Chlorobaculum parvum: Cpar_1379
Help
Entry
Cpar_1379 CDS
T00725
Name
(GenBank) filamentous haemagglutinin family outer membrane protein
Organism
cpc
Chlorobaculum parvum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
PATR
MBG_2
ESPR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACF11780
UniProt:
B3QPC7
LinkDB
All DBs
Position
complement(1498471..1504032)
Genome browser
AA seq
1853 aa
AA seq
DB search
MNKIFRIVWSAVKDKWIVVSEKSSAKGAYMFTVGAIMSLAAFMAMASPAMALDPGALPTG
GQVAAGSASITTSGTQMTVDQATQQLIANWSTFNIGEDASVNFVQPNSTSVALNRISDQN
PSEILGTLSANGNLMLVNRAGVMFGKTATVNVGGLVASSLDISDSDFLTGNYQFTNAGSA
GSVVNEGAITANGGVVAMIAPKVTNNGTISAPSGSVAMMAGDQVTVQFLGDGMISYTVDK
GTIDALVENNSLIQAGDGYVVMTAKAADALTKSVVNQTGIVQATGIKADGGRIILDADGG
QVNLSGTLDVSSAAGNGGSVVVTGDEVNVQSGALIAADATDNGDGGTVVLSSDEATTFAG
TISAEGGPNGGNGGFAEVSSLGSLDITGHASLLAPAGTVGTLLLDPHSIAIIDGANDGVA
PSGEYSKITNGWLAYQLNLSTVDLVATNDINFLADLTYSGSASTLTLNAPTIVLTGDGTS
FSINASTADLNLNFGTATDQNTLLLADATITTLGDVTFNGNVGGDHDLTITAAQVTFNNG
ATGGFSGSYWDGTIGSSPNDYYFTYSGASLNNTVFTLDFTTATVTSDKNGGTNVPITGEF
LPGNATFRVGDNIHLNFNGNNARAGTEPVVVYGADGLPIDSSYYEIMGTGQGYLVFNSEV
EVSRITFTEGNASGAEISGTWIGPSYNVVDVLSAPVLTNLDITGPTYITGNITTTEDQTY
VGNVALNSNSVLTARDVAMSSLVNLGSYDLTVNNTGTASYIAGTISGTGSLTKDGTGTLV
LIGNNTYSGTTTISDGTLRVGSGMTSGTLGTGNVLDNSHLVFNRSDTSSYAGVISGTGDV
TKDGAGTLILTGDNTYSGTTTINAGTLQVGNNGTTGTLGTGQVTDDANLLFYRSNSYDLD
EVAAGGIVGDGNVTLASTGGDVSITNATIAMSSGSTITVFSGTPDTANLFAQMSGPDKSA
LKYKAYGVEYGDVSIPTNGTYNFFYRTEPTLTVTLTDSKTYDGTNTANNPQLVSVVSSVD
DGDSFDSLDYSDLVTSDVTFDGVNAGSHNLNFDVIDNEVTPIVVDNWSISGYDVQGAGTG
TITQAPLTITGGTTSHQYDGTQYTNTYSVTSGTLYGSDAVTGVTTLGTGTNAGTYNDNLT
SATGSGLSNYDIDFVNGSLTITQAPLTITGGTTSHQYDGTQYTNTYSVTSGTLYGSDAVT
GVTTLGTGTNAGTYNDNLTSATGSGLSNYDIDFVNGSLTITQAPLTITGGTTSHQYDGTQ
YTNTYSVTSGTLYGSDAVTGVTTLGTGTNAGTYNDNLTSATGSGLSNYDIDFVNGSLTIT
QAPLTITGGTTSHQYDGTQYTNTYSVTSGTLYGSDAVTGVTTLGTGTNAGTYNDNLTSAT
GSGLSNYDIDFVNGSLTITQAPLTITGGTTSHQYDGTQYTNTYSVTSGTLYGSDAVTGVT
TLGTGTNAGTYNDNLTSATGSGLSNYDIDFVNGSLTITQAPLTITGGTTSHQYDGTQYTN
TYSVTSGTLYGSDAVTGVTTLGTGTNAGTYNDNLTSATGSGLSNYDIDFVNGSLTITQAP
LTITANDDSKTYDAVAYTGGNGVTYFGFVNGEDISILGTLVYTGNSQGAINAGTYQIIPA
IEEEEPGYYNYSITYNPGTLTIEQSLNPADVVELIPPGPVILPEDVIGGKGSNPLVNTTG
MDFGSFAELTTGSAAELIADGSAEETGGGTLLEQSGVSGETRTVAMGSEGEVASSEMTSG
TVEEATAQVVVKLVRNAEAGTTGLIDVLIPEAMLRSSSAITFELPKEVKGLLLKGDGNET
VKLENNNPLPAWITYNRGSKSFTAINPPSNAFPMKVAITDSAMLSWVVDISIR
NT seq
5562 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaagatatttcgcattgtctggtcagcggtgaaagataaatggatcgtcgtgtcg
gagaaaagttcggcaaaaggcgcctacatgttcaccgtaggggctattatgagcctcgca
gcatttatggcaatggcatcgccagcaatggccctcgatccgggagcattgcctactggt
ggtcaggtcgcggcaggtagcgcgagcatcaccaccagcggcacccagatgacggtcgat
caggcgacccagcagctcattgccaactggagcaccttcaacatcggtgaggacgcttcc
