Cucurbita pepo subsp. pepo (vegetable marrow): 111787083
Help
Entry
111787083 CDS
T05351
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
cpep
Cucurbita pepo subsp. pepo (vegetable marrow)
Pathway
cpep03015
mRNA surveillance pathway
cpep03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpep00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
111787083
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
111787083
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
cpep03041
]
111787083
Spliceosome [BR:
cpep03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
111787083
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111787083
NCBI-ProteinID:
XP_023523000
LinkDB
All DBs
Position
LG02:10928392..10933736
Genome browser
AA seq
483 aa
AA seq
DB search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NT seq
1452 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggcatgtacgatcaaggaggagacgctgctccttcgtcttacggagcccctggg
ggcggtggaggaggatacggcggcggagggtatggaggcggtggtggcggatatggtgga
aagggcggcgatggtggatatggcggcggaggccgaggaggcggcggtggcggcggtggt
ggtagaggatatggaggacgaggtggtggcggaggctacggtgggcgaggaggcggcggt
ggtggtggctatcaaggaggagatcgtggagggcgaggtggtggacgtggtgggggaggt
ggtcgtggtggaagcgggagagatggtgattgggtctgccctaatcctggctgtgcaaat
gtgaactttgctagaagagtggagtgtaacaagtgtggtacaccatcacctggtggtgcc
agtgaccgaagtggtggtggtggtggtggaggaggatataatagaggtggagctgatggg
ggttatggtggtaatcgtaatggcagaggcggaagttaccatggtggtagaagtggaaat
catgatggtggtcgctatgaaggagggaacagaggtggtaattcttatggtggtcaccag
ggaggagaggatagcgggcacagtcaggttcctccatcatcagcccccccatcaggtggt
gttggtggctcttatccaccatcttatcgtggtggaagtgcagattatggtacggatgca
gttcctccgcctgcaagctacagtggaactacctaccctccaacttatggtggtcccact
ggtggctatggcggtgatggtctaggtgatgggcggagtgcgactggtcgtggtgggcca
tcagctggatatgatggtgcttacaatgcaggtggtaaaggtggtggttacaatgctggt
ggtagaggaggtggaagctataatgctggtggtggtagaggtggtggttatggaagtaca
ccagcagcagagccagcacaggtgaaacagtgcgacgaatcttgtgatgattcttgtgat
aactcaagaatctatgtttcgaatctgccaacagatgtgaccattgatgaattgagagaa
ctatttggtggcattggccaaattggaagaatcaagcagaagaggggctacaaggatcag
tggccttggaacataaaaatatatacagatgagatgggaaataacaaaggcgatgcatgt
gtatcatatgaagatccctcagcggcacattctgctggcggtttctataacaattatgat
ttgagaggtcatagcatcaatgttgcaatggctgagaagtctgcaccgagggcgcctaca
tacaaccatggtggtggcggcagaggtggatatggaggtggtggtggtgatagacgtaga
gatagctatagggacggaggctcaggacctgatagacatcagcatggtggaaatagatct
cgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
