Clostridium perfringens ATCC 13124: CPF_0011
Help
Entry
CPF_0011 CDS
T00378
Name
(GenBank) putative membrane protein
KO
K09118
uncharacterized protein
Organism
cpf
Clostridium perfringens ATCC 13124
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpf00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
CPF_0011
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UPF0182
DUF6435
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG82295
UniProt:
Q0TV56
LinkDB
All DBs
Position
16274..19030
Genome browser
AA seq
918 aa
AA seq
DB search
MKNKILNTVLISILLLVVVFFVSTNFIINVQWFKEVGYLNVFFTKLIAICKLFVPIFILY
FCVIAIYLFTLRKSIRSLVGDTKFKSVKKYFLLSNLVISILGAGATATTQWYKILQFTNA
VPFGEVDPIFNKDISFYVFKLPLVQSLFSTAISLIIILVLITVIIYLALGFKDKIYQNKD
NVININSKTYGIRKFAGKQLAVLASVLSLLIGCSYLLKSYNLVYSTRGVSYGAGYTDVKI
TMIFYKVIAVACVISSIVVFISILKLKFRPIIISIASIAVLIVLEPVVAIFTQQFVVKPN
EMELEKPYISYSIDATKKAFNIDEIEVKEMEPNENITSEKLEDNKDIIENLKVNSTGPLL
SFYQQVQLIKNYYEFNDADTDRYNINGKYTQVFVSPREINRDSMTTWQNKHLRYTHGYGL
AMSRVNSVTEFGQPDFVMKDIPTVNTTDINLENPRIYFGESDNDYVIVNTEGGEFDYPTG
DTENTFNYNGTGGLKMTPFNRVLFSIYERNPKILMSSSITSESRIILNRNIVKRVQEIAP
FLTYDSDPYIVVHDGRLVWMMDAYTSTDKYPFSEPHEGVNYIRNSVKVVVDAFNGNVDFY
VTDENDPIINCYLKIYKGLFKPLSEMPEDLKEHFRYPQDLFELQSKVLTKYHVDDPIKLF
TEEDLWDRSLEVVKHGGENLSQGDEGKEESILNKAKENKNNEAENEGLYLMTKLPDEENV
EMMLLDYFNMRGKQSMVALLGARMDGDNYGELVMYKFPPQRTIYSPILFKNRIQQDPNIS
KEISLWAGKGSEVIYGDIIIVPIEDSLLYLNTIYLKANSENSMPEMKRVILSNGDKIVIE
ENIEKALLKLFNYSSSEENKNSNKDETPKNEITSDNSGIKEAADLFNKAIEAQKNGDWAT
YGEFINKLGDILNKMSQE
NT seq
2757 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaaaataagatacttaatacagttcttattagtatcttacttctagttgtagttttt
ttcgtttcaactaattttattattaatgttcaatggtttaaggaagtaggatatttaaat
gtattttttactaagcttatagctatatgtaagttatttgtacctatatttattttatat
ttttgtgtaatagctatatatttatttactttgagaaaaagtattagaagcttggtaggt
gatactaagtttaagtcagttaagaagtactttttattatcaaatttagtaatatcaata
ttaggagctggagctactgccacaactcagtggtataaaattcttcaatttactaatgcg
gttccttttggagaagtagatcctatttttaataaggatatatctttttatgtttttaaa
ttacctttagtacagtctctttttagtacagctatttccctaataattattttagttctt
ataacagttattatatatttagctttaggatttaaagataaaatttatcaaaacaaggat
aacgttataaatataaatagtaaaacttatggaataagaaagtttgcgggaaaacaacta
gcagttttggcttcagtattatcactgcttatagggtgtagctatttattaaagtcatat
aatttagtttatagtactagaggagtatcctatggagctggttatacagatgttaaaata
acaatgatattttataaggttatagctgtagcttgtgtaatatcttcaatagtagttttt
atttcaattttaaagcttaaatttagacctattataatatcaattgcatcaattgctgta
cttattgttttagagcctgtagtagccatttttactcaacagtttgtagttaaaccaaat
gaaatggaacttgaaaaaccttatatttcatatagtattgatgctactaaaaaggctttt
aatattgatgagattgaagttaaagaaatggaaccaaacgagaatataactagtgaaaaa
ttagaagataataaagatatcattgaaaacctaaaggttaattcaacaggacctttatta
agtttttatcagcaagttcaacttataaaaaattattatgaatttaatgatgctgataca
gatagatataatataaatggtaaatatacgcaagtatttgtatctccaagggaaataaac
agagattctatgactacatggcaaaataagcatcttagatatacccatgggtatggttta
gctatgagtagggttaatagtgtaacagaatttggacaacctgactttgttatgaaagat
ataccaacagtaaatacaacagatattaatcttgaaaatccaagaatttattttggagaa
agtgataatgattatgttattgtaaatactgaagggggagagtttgactatccaacagga
gatacagaaaatacatttaactataatggaactggtggattaaagatgacaccttttaat
agagtgttatttagtatttatgaaagaaatcctaaaatattaatgtctagttccataact
tcagaaagtagaataattcttaatcgtaatatagttaagagggttcaagaaatagctccg
tttttaacttatgatagtgatccatatatagtagttcatgatggaagattggtttggatg
atggatgcatatacatcaacagataagtacccattttcagagcctcatgaaggagtaaac
tatataaggaattcagttaaggttgtggttgatgcttttaatggaaatgtagatttttat
gtaacagatgagaatgaccctataattaattgttatttaaaaatatataaaggtttattt
aagcctttatcagaaatgccagaggatttaaaggagcattttagatatcctcaagactta
tttgaattacaaagtaaggtattaacaaaatatcatgtagatgatcctattaaactattt
actgaggaagatttatgggatagatcactagaggttgttaagcatggaggagagaaccta
agtcaaggagatgaaggtaaggaagaatctattcttaataaggcaaaagaaaataaaaat
aatgaagctgaaaatgaaggcctttatcttatgacgaaattacctgatgaagaaaatgtt
gaaatgatgcttctagattattttaatatgagaggtaaacaaagtatggtagcactttta
ggagctagaatggatggagataactatggagaactagttatgtataaattccctcctcaa
agaactatatatagtccaattttattcaagaatagaatacaacaggatcctaacatttct
aaggaaataagtctttgggctggaaaaggatcagaggttatatatggtgatataattatt
gttcctatagaagattcattactatatttaaatacaatttatttaaaggcaaattcagaa
aatagtatgcctgagatgaaaagagtaattctttctaatggagataaaatagttatagaa
gaaaatatagaaaaggcacttttaaagctatttaattatagttcatctgaagagaataaa
aactcaaataaggatgaaactcctaagaatgaaataacttcagataacagtggaataaaa
gaagctgctgatttatttaataaagctatagaggctcaaaaaaatggtgactgggcaact
tatggagagtttataaataaattaggggatattctaaacaaaatgtcacaagagtaa
DBGET
integrated database retrieval system