Clostridium perfringens ATCC 13124: CPF_0911
Help
Entry
CPF_0911 CDS
T00378
Name
(GenBank) aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family
Organism
cpf
Clostridium perfringens ATCC 13124
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DegT_DnrJ_EryC1
Aminotran_1_2
Cys_Met_Meta_PP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG82684
UniProt:
A0A0H2YPC1
LinkDB
All DBs
Position
1075096..1076289
Genome browser
AA seq
397 aa
AA seq
DB search
MNIPFSPPDIREKEINNVIEVLKSGWITTGNKTKEFERKIAKYCETKKAICLNSATAGLE
LILRVLDIGEDDEVITTAYTYTASASVINHVGAKIVLADTSKDTYEIDYERLEKLINERT
KAIILVDLAGIPCDYDKVFEIVNYKKKNFKAKGIIQEFLGRIAIISDAAHSFGAIYKGKI
SGSIADFTSFSFHAVKNLTTAEGGAVTWNIKDNELNDILYKKFSLFSLHGQTKDALSKTQ
VGNWEYDIVSLGYKFNMTDIMAAIGLAQFERYDEILKYRRKNIELYDKLLNVENIKVLDH
FNNTLKSSGHLYFININGKDENFRNNIIKKLAERGISTNVHYKPLPMFTAYKKLGFKIED
YKNAYNLYKNEITLPLNTILTESQIEYICNELKGALI
NT seq
1194 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatataccattttcacccccagatattagagaaaaagaaattaataatgtaattgaa
gtattaaaatcaggttggataactacaggaaataaaaccaaagaatttgaaagaaaaata
gcaaaatattgtgaaactaaaaaagctatatgcttaaattcagcaacagctggattagaa
cttattttaagagttttggatataggagaggatgatgaggtaataacaacagcatatact
tacactgcgtcagcaagtgtaataaatcatgttggagctaaaattgttttagcagatact
tcaaaagatacctatgaaatagattatgaaagattagaaaaattaataaatgagagaaca
aaggcaataattttagtggatttggcaggaataccttgtgattatgataaagtgtttgaa
attgtaaattataaaaagaaaaattttaaagccaaaggtattattcaagaatttttagga
agaattgcaattatatcagatgctgcacattctttcggagcaatctataaaggaaaaata
agtggaagtatagcagatttcactagtttttcatttcatgcagtaaagaatttaacaact
gctgagggaggggcagtaacttggaatattaaagataatgaattaaatgatattttatat
aaaaaattcagtttattttctttgcatggtcagacaaaagatgctttatctaaaactcaa
gtaggaaattgggagtatgacatagtctctttaggatataaatttaatatgacagatata
atggcagcaatagggttagcacaatttgaaagatatgatgagatacttaaatataggaga
aaaaatattgaattatacgataaattattaaatgttgaaaatataaaagttttagatcat
tttaataatacattaaaatctagtggccatttatatttcataaatataaatggaaaagat
gaaaattttagaaataatataataaagaaacttgcagaaagagggatttcaactaatgta
cattataagcctttacctatgtttacagcatataaaaaattaggatttaaaattgaagat
tataaaaatgcatataatttatataaaaacgaaataactcttcctcttaatactatatta
acagaaagtcaaattgaatatatatgtaatgagttaaaaggagctttaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
