Campylobacter peloridis: CPEL_1383
Help
Entry
CPEL_1383 CDS
T03559
Name
(GenBank) hemagglutination domain protein
Organism
cpel
Campylobacter peloridis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
Snapin_Pallidin
SHPRH_helical-1st
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJC85192
LinkDB
All DBs
Position
complement(1421119..1424244)
Genome browser
AA seq
1041 aa
AA seq
DB search
MAVFSPRGGGSNNFDLTPSKKLTNHILLSSIVASLLFSPAFALPSGGKFTHGTSGTINVS
GNNMHINGNKVNSVIQWGGGFNINKGESVNFGGNSKNYLNIAHGTNKSTIAGVLNASGNN
VFLINPNGVIITKTGNINANRFVASTSSMSNEDMNKFANGQYANGKTIDYATFSPVFKAN
KLGNVVNMGNINANDVLLIGHKVSIDGGNIHGMHNANTSGDALKNPSNNTASKVHLVGNE
VNIQVDGIKSNSIIASAYSKGALQQSTTSYYNYGNNIGKLNFTTQEYDNIENKANKQLVT
KDKFEKHATIGSDVDWWHFAKGWNYDRNNMRDFFGTYKLTSDIDFGGNQGKNYANYCMSQ
GQCTSMIIGNAGNNAFNKNFDGQGFTLKNINMDVENIDYAGIFGNVSYSDIRNIKVDYMG
GRINGNNVRYMGGFVGNSLHNGSFFSDISIKNIDFINNNSNSFFIGGFAGIAGGNFTKIY
IDNINNILGKSSSGYGGIGGFAGNARGNFENIAINSINNITLKVNGPAHAGGFAGQLFTG
EYVKNVYMENIKNVKVDAAGAFAAVGGMFGEIGNNTKFDHIYIKGLENIYVDNKYAQAGS
YAGSFAGRSYKVTAVFQNIAIEGKININANATQSAYAGGFLGCNGVFNMGSCGAQGGNNG
AYIHNVYLYFKEGSNVKAKSYWDQAYGGESYANIFIANENNKNISNANIYHYINDFNKND
YIQDKINIHTYTDETQANAYKDFLSKANTIEKPTITPPTTPDNPNQPSDSDVILASDDVI
SANDLNKWLGEIFGGNYWVDIKDFKIQGLSEELKQSISFLEALYGQKGMKEILEKIHNDY
KMAYSKYDKFKTSKANLLAFINDKLKPLVDSSNNALAQLKTIQEQLKIAITKYNDYVKKI
NENPSIKNEATLASLKAEVDRLSNLSGELATTIANNQIKLETWQGKANVDSNGHFTIKGK
LNNIALTIPNLEKLNNSGGIENDDYQKLSRQIASSQKQTPTFKYEEEETQEIDEAALTQR
ARTCIVSDNFKTMNPCVVGSY
NT seq
3126 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagtattttctccacggggggggggatcgaataattttgatttaactccttctaaa
aaactaactaatcacatcttactttcaagtatagttgcttcattacttttttcacctgca
tttgccttaccaagtggtggtaaatttactcatggcacaagtggaactataaatgttagt
ggtaataatatgcatataaatggtaataaagttaattctgttatccaatggggtggtggt
tttaatataaataaaggtgaaagtgtaaattttggtggtaatagtaaaaactatttaaac
atagctcatggaacaaataaatctaccatagcaggtgtattaaatgcaagtggtaataat
gtatttttaatcaatcctaatggagtaatcattactaaaacaggtaatatcaatgctaat
cgctttgtagcttctacttcatcgatgagtaatgaggatatgaataaatttgcaaacgga
caatacgcaaatggaaagactatagactatgcaactttttcacctgtgtttaaagcaaat
aaacttggcaatgtagtaaatatgggtaatatcaatgcaaatgatgtattgcttatagga
cataaggtaagtatagatggtggtaatatccatggtatgcataatgcaaacactagtggt
gatgctttgaaaaacccaagtaataacacagcaagtaaagttcatttagtaggcaatgaa
gtaaatatacaagtagatggtattaaatcaaattctatcatagctagtgcttatagtaag
ggtgctttacagcaatctactacatcttattataattatggtaataacataggaaaacta