gtgaattttgttcagccgaattctacttcggttgcgctcaacaggatttccgaccaaaac
cccagcgagattctgggtacgctttcggcgaatggcaatttgatgcttgtaaaccgtgct
ggcgtcatgtttggcaaaaccgcgaccgtgaatgtcggtggtttggtggcttcttcgctt
gatatcagtgacagcgatttccttacgggaaactaccagtttacgaacgcaggttcggcc
ggttcagtagtcaacgaaggagcgataacagccaatggtggcgtcgtcgcgatgatagcg
ccgaaggttaccaacaacggaacgatcagcgccccgtcaggaagcgtggccatgatggcc
ggtgaccaggttacggttcagtttctgggtgacggtatgatcagctatactgtggacaag
ggaacgattgatgctcttgttgagaataacagcctcattcaggctggcgacggctacgtg
gtgatgactgccaaggcagccgatgcgctgacgaagtcggtggtcaaccagacgggcatc
gttcaggccacaggcattaaggccgatggtggtcggatcattctcgatgccgatggcggg
caggtcaacctctcaggtacgctggacgtttcgtctgccgcaggcaacggcggatcggtt
gtcgttaccggtgacgaggtgaatgtgcagagtggcgccttgattgctgctgacgcgact
gataatggtgacggcggtaccgtcgttctctcttccgacgaggcgactacctttgcgggt
accatatcggctgagggtggcccgaacggcggaaacggtggatttgccgaggtgagttcc
cttggttctcttgacattactggtcatgcttccttgctggctcctgcaggaacagttggc
actcttttactggatccccatagcattgctattattgatggtgccaatgatggggtagca
ccctccggagaatattcaaagattactaacggctggcttgcttaccagctgaatctctcg
acggttgaccttgtggcaaccaacgacatcaattttcttgctgatctgacttattcaggt
tccgcaagcacattgacccttaacgctcctaccattgtattgacaggggacggaacgagt
ttctccattaacgccagtaccgcagacttaaacctcaactttggtactgctacagaccag
aatacgcttctgcttgccgacgcaacgatcactacgctcggtgatgttacgttcaacggc
aatgtcggtggtgatcatgatctgacaattaccgcagcgcaggtcacgttcaacaacggg
gctacaggtgggttcagtggtagttactgggatggaacaatcggttcgtcaccgaacgac
tactatttcacttattctggtgcaagcctgaacaatacggttttcactcttgactttaca
acggcaactgttacttctgataaaaatgggggtacaaacgtaccaattaccggtgagttt
ttgccaggcaatgccacctttagggttggtgataatattcacctcaactttaatggaaat
aatgctcgtgccggtaccgagcccgttgtagtttatggtgcagatgggttgccgattgac
tcttcgtactatgaaattatgggtaccgggcaaggataccttgtgttcaattctgaagtc
gaggtatcaagaatcacctttactgaggggaacgcgagtggggctgaaatttctggaaca
tggattggccctagttacaacgtggtcgacgtgctttcagcaccggtactgaccaacctt
gacattacgggcccgacctatatcacagggaacattacgaccaccgaagaccagacgtat
gtcggcaatgtagctcttaacagtaactcggtgctgacagcccgggatgttgcgatgagc
tccttggtcaatcttgggagttatgacctgacggtgaacaataccggcactgccagctat
atagctgggacgatcagtggcactggctcgctgaccaaggacggtacaggtacgctggtg
ctgataggtaataacacctatagcggtacgaccaccattagtgatggaacgctgcgggtt
ggctcgggtatgacgagtggtacgctgggtactggcaatgtgctcgataactctcatctg
gtgtttaaccgttctgatacttccagctatgccggagtgatttcgggaacaggagacgtg
accaaggacggagcaggcacgctgatactaactggtgataacacctatagcggtacgact
acgattaatgctggcacgcttcaggtcggcaacaacggaacgaccggtaccttgggtact
ggccaggtgaccgacgacgcaaacctgctgttctaccgttccaacagttatgaccttgac
gaggtggctgctggaggcatcgttggtgacggcaatgtcaccttggcatcgacgggtggg
gatgtctctatcaccaatgccacgattgcgatgtcatctggaagtaccattacagtcttt
tctggtacaccggataccgctaatctgtttgctcagatgtcgggacctgataaatcggct
ctcaaatacaaagcctatggtgttgagtatggtgatgtgtcgattccaacgaatggcacg
