Cucurbita pepo subsp. pepo (vegetable marrow): 111778504
Help
Entry
111778504 CDS
T05351
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At5g16860
Organism
cpep
Cucurbita pepo subsp. pepo (vegetable marrow)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
DYW_deaminase
PPR_3
E_motif
PPR_long
Eplus_motif
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111778504
NCBI-ProteinID:
XP_023514147
LinkDB
All DBs
Position
LG17:complement(6478419..6482612)
Genome browser
AA seq
822 aa
AA seq
DB search
MSFLKQCRTLIDAKLVHQQILVNGFTDLVTHAIGGYIECNAFGQAVSLLERLVPSHSTVF
WWNALIRRSVRLGFLDDSLCFYRQMQRLGWLPDHYTFPFVLKACGEKLSFRCGTSVHAMV
CAYGFESNVFICNSVVAMYGRCGALDDARQVFDEVLERKIDDIVSWNSILAAYVQGGESK
AALRIAFQMAKHYNFRLRPDAITLVNVLPACASTFATQHGRQVHGFAVRSGLVDDVFVGN
ALVDMYAKCSKMNEANKVFEQMKEKDVVSWNALVTGYSQIGSFDDALSLFKRMQEEDIEL
NVVTWSAVIAGYSQRGHGCEALDVFRQMQHCGLEPNVVTLVSLLSGCASVGALLHGKQTH
AYAIKNILNLDWSDPGDDMMVFNGLIDMYAKCKSSRVARNIFDSIIGKDKNVVTWTVMIG
GYAQHGEANDAVELFSQMFKQETSLKPNAFTLSCALMACARLGALRLGKQIHAYALRHEN
ESEVLHVANCLIDMYSKSGDIDAAQIVFDNMKVRNAVSWTSLMTGYGIHGRGEEALRVFN
QMRQVGLSVDGVTFLVVLYACSHSGMVDQGMNYFHGMVKYFGVAPGAEHYACMVDLLGRA
GRLNEAMELIKSMPMEPTPVVWVALLSASRTHANVELGEYAASKLIESGAENDGSYTLLS
NLYANARRWKDVARIRRLMKHTGIKKRPGCSWVQGKKSTTTFFVGDKSHPQSDQIYNILS
DLIQRIKDMGYVPQTSFALHDVDDEEKGDLLFEHSEKLAVAYGILTSAPGQPIRINKNLR
ICGDCHSALTYISMIIEHEIILRDSSRFHHFKKGSCSCRGYW
NT seq
2469 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccttcctgaaacaatgtagaacgttgatcgatgcaaagcttgttcaccagcaaatt
ttggttaatggcttcactgatttggttacacacgccattggaggctacattgagtgcaat
gcatttggacaagctgtatcgctccttgaacgtctcgttccatctcattccaccgttttt
tggtggaatgcgctgattcgacgctctgtgaggcttggttttcttgatgattcattgtgt
ttttatcgtcagatgcagagacttgggtggttgcctgaccattacacctttccatttgtt
ctcaaagcttgtggtgagaaactgtcatttagatgtggtacctcagttcacgccatggtt
tgtgcttatgggtttgagtcaaatgtatttatttgtaattctgttgtggcaatgtatggg
agatgtggggcattggatgatgcacgccaagtgtttgatgaggtgcttgaaagaaagata
gatgacattgtgtcttggaattcaattcttgctgcttatgtacaaggtggggagtcaaaa
gctgccctcagaattgcctttcaaatggctaagcactacaatttcagacttcgcccagat
gctattacgcttgtcaatgttcttcctgcatgtgcatcaacatttgcgactcaacatggc
aggcaggtacatggatttgcggttcggagtggattggtggatgatgtgtttgtaggcaat
gctcttgtggatatgtatgctaaatgctcgaagatgaatgaggcaaacaaggtgtttgag
cagatgaaggagaaggatgtggtttcttggaatgctttggtaactggctattctcagatt
ggtagctttgatgatgctctctccttgtttaagaggatgcaagaggaagatattgagtta
aatgtggtaacatggagtgctgtgattgctggctattctcaaagggggcatggttgtgaa
gcccttgatgtattcaggcaaatgcaacactgtgggttggagccaaatgttgttactctt
gtgtctcttctttcaggttgtgcttctgtgggagcattgcttcatggaaagcaaacacat
gcatatgccataaaaaatattctcaacttggattggagtgatcctggagatgacatgatg
gtttttaatggcctaattgatatgtatgctaaatgcaaaagctcgagagttgctcgcaat
atttttgactcgataataggaaaggacaagaacgtggtgacttggactgtcatgattggt
gggtatgctcagcatggcgaagccaatgatgcagtagaacttttctctcagatgttcaag
caggagacctctttaaagcctaatgccttcactctatcttgtgccttgatggcttgtgca
cgtttgggtgcattaaggcttggaaaacaaatccatgcctatgctttgcgtcatgaaaat
gagtctgaggttttacatgtagctaattgccttatagatatgtattccaaatcaggggac
attgatgctgctcagatcgtattcgacaacatgaaggtacgaaatgctgtttcttggaca
tccttgatgacaggttacggtatccatggtcgtggtgaagaagctctacgtgtttttaat
caaatgcggcaagttggtctttcagttgatggggtaacctttcttgtcgttctttatgct
tgtagccactctggaatggtggatcaaggcatgaactacttccatggtatggtcaagtac
tttggggttgcacctggagccgaacattatgcatgtatggttgatctcttgggccgtgca
ggtcgtctcaatgaagcaatggaactcattaaaagcatgccaatggaaccgaccccagtt
gtatgggtggctctactaagtgccagcagaacccatgctaatgtcgagcttggggaatat
gcagcaagcaaattgatagaatctggggcagagaatgatggttcatacacattactttcg
aacttgtatgcgaatgcgcgacgttggaaagatgtagctagaatccgaagattgatgaaa
catactgggatcaaaaagaggccgggatgtagttgggtacaaggcaagaaaagcactaca
accttctttgtgggtgataaaagtcatccacaatcagaccaaatatacaacattctctcc
gatttgattcaacgcatcaaggacatggggtacgttcctcaaacaagctttgctcttcat
gacgttgacgacgaggagaaaggcgatctcttgtttgagcatagcgagaagttggctgtt
gcatatgggatcttaacatcagctccaggacaacccattcgaataaacaagaacttgcgc
atatgcggtgattgccacagtgccttaacctacatttccatgattattgaacacgagatc
atattgagagattccagtaggtttcatcatttcaagaaaggctcctgctcttgtagaggc
tattggtga
DBGET
integrated database retrieval system