aattttactactcaagagtatgataacatagaaaacaaagcaaacaaacaattagtaact
aaagataaattcgaaaaacatgctactataggttctgatgtagattggtggcattttgct
aagggttggaattatgatagaaacaacatgagagatttttttggcacctataaattaact
agtgatatagattttggcggtaatcaaggtaaaaactatgcaaattattgtatgtcacaa
ggacaatgcacttctatgataataggtaatgctggtaataacgcttttaataaaaatttt
gatgggcaaggatttactttaaaaaatattaatatggatgttgaaaatattgattatgct
ggaatttttggaaatgtgagttattctgatattagaaatataaaagtagattatatgggt
ggtcggattaatggtaataatgttagatatatgggcggttttgtaggaaattctttgcat
aatggtagttttttttcagatatttcaataaaaaatattgattttataaataataattct
aattcattttttataggtggttttgcaggtatagctggaggaaattttactaagatatat
atagataatataaataacattttaggaaaatctagttctggttatggtggtataggtgga
tttgctggaaatgctaggggaaattttgaaaatattgctattaactctataaacaatata
acattaaaagttaatggtccagcacatgctggtggatttgcaggacaattatttacagga
gaatatgttaaaaatgtatatatggaaaatattaaaaatgtaaaagttgatgctgctggt
gcatttgctgctgtaggtggaatgtttggtgagataggtaataatacaaaatttgatcat
atttatatcaaaggcttggaaaatatttatgttgataataaatatgcacaagctggaagt
tatgctggttcttttgctggaagaagttacaaagtaacagcagtgtttcaaaatattgca
atagagggtaaaattaatatcaatgcaaatgcaacacaaagtgcttatgctggaggattt
ttaggatgtaatggtgtattcaatatgggttcttgtggagcacaaggaggtaacaatggt
gcgtatatacataatgtatatttatactttaaagaaggttctaatgttaaagctaaatct
tattgggatcaagcatacggaggagaatcatatgctaatatttttatagcaaatgaaaat
aataaaaatatttctaacgctaatatatatcattatattaacgattttaacaaaaacgac
tatatccaagataaaatcaatatccacacttacacagatgaaacccaagcaaatgcatat
aaagactttttatctaaagcaaacactatagaaaaaccaaccatcactccaccaaccacc
cctgataatccaaaccaaccaagcgatagcgatgttatcttagcaagtgatgatgtaatt
agtgcaaatgatttaaacaaatggctaggtgaaatatttggtggaaattactgggtagat
ataaaagattttaaaattcagggattaagtgaagaattaaagcaaagcatatctttctta
gaagctttatatggtcaaaaaggcatgaaagaaatactagaaaaaatccataatgattat
aaaatggcttattctaagtatgataaatttaaaacaagcaaagcaaatcttttagcattt
atcaatgataaattaaaacctttagttgattcttctaataatgccttagctcaattaaaa
accatacaagagcaacttaaaatagccataactaaatataatgattatgttaaaaaaatc
aatgaaaatccaagtataaaaaatgaagcaactttagcttctttaaaagctgaagtagat
agattaagcaatcttagtggagaattagccactactatagctaataatcaaataaaacta
gaaacttggcaaggtaaagctaatgttgattccaacggacattttactatcaaaggtaaa
ttgaataatatagctttaacaatacctaatttagaaaaattaaataattctggtggtatt
gaaaatgatgattatcaaaaactatcacgccaaatagctagctcacaaaaacaaacacct
acttttaaatacgaagaagaagaaacccaagagatagacgaagcagcactaactcaaaga
gctagaacttgtatagtaagtgataattttaaaactatgaatccttgtgtggttggaagt
tattaa
DBGET
integrated database retrieval system