Clostridium perfringens ATCC 13124: CPF_1900
Help
Entry
CPF_1900 CDS
T00378
Symbol
spoVB
Name
(GenBank) stage V sporulation protein B
KO
K06409
stage V sporulation protein B
Organism
cpf
Clostridium perfringens ATCC 13124
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cpf02000
]
CPF_1900 (spoVB)
Transporters [BR:
cpf02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
CPF_1900 (spoVB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG82774
UniProt:
A0A0H2YQV5
LinkDB
All DBs
Position
2136345..2137874
Genome browser
AA seq
509 aa
AA seq
DB search
MSKNDFYKNSFMLTASNLTTGLLGFIFSMYLSKVLGPEGMGLYGIIMPIYNLFISIMTAG
IIASISKITAVYSARDDYKNIIRTMKVVAIFNFIWCLIIGIFVFFLSPIIGHFWAKDPRI
IKSIMVTCPAMIFIALSNILKGFFYGTSKITVPSFIDILEKSLRIFVLAILIFIFKAETL
ESLVTLAYLALCLGELQSLILLFGYFKYSMSKFPKTNAKGESRAQLLFDVLVTSVPLCLN
GFLMSIFSVISTLLVPKRLIVAGFTYSQALSLIGKYSSMAMSIVTFPIIIVSSINTMLIP
DLSQTLSKGNYLSATKRIRDVIKIAFLIGICTTVIGLCVPDSLGKLFFGRDDLGEYIRIT
SVMMPIVFTSNTMYGILNGLGRQNVILRNTIITEVLEVTLLFFLTAIPSINIYGYAITML
IISSLSLCLNLYEIYKNINIGLSLSNFLIYILTGVLTYICLSPLSLKLSFIDFRIQVLAV
TSIAASIFIFLIIKEKFSSRFRKISLKSR
NT seq
1530 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagtaaaaatgatttctataaaaactctttcatgctaacagcctctaacttaacaact
ggattattaggttttatcttttctatgtacctatcaaaggtactaggccctgaaggaatg
ggactttatggtattataatgcctatttataatttatttatatcaattatgacagctggt
ataattgcatccatttctaagataactgctgtatattcagcaagagatgattataaaaac
ataattcgaacaatgaaagttgtggctatttttaattttatttggtgtcttataatagga
atatttgtatttttcttatcacctataatcggacatttttgggctaaggatcctagaata
ataaaatctataatggtaacttgtcctgctatgatatttatagcactttcaaacatatta
aagggatttttctatggaacttcaaaaatcactgttccttcttttatagatattttagaa
aaatctttacgtatctttgttttagctatattaatttttatatttaaagctgaaacttta
gagtctttagttactttagcttacttagccttatgtcttggggaactacaaagtttaata
cttttatttggatattttaaatactcaatgagtaaatttccaaaaacaaatgcaaaaggg
gaaagccgtgctcaattattatttgatgttttagtaacctcagtacctttatgcttaaat
ggatttttaatgagtatttttagcgttatctcaacacttttagttcctaaacggcttata
gttgcaggatttacttattcccaagcactttctcttataggaaaatattcttccatggca
atgtccatagtaacttttcctataattatagtttcttcaataaacactatgctaatacct
gatttatctcaaactttaagtaaagggaattatctttcagctactaaaagaattagagat
gttattaaaatagcttttttaataggtatttgtaccacagtaattggactatgtgttcct
gactctttaggtaaattattctttggaagagatgatttaggagaatatataagaataaca
tcagtaatgatgccaatagtatttacttcaaatactatgtatggaattttaaatggactt
ggaagacaaaatgtaattttaagaaatactataataacagaagttttagaagttacattg
ttatttttcttaactgcaataccatctataaatatttatggttatgcaataactatgctt
ataatttcatcactttccctttgtttaaacctttatgaaatatataaaaatataaatata
ggtttatccttatcaaacttcttaatatatatattaacaggagttttaacctatatatgc
ttaagtccactttcactaaagctttcttttattgattttaggattcaagttttagctgta
acttctatagcagcttctatattcatatttttaataataaaggagaaattctcatcaagg
tttagaaaaatctctttaaaaagcagatag
DBGET
integrated database retrieval system
