Cucurbita pepo subsp. pepo (vegetable marrow): 111797634
Help
Entry
111797634 CDS
T05351
Name
(RefSeq) extensin-1-like
Organism
cpep
Cucurbita pepo subsp. pepo (vegetable marrow)
Pathway
cpep05100
Bacterial invasion of epithelial cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpep00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
111797634
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111797634
NCBI-ProteinID:
XP_023536462
LinkDB
All DBs
Position
LG06:6106055..6107276
Genome browser
AA seq
326 aa
AA seq
DB search
MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPP
PPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY
HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPP
PPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY
HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKEYKSPPPPVYYSP
PPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY
NT seq
981 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtatctcgtagctactgttttggtggcaattttgagttttacgtcggtgatcgct
actgattatagctactcttctccaccgcctccttactatgtctataaatctcctcctcct
cctccggtttatcattctcccccgccaccgaaggtaaaatatgagtacaaatcgccacct
cctccagtttattactctcctcctccacctgtttataagtcaccgccacctccagtctac
cactctccaccacctccagtttatcactctcctccaccacccgtttataagtcaccgcca
cctccagtttaccattctcctcctccaccagtttacaagtcaccgccacctccagtctac
cattctcctcctccaccagtttacaaatcaccaccacctccggtgtattactctcctcct
ccaccagtttacaagtcaccgccacctccagtgtattactctcctcctccaccagtttac
aagtcaccaccacctccagtgtattactctcctccaccaccagtttacaagtcaccgcca
cctccagtttaccattctcctcccccacctgtttatcactctccaccacctccagtgtat
tactctcctccaccacccgtttacaagtcaccaccacctccagtttattactctcctcct
ccaccagtttacaagtcaccacctcctccagtttaccattctcctcccccgcctgtttat
cactcaccaccacctccagtttattactctcctccaccaccggtttataagtcaccacct
cctccagtttaccattctcctcccccacctgtttatcactctccacctcctcccgtttat
tattctccacctccaccaaaggagtataaatcaccacctccacctgtatactactctcct
cccccacccgtttacaagtctcctccaccacctaagaaggactacgagtacaagtctcca
ccacctcctcaatactattag
DBGET
integrated database retrieval system