Campylobacter pinnipediorum: CPIN18020_0989
Help
Entry
CPIN18020_0989 CDS
T05033
Name
(GenBank) AMP-forming adenylation domain superfamily protein, putative D-alanine:D-alanyl carrier protein ligase
Organism
cpin
Campylobacter pinnipediorum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AMP-binding
AMP-binding_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQW86190
LinkDB
All DBs
Position
complement(958656..960173)
Genome browser
AA seq
505 aa
AA seq
DB search
MLKEVNIYNFLENSLPNFKDKILFFDKDKYITYAEFDLLTSKIASKILSFSLKKMPILIL
LPKGIDCIGSMFATARSGNFYCVLDIKNPEDRIKKIVKTLKPKLLITSKKFDFNFLDIET
IYCEDFDSFLINDKMLKIAENEVIDTDLLYVLFTSGTTGEPKGVCIPHKNAIEYIDWVCS
TFEFNEKDVISNSANLYADKSIFDIFSGIKVGATIHLLDSFMSIFPDTLLSYWKQHGITT
INLVPSVFSIISNSGALYKYDLPDLKKIFSGGEIIQTKQFNAWINKFPNAKFVNLYGPTE
ITSNCAYFVINRKFNDDDIIPIGKARRNFDILLLNADGKIINNRDIGKKGEICVRGSSIS
YGYYANQCETNKRFIQNPYNKLYEEKIYKTGDIGFYNKNMELVCIGRLDNQIKIAGYRIE
LEEIENTCLSIEGVDFAACIFKEKLICFYISSINEMKIKQLLSNKLINYMMPDKFIKLKT
MPLNANGKIDRKGLVKIYESFKKDF
NT seq
1518 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgaaagaagttaatatatataatttcttagaaaattcattacctaatttcaaagat
aaaatacttttttttgacaaagataagtatataacttatgctgaatttgatctattaacc
tcaaaaatagcaagcaaaattttaagttttagccttaaaaagatgcctatattgatctta
ttgccaaaaggaatagattgtataggaagtatgtttgcaacagcaagaagtggcaatttt
tattgtgtattagatattaaaaatccagaagatcgtataaaaaaaatagttaaaacatta
aaaccaaaactattaataacaagtaaaaagtttgattttaattttttagatatagaaaca
atttattgtgaagattttgatagttttttaataaatgacaaaatgcttaaaattgcagaa
aatgaagttatagatacggatttattatatgttttatttacatcgggtacgacaggggag
ccaaaaggagtctgtatacctcacaaaaatgcaatagagtatatagactgggtgtgtagc
acttttgagtttaatgaaaaagatgttatttctaatagtgctaacttatatgcagacaaa
tctatatttgatatattttcaggtattaaggtcggagctactatacatttattggattct
tttatgtctatttttccagatactttgttatcatattggaaacagcatggtatcacaaca
ataaacctagttccttcggtattttctataatatctaattccggagcattgtataaatat
gatttgccagatctaaagaagatattttctggaggtgagataattcaaacaaaacaattt
aatgcatggatcaacaaatttccaaatgctaagtttgtaaatttgtatggaccaacagaa
atcacaagtaattgtgcctactttgtaataaataggaaatttaacgacgatgatattatt
cctataggtaaagcaagaagaaattttgatattttattgctaaatgctgatggtaaaata
ataaacaatcgagatattggcaaaaaaggagaaatatgtgttagaggaagctcgatttca
tatggatactatgccaatcaatgcgaaacaaataagcgttttatacaaaatccatataat
aaattatatgaagaaaaaatttataaaacaggagatattggattttataataaaaatatg
gagcttgtatgcattggaagacttgacaatcaaattaaaatcgcaggttatagaatagaa
ttagaagaaatagaaaatacatgtttatctatagaaggtgttgattttgctgcttgtatt
tttaaagaaaagctaatttgtttttatatatcaagtataaatgagatgaaaatcaaacaa
ttactatcaaataagcttataaattatatgatgcctgataaatttataaaattaaaaaca
atgccattaaatgccaatggtaagatagacagaaaaggattggtgaaaatatatgaatca
tttaaaaaggatttttga
DBGET
integrated database retrieval system