Clostridium pasteurianum BC1: Clopa_1828
Help
Entry
Clopa_1828 CDS
T02645
Name
(GenBank) PMT family glycosyltransferase, 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase
Organism
cpas
Clostridium pasteurianum BC1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PMT_2
YkcB_C
STT3
COA2
DUF4388
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGK96730
UniProt:
R4KAR5
LinkDB
All DBs
Position
1871039..1873408
Genome browser
AA seq
789 aa
AA seq
DB search
MKKIKFTKETIALIVIILISAILNFVNLGIEGYSNSYYTSAVKSMTMSLKNFFFVAFDPA
GFVTIDKPPVGFWFQAISAKIFGFNGVSILLPSALASVISVILIYKIVKRAFGSIAGLIS
ALFLAITPVFVAVSRNNTIDNILILFLLLACWMLSIAAEKGKFKYIILSMILVGVGFNVK
MLQAYLVVPAIYITYLLATTISIKRRIINIVAGTVVLLAVSLSWAMVVDSVPTSSRPYID
SSTNNTVLELIIGHNGAERFSLSSSDNGNGGGGAPGGMPRQGQSDGGSQRGGFNGNFKDM
PGNPPSGNGSSTSSSGQSDNSQTDTSQSQNEGNNGNFGGFNGGTGNGQNPGGFGGGPNGG
EQGRGSSGGGSSQLQGAFGGETASGLTRLFSKNILSDQIVWFIPLAVIGFIAAAIREKLK
FKLDNKRKQSLALWFLWFLPEFIYFSFNKGTFHSYYLTMLAPPIAALAGIGITSMWKLYK
EGGRKAWFLPVALIVNGAVHLLMLYYFINSSNIIKILIILVSILSIIPAIILSMLNVLNK
EKVNIEEREKNWSLNNRFNLKKTLVSLSIVGLLITPFVGSSAVLTTKLNGSFPAAGLELL
SSNNQQGPGAGGFQGQGMTASNGDTKLIELLQKNKTAKQKYLLVVSNSNSAADIIINTGE
PVMSLGGFLGNNKAITLEQFKKLVVNGEVRYVMVGGMGQGNGSSEIMNWVKQNGKLVSSS
EYSDSSRAQTNADNNISSTTNSQASVDNTNTTENNEAAGNEESNAMDNRRGGNLSQQLYD
LKSYTDSNN
NT seq
2370 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaataaaatttacgaaagaaacaattgcactaatagtaattatattaatatct
gccatattgaattttgttaacttaggtatagaaggatatagtaattcttactatacttca
gctgtaaagagtatgaccatgagccttaaaaatttcttctttgtagcttttgatccagct
ggctttgtaactattgataagcctcctgtgggtttttggtttcaggcaatatctgctaag
atatttggatttaatggagtaagcatattgcttccgtcagcattagcaagcgtaatatcg
gttatattgatatacaaaattgttaaaagagcctttggaagcatagcgggattaatttca
gcgttatttcttgccataacacctgtttttgtagcagttagtagaaataataccatagac
aatatacttatactgtttttattattggcatgttggatgctttccattgcagcagaaaag
gggaagtttaaatatatcatattaagtatgatacttgtaggtgtaggatttaatgtaaag
atgcttcaggcttatcttgtagtcccagctatatatataacatatcttctagctactaca
atttccataaagagaaggattattaatattgtagctggaaccgttgtactgttagcagtt
tcactgtcctgggcaatggtggttgattccgtacctacctccagtagaccttatatagac
agcagtacaaataatactgtactggaacttataattggtcataatggagctgaaagattt
tctctcagcagttctgataatggcaatggtggaggaggtgctccaggagggatgccgaga
caaggtcaatcagatggaggttctcagagaggtggatttaatggaaattttaaggacatg
ccgggaaatccaccaagtggcaatggaagcagtacaagttcctcaggtcaaagtgacaat
agtcagactgacactagccagagtcagaatgaaggcaataacggcaattttggcggattt
aatggtgggacaggaaatggacaaaatccaggaggatttggaggtggccccaatggtggt
gaacagggaagaggatcatcaggaggaggttcatcacaacttcaaggtgcttttggtgga
gaaacagcctcaggtcttacaagactattttctaaaaacatactttcagatcagatagtt
tggtttataccattagctgtaataggatttatagcagcagctattagggaaaagttaaaa
tttaaactggataataagaggaagcagtctttagcattgtggttcctttggtttttacca
gaattcatatatttcagctttaataaaggaacattccattcctattatttaacaatgtta
gcaccaccaatagcggctttagcgggaataggaattacttctatgtggaagctgtataaa
gagggcggacggaaagcttggttcttaccagtagccttgatagttaatggcgcagttcac
ttacttatgttatactatttcattaattcatctaatattataaaaatattaataatatta
gtatcgattttaagtattataccagctataatacttagtatgttgaatgtattaaataaa
gaaaaagtaaatattgaggaaagggaaaaaaattggagtctgaacaatagatttaattta
aagaaaactctggtatcattatccatagttggtcttttaataactccctttgttggatct
tctgctgttttaactactaaattgaatggatcttttccagcagcgggtttagaactgtta
tcaagtaataatcagcagggaccaggtgctggcggttttcaaggccaaggtatgacagct
tctaatggagatacgaagcttatagaacttttacagaaaaataaaacagctaagcaaaag
tatttgcttgtggtttcaaattctaattccgcggcggatataataatcaacacaggggaa
cctgtaatgtcacttggtggtttccttggcaataataaggcaattactttggagcaattc
aagaaactggttgttaatggagaagtaaggtacgtaatggtaggtggcatggggcagggt
aatggaagcagcgaaataatgaattgggttaaacaaaatggtaaacttgtttcttcaagt
gaatatagtgactcaagtagagcgcaaacaaatgcagacaataatatatcaagtacaact
aattcacaggcatcagtggataatacaaatactactgaaaataatgaggctgctgggaat
gaagagagtaatgctatggataataggagaggtggaaatttatcacagcaactttatgat
ttaaaatcatatactgactccaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
