Clostridium perfringens ATCC 13124: CPF_2355
Help
Entry
CPF_2355 CDS
T00378
Symbol
virJ
Name
(GenBank) sensor histidine kinase
Organism
cpf
Clostridium perfringens ATCC 13124
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HisKA
HAMP
HATPase_c_5
HobA
DUF5783
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG84140
UniProt:
A0A0H2YSY2
LinkDB
All DBs
Position
complement(2620546..2621994)
Genome browser
AA seq
482 aa
AA seq
DB search
MKVKHKFSGGFLIIFLIAFIILNCFLGKAFINYHENKIKNEMDSLYKSSYSILRLYFQVN
NLEGNKGNFNRYIPKISNDISEQGKCQIDVFNEDLEKEYSYYLDDFSFDYEKDGGYDVLK
EANKNKAALNIYRDENAVKAYLAFPVYVDESFLGNILLSKDYSKEYLELRDLMSNIKFIV
SITFLLILIFTYFLFERIINPLNYIKNSFKRIGDGDFKINLKVNSKDEIGDLACGVNKMA
NKIEEQIEKINEEKEKVLTLEKTRTEFFNNITHELKTPLTNISGYAQIMSEEDFHDNDFR
KFALERINKESKRMHELIVSLIEISKNKSDIEGGEIENVNLKTLIEDLCEDFKVKGDKQG
ICISNNLEDIEFMCREDEIRRIIINLLDNAIKYSIKGSEIEISLFKDKEEKHIEIENLSD
EISSEGVEKIFEPFYRENTKKSRELGGNGLGLYICSELVKKYGGDISFNYSNGKVKVSII
FK
NT seq
1449 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagttaaacataaattttcaggaggatttttaataatatttctaattgcctttata
attttaaattgttttttaggtaaagcttttattaattatcatgaaaataaaattaaaaat
gaaatggattctttatataaaagtagctacagtattttaaggttatattttcaagtaaac
aatttggaaggaaacaaggggaattttaatagatatattcctaaaatatcaaatgatatt
agtgaacagggaaagtgtcaaattgatgtttttaatgaagatttagaaaaggaatatagt
tattatttagatgatttttcctttgattacgaaaaggatgggggctatgatgttttaaaa
gaagcaaataagaataaggctgcattaaacatttatagagatgaaaatgctgttaaagca
tacttagcttttccagtttatgttgatgagagttttttaggaaatatacttttaagcaag
gattattcaaaggaatatttagagttaagagatttaatgagcaatataaaattcattgtt
tcaataacatttttacttatattaattttcacatactttctttttgagagaataataaat
cctttaaattatataaaaaattcttttaaaagaattggtgatggtgactttaaaataaac
ttaaaagttaattcaaaggatgaaataggagatttagcctgtggagtaaataaaatggca
aataaaattgaggaacagattgaaaaaataaatgaagaaaaggaaaaggttttaacatta
gaaaaaactagaacagagttttttaataatattactcatgagttaaaaactccattaact
aatatttcaggatatgctcaaattatgagtgaagaagattttcatgataatgattttaga
aaatttgctttagagagaataaacaaggaaagcaaaagaatgcatgaacttatagtaagt
ttgattgaaatttctaaaaacaaaagcgacatagaaggtggagaaatagaaaatgtaaac
ctaaaaacattaatagaggatttatgtgaagattttaaagttaagggagataaacaaggg
atatgcatttctaataatttagaagatattgagtttatgtgtagagaagatgaaataagg
agaattattataaatcttttagataatgccataaagtattcaataaaaggtagtgaaata
gagattagtctatttaaagataaggaagaaaagcatatagagatagagaatttaagtgat
gagattagtagtgagggagtagaaaaaatatttgagccattttatagagagaatactaaa
aaatctagagagttagggggaaatgggttaggtctttatatatgctcagagctagtaaaa
aaatatggaggagatatttcatttaattattctaacggtaaggtaaaggttagtattatt
tttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system