Clostridium perfringens ATCC 13124: CPF_2368
Help
Entry
CPF_2368 CDS
T00378
Name
(GenBank) CspC family protein
Organism
cpf
Clostridium perfringens ATCC 13124
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
GBD_Hemicentin
CspB_prodomain
UIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG82888
UniProt:
A0A0H2YPY8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2635900..2637654)
Genome browser
AA seq
584 aa
AA seq
DB search
MEFKSSAPENVFNNENYLNYLVQYQGDIIGEFSGENGIYATLINNRYAIITIDKNLQEYE
NDISMIKYKKENGRDVEIDSITYIKNPEGYVLQEISPLEAANVEYVQIQSYFNLTGRGVI
VGILDTGIDYLNEEFMDSDGNTRILGIWDQTISSESSSNDNLPYGTFYSEEDINRAIRLS
REGGDPYTIVPSKDEVGHGTSMAGIIGSSGKNPRLKGVAPDCKFLVVKLAQSLYYKKEYE
INIPIYNITEIFTGIQYLYSYFLKGSQSMIIYLPLGTNRGSHKGTSMLEEFLDSILINRG
IALVTGAGNEGTALLHGSGTIKPDGQVTTHEFNIDENQKKIIIEVWVQIPSIASIEIVSP
TGGTTGIIQPFFGKGDRYDFTIERTTVLVSYYVPEEIYEDSLILVILDNVQAGTWSFKFR
GLKEIEGRYDIWLPPRGVSKTATKMIPSDPYGTVTVPGTSSSVITVAAYNQLNNTQLNYS
GRGFQDNYIDIIDVAAGGVDALTVAPDNKTTLANGTSVAAAIVAGICVLLFQWGIVEGNY
PYMFSQTLKAFIARGTRKRKGDTYPNPEWGYGIVDIFNMFNLTN
NT seq
1755 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatttaagtcttcagctccagagaatgtatttaataatgaaaattatttaaattat
ttagttcagtatcaaggtgatattataggagagtttagtggtgaaaatggaatatatgca
accttaattaataatagatatgccataataactattgataaaaacttacaggaatatgaa
aatgatatatctatgattaaatataaaaaagaaaatggaagagatgtagaaatagatagc
attacttatataaaaaatccagaaggatatgtacttcaggaaataagccctttagaggca
gcaaatgttgaatatgttcaaatacaatcatactttaatctaacaggtagaggggttatt
gttggaattttagatactggaatagattatttaaacgaagagtttatggattcagatggt
aatacaagaattttaggaatttgggatcaaacaatttcaagtgagagttcaagtaatgat
aatttaccttatggaactttttattcagaagaagatataaatagagcaataagacttagt
agagaaggaggagatccatatacaatagttccatcaaaagatgaagtgggtcatggaaca
tcaatggcaggaataattggatcatcaggaaaaaatcctaggttaaagggggttgcacca
gattgtaagttcttagttgtaaagcttgcacagtcactttattataaaaaagagtatgaa
ataaacatacctatttataatataactgagatatttacaggaatacaatatttatattca
tattttttaaagggatctcaaagtatgattatatatttacctttgggaactaatagagga
agtcataaaggaacaagtatgttagaagaatttttagattctatattgataaatagagga
attgctttagttaccggtgctggaaatgaaggaactgcattattacacggatcaggaact
ataaaacctgatggtcaagtaactacccatgaatttaatatagatgaaaatcaaaaaaag
attattattgaagtttgggtacaaatacctagtattgcttccatagaaatagtttcacct
actggaggaacaacaggaataattcaacctttttttggaaaaggggataggtatgatttt
acaattgagcgtactacagtgttagtaagttattatgtacctgaagaaatatatgaagat
tctctcatattagttatactagacaatgttcaagctggaacatggagttttaaatttagg
gggttaaaggaaatagagggaagatatgatatttggttacctccaaggggagtaagtaaa
actgcaactaagatgataccttctgacccatatggaacagtaactgtcccaggtactagt
tcttctgtaataacagtagctgcatataatcaattaaataatacacagttaaattattca
gggagaggatttcaggataattatattgatataatagatgtggctgcaggaggagtagat
gcacttactgttgcaccagataataaaacaactttagcaaatggtacaagtgttgcagcg
gctatagtagctgggatttgtgttttactttttcaatggggaattgttgaaggaaattat
ccatatatgttctctcaaactttaaaagcttttattgcaagaggtacaagaaagagaaaa
ggggatacttatccaaatccagagtggggatatggaatagttgatatatttaatatgttt
aatcttactaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
