KEGG   Cucurbita pepo subsp. pepo (vegetable marrow): 111797634
Entry
111797634         CDS       T05351                                 
Name
(RefSeq) extensin-1-like
Organism
cpep  Cucurbita pepo subsp. pepo (vegetable marrow)
Pathway
cpep05100  Bacterial invasion of epithelial cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cpep00001]
 09160 Human Diseases
  09171 Infectious disease: bacterial
   05100 Bacterial invasion of epithelial cells
    111797634
SSDB
Motif
Pfam: Extensin_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 111797634
NCBI-ProteinID: XP_023536462
LinkDB
Position
LG06:6106055..6107276
AA seq 326 aa
MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPP
PPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY
HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPP
PPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVY
HSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKEYKSPPPPVYYSP
PPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPQYY
NT seq 981 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcgtatctcgtagctactgttttggtggcaattttgagttttacgtcggtgatcgct
actgattatagctactcttctccaccgcctccttactatgtctataaatctcctcctcct
cctccggtttatcattctcccccgccaccgaaggtaaaatatgagtacaaatcgccacct
cctccagtttattactctcctcctccacctgtttataagtcaccgccacctccagtctac
cactctccaccacctccagtttatcactctcctccaccacccgtttataagtcaccgcca
cctccagtttaccattctcctcctccaccagtttacaagtcaccgccacctccagtctac
cattctcctcctccaccagtttacaaatcaccaccacctccggtgtattactctcctcct
ccaccagtttacaagtcaccgccacctccagtgtattactctcctcctccaccagtttac
aagtcaccaccacctccagtgtattactctcctccaccaccagtttacaagtcaccgcca
cctccagtttaccattctcctcccccacctgtttatcactctccaccacctccagtgtat
tactctcctccaccacccgtttacaagtcaccaccacctccagtttattactctcctcct
ccaccagtttacaagtcaccacctcctccagtttaccattctcctcccccgcctgtttat
cactcaccaccacctccagtttattactctcctccaccaccggtttataagtcaccacct
cctccagtttaccattctcctcccccacctgtttatcactctccacctcctcccgtttat
tattctccacctccaccaaaggagtataaatcaccacctccacctgtatactactctcct
cccccacccgtttacaagtctcctccaccacctaagaaggactacgagtacaagtctcca
ccacctcctcaatactattag

DBGET integrated database retrieval system