtggttctacatttgttaa
DBGET
integrated database retrieval system