tacaacttcttctatcgcacagagccaactctgacggtcacactgactgattcgaagact
tatgacggcacgaacacggcaaataatcctcagcttgtaagtgttgtttcaagtgttgac
gacggcgactcatttgatagccttgattacagtgatttagttacgagcgatgtcactttt
gatggcgttaatgcaggttcgcacaatttgaactttgacgtcattgataacgaagtaacg
ccgatcgttgtcgacaactggtctatttctggatacgatgtgcagggcgcaggtacaggt
acgatcacgcaggccccattgacgatcacgggcggcacgacgagtcaccagtacgacgga
acccagtacaccaacacctacagcgttacctctggtacactgtatggaagtgatgcggtg
accggtgtaacgacgctgggcacaggcacgaatgccggcacgtacaacgacaatctgacg
tcggcaacgggcagtggcctgtcgaactacgacatcgatttcgtgaacggctcactgacg
atcacgcaggccccattgacgatcacgggcggcacgacgagtcaccagtacgacggaacc
cagtacaccaacacctacagcgttacctctggtacactgtatggaagtgatgcggtgaca
ggagtgacgacgctgggcacgggcacgaatgccggcacgtacaacgacaatctgacgtcg
gcaacgggcagcggcctgtcgaactacgacatcgatttcgtgaacggctcactgacgatc
acgcaggccccattgacgatcacgggcggcacgacgagtcaccagtacgacggaacccag
tacaccaacacctacagcgttacctctggtacactgtatggaagtgatgcggtgaccggt
gtaacgacgctgggcacaggcacgaatgccggcacgtacaacgacaatctgacgtcggca
acgggcagcggcctgtcgaactacgacatcgatttcgtgaacggctcactgacgatcacg
caggccccattgacgatcacgggcggcacgacgagtcaccagtacgacggaacccagtac
accaacacctacagcgttacctctggtacactgtatggaagtgatgcggtgaccggtgta
acgacgctgggcacaggcacgaatgccggcacgtacaacgacaatctgacgtcggcaacg
ggcagtggcctgtcgaactacgacatcgatttcgtgaacggctcactgacgatcacgcag
gccccattgacgatcacgggcggcacgacgagtcaccagtacgacggaacccagtacacc
aacacctacagcgttacctctggtacactgtatggaagtgatgcggtgacaggagtgacg
acgctgggcacaggcacgaatgccggcacgtacaacgacaatctgacgtcggcaacgggc
agcggcctgtcgaactacgacatcgatttcgtgaacggctcactgacgatcacgcaggcc
ccattgacaatcacgggcggcacgacgagtcaccagtacgacggaacccagtacaccaac
acctacagcgttacctctggtacactgtatggaagtgatgcggtgacaggagtgacgacg
ctgggcacgggcacaaatgccggcacgtacaacgacaatctgacgtcggccacgggcagt
gggctgtcgaactacgacatcgatttcgtgaacggctcactgacgatcacgcaggcccca
ttgacgatcacggccaatgacgactccaagacctatgatgcggtggcatacacaggcggc
aacggtgtcacgtactttggtttcgtcaatggggaagacatcagtattcttggtacgctc
gtttacacgggcaatagccaaggtgccatcaatgctgggacctatcagataattccagct
attgaggaggaagaaccgggatattacaattattccatcacgtataatccaggtaccctt
acgattgagcagagccttaatccggctgatgttgttgaactgattcctccgggtcccgtt
atcctgccggaagatgtcatcggcggtaaaggctctaatcctctggttaacacaactggt
atggatttcggcagcttcgcggaactgactactggtagtgctgccgagcttatcgctgac
ggctcagctgaagagactggtggtggcacgctgcttgagcagagtggtgtgtctggcgag
accaggacggtagctatgggcagtgaaggtgaggtcgcttcatccgagatgacctctgga
accgtcgaagaggctactgctcaggtggttgtcaaactggtcaggaatgctgaggcaggt
acgacaggcttgatcgatgttcttatccctgaagcaatgcttcgcagtagttcagctatt
acgtttgaacttccaaaagaggtgaaagggctgctgttgaaaggtgatggtaatgaaacc
gtgaagctggaaaacaataatcctcttccggcatggatcacctacaacagaggtagtaaa
tccttcaccgcgatcaatccgccatcaaatgccttcccgatgaaggtggcgataaccgat
tctgcaatgcttagctgggttgtcgacatttcgattcgttaa
DBGET
integrated database retrieval system