Clostridium pasteurianum DSM 525 = ATCC 6013: CLPA_c33390
Help
Entry
CLPA_c33390 CDS
T03753
Name
(GenBank) diguanylate cyclase
Organism
cpat
Clostridium pasteurianum DSM 525 = ATCC 6013
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_12
TPR_2
TPR_8
TPR_1
GAF_2
GAF
ANAPC3
TPR_MalT
ARM_TT21_4th
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJA53393
UniProt:
A0A0H3JBA8
LinkDB
All DBs
Position
3599004..3600554
Genome browser
AA seq
516 aa
AA seq
DB search
MINSDNATTINEILEKLDKIKYENSINTIKFGNNSYELCKKFNHTIGMAVSLLRVGEALT
NIGNYEKSLSLLFESLSISRKEDICDIQVLSLIYIGNNLLNLGDYEKSFDYYNDAEKTAL
KMSVNKNYYSKYNYKFYLAKTSTNIGEIYKNLKDYENAFKFYNRALTFDKKLNYKSTFGV
SLYNLGEMNYLSGNYDKAILLLNKSIEIMNSFNYKLVLPEVYRILALIYEKKGNFTKSNE
YFCKALNIDLKETFLFYKINILLDYSDYLKNRGNLSLALDKLKIAFNISVENNIIFKTIE
VCKKLFSLYEELKNDDKAYEYYKLYFKYHDKLEKVICTQRLNNINSKIKLQKLEEEKLNI
MKKSENFRKRFEKLIESIKNISIISELGQKITSTLNLDKILNILCNSVRDFIDISIFGIA
LYNTDNEILQYNYYSENNKIINVPNASITSKSNIAAYYLRNRQLVIINDIENEYSRYVDN
PNYINTISAKSAIYCPLIMDDILLGVMTVQSSIKSL
NT seq
1551 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaacagtgacaatgcaactaccataaatgagattttagaaaaacttgataaaatt
aaatatgaaaattccattaatacaataaaatttggcaataactcttatgaattatgtaaa
aaatttaatcatactataggtatggctgtttcactcctaagggttggtgaagctttaacc
aacataggtaattatgaaaaatctctatccctcctttttgaatctctaagtatatcaaga
aaagaagatatttgtgatatacaagttttatccttaatatatataggcaataatttgctt
aatctaggagactatgaaaaaagctttgattactataatgatgcagaaaaaactgcttta
aaaatgtctgtgaataaaaattactacagtaaatacaattacaaattctatcttgcaaaa
acttctactaatataggagaaatctataaaaatcttaaagattatgaaaatgcctttaaa
ttttataatagagcccttacctttgataaaaaattaaattataaatctacctttggagtg
tccttatataatctaggagaaatgaattatttaagtggaaattatgataaggcaatatta
cttttaaataaatccattgaaataatgaactctttcaattataaattagtcttaccagaa
gtatacagaatattagctcttatatatgaaaaaaaaggaaattttacaaaatcaaatgaa
tatttttgtaaagcattaaatatagacctaaaagaaacttttttattttacaagattaat
atacttttagattacagtgattatcttaaaaatagaggaaatctctccctggcattagac
aagttaaaaattgcctttaatatatctgtagaaaataatattatttttaaaaccatagaa
gtgtgcaaaaagctttttagtttgtacgaggagttaaaaaatgatgataaagcttatgaa
tattataagttatattttaaatatcacgacaaattagaaaaagttatatgtactcagaga
cttaataatattaactcaaaaattaaactccagaaattagaagaagaaaaacttaacata
atgaagaagagtgaaaatttcagaaaaagatttgaaaaactcatagaaagtattaaaaat
atatctataataagtgagctaggacaaaaaattacttctactttaaatttagataaaata
ttgaatattctatgcaatagcgttagagattttattgatatatctatttttggtattgca
ttgtataatacagataatgaaattcttcaatataattattatagtgaaaataataaaatc
ataaatgttccaaatgcatctattaccagtaaatcaaatatagctgcctattatttaaga
aatagacaattagttataataaatgatatagagaatgaatattcaagatatgtagataat
ccaaattatattaatactatatcagcaaaatccgccatttactgtcctctcataatggat
gatatcttattaggagttatgacagttcaaagtagtattaaaagcctttaa
DBGET
integrated database retrieval system
