Entry |
|
Name |
(GenBank) PAS/PAC sensor-containing diguanylate cyclase/phosphodiesterase
|
Organism |
cpat Clostridium pasteurianum DSM 525 = ATCC 6013
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
complement(3601296..3604169)
|
AA seq |
957 aa
MLIKTRLPLMMILLSLIPLFLLSFLIYRHTSKVLITNSKVNILQTTNAYSSALAAVIDGQ
RREVNSSKESLGIINVLSNRSRNKDDSFYHSKEVLNLNKSLKENKDNFPEIQHSLVIDLN
GNVIASSEENALKFNVIDREYFKDSIKGKTFISNTLISKASNKLIVVVSSPVKDLDDNII
GVYANAIYIDYFQKFILNIKNGDTGYAYIVDKDGNIIAHPDSKKIGKKSENTKLIDILRN
IKDSNKVYDGLDVYTYDNKDKLMGYKTIPELKWTFVFTKNIAEVNEPAYGELKIIMSVAA
FIFILSVFISIFASRSITKPIGYLINVMNKARKGDLNSLCEYKSNDELGMLTGNYNNMIK
KLNNSYEELSAVYEELSATEEELRSQYDELIENKEALEVSECRYKEVLNGINDALWEYDV
NTGRFFASDKWYDITGYQTEHYNILKLIEKAVFPKCKKKLYDDIKKHINLKTPWFETEVK
INAGDGKIKWILNKGKVIKDDDGRILKYSGIISDVTVKKKAELRVKQLAYFDTLTGLPNR
TNFIDQLDNEVRNYERDKKMGAVLFVDLDDFKRVNDSLGHDEGDKLLKTIGNEFFHTIDE
KNTVCRFGGDEFLILLRDVSGKDEIIDIVNNLIDIFNNGFEFNKKRAFITCSIGICMFPK
DGKNNNSILKNADTAMYKAKETGKNRYEFYDGEMSKGLNRYIQIEKILRSSIHNNEIYLC
YQPQVELKTGKIIGTEALIRIESKEAGFVSPGEFIPVAEKSGLIIQIGEWVMKTAFKQNK
EWIKKGYGEKRISVNVSSIQLKQSNFVESVKKCIEETGISPELVEIEITESVLMESLETN
VEILKQLRSFGVRTSLDDFGTGYSSLNYLRIMPIDTLKIDKSFIDDIHFNRKQEAIVDGI
VNIAHNLEIEIVVEGVETREQLNILKQKGCNIIQGYIFSKPVTAENIDEIIKKTILF |
NT seq |
2874 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgcttatcaaaacaagactgccgttaatgatgattttattgtcattgattcctttattt
ttactaagttttttaatatatagacatacatctaaggtccttataacaaatagtaaagta
aatatattacagactactaatgcctatagtagcgctttggcagctgttatagatggacag
agaagagaggtaaacagctcaaaagagagcttgggtataatcaatgtattaagtaataga
tcaagaaataaagatgactcattttatcattccaaagaagtattaaatctaaataaatct
cttaaggaaaataaagataatttccctgaaattcaacattcacttgtaatagatttaaat
ggaaatgtaattgccagcagtgaggagaatgctttaaaatttaatgtaattgatagagaa
tattttaaagattctataaaaggtaaaacatttattagtaatacattaatttctaaagcc
agtaataaattaatagtggtagtatcttctccagtaaaagatttagatgataacataatt
ggagtttatgccaatgccatatatatagattactttcaaaaatttatattaaatattaaa
aatggagatactggatatgcatacatagttgataaagatggaaatattattgctcatcca
gattctaaaaagataggtaaaaaatccgaaaacactaagcttatagatattttgagaaat
attaaagatagcaataaagtttatgatggtttagatgtatatacttatgataataaagat
aaattaatgggatataaaacaattccagaattaaaatggacttttgtattcacaaaaaat
atagctgaagtgaacgaaccagcttatggtgaactgaaaataataatgtcagtggcagca
tttatatttatattatctgtatttataagtatttttgcatcaagatctataactaaacct
attggatatttaataaatgtaatgaataaagcgcgaaagggagatttaaactctttatgt
gagtataaatccaatgacgaattaggaatgcttacaggaaactacaataatatgataaaa
aaacttaacaatagttatgaagaactttcagcagtgtatgaagaattatctgctacagaa
gaggaacttagaagccaatatgatgaattgattgaaaataaagaagctcttgaagtaagt
gaatgtagatataaggaagtattaaatggtattaatgatgccttatgggaatatgacgta
aatactggtaggttttttgcttcggataaatggtatgatataacagggtatcaaactgag
cattataacattctaaaattaatagaaaaagcagttttccctaaatgtaagaaaaagcta
tatgatgatataaaaaaacatataaatcttaaaactccttggtttgaaacagaagttaaa
ataaatgcaggagatggtaaaataaaatggattttaaataaaggtaaggttatcaaagat
gatgatggtagaattttaaaatattcaggtataatatcagatgttacggtaaaaaagaag
gctgagcttagagtaaaacaactagcatattttgatacactaacaggacttccaaatagg
actaactttattgatcaactagataatgaagtgagaaactatgaaagagataaaaaaatg
ggtgcagtactttttgttgatttagatgattttaaaagagtaaatgattctttaggacat
gatgaaggagacaaactgttaaagactataggaaatgagttttttcacactattgatgaa
aaaaatactgtttgcagatttggcggagatgaatttttaattttgctcagagatgtaagt
ggaaaagatgaaattatagatatagtaaataatttaatagatatatttaataatggtttt
gaatttaacaaaaaacgtgcatttataacgtgcagtataggaatatgcatgtttccaaaa
gatgggaagaataataattccattttaaaaaatgctgatacagctatgtacaaggccaaa
gagacaggaaaaaatagatatgaattttacgatggagaaatgtccaaaggcttaaatagg
tatatacaaatagaaaaaattcttagaagttccattcataataatgaaatatatttatgt
tatcaaccgcaagttgaattaaaaactggtaaaattataggaacagaagctcttataaga
attgaaagtaaagaggctggttttgtgtctccaggtgaatttatacctgtagcagagaaa
tcaggacttattatacaaataggtgaatgggttatgaaaacagcttttaaacaaaataaa
gaatggataaaaaaaggatatggtgaaaaacgtatttctgttaatgtttcatcaatacaa
cttaaacagagtaattttgtagaaagtgtaaagaaatgtatagaagaaactggtatatca
cctgagttagtagaaatagaaataacggaaagcgttttaatggaatctcttgaaacaaat
gtggaaatactgaaacaacttagaagttttggagtaaggacttctttagatgattttgga
acaggatattcttcattaaattatttgagaataatgcctatagatactttgaaaattgat
aaatcctttatagacgatattcattttaatagaaagcaggaagctatagtagatggtata
gtaaatattgctcataatctagaaatagaaatagtagtagagggagttgaaactcgagag
cagctcaatatattaaaacaaaaaggatgcaatatcattcagggatatatctttagtaaa
ccagtgactgcagaaaacatagatgaaataataaagaagacaatattattttaa |