Chryseobacterium piperi: CJF12_18230
Help
Entry
CJF12_18230 CDS
T05071
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
cpip
Chryseobacterium piperi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpip00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cpip02000
]
CJF12_18230
Transporters [BR:
cpip02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CJF12_18230
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASW76015
LinkDB
All DBs
Position
complement(4148415..4149971)
Genome browser
AA seq
518 aa
AA seq
DB search
MKLNLAIVALALAVPTASFAQDSTAVSNGEYPNTFSSGSANVSPFTQKSKRFNDWAISVG
AGVPLMQSADLTSIKNGNGKNLFGYSAYVSIDKAITHAFGLKLQYDRGETRQGFFSTKDS
APADLAVSQRLAARTQYDAISILGDINFSNLLRRVDNHSTYRWALHGYAGVGTLAYRAYL
KDGSNRQRLMTEVKPFKFNSLFGQVGTGLKFKVNRSLDIEGRVMYVVTGDDQFDGGGAKY
SAINQREENTSDNFFNATLGVTLKLGKHESHLMWHDPLQEVYYKLDVLANKNQDIEVCKK
GDADNDGVCDDWDRQLDTPAGARVDGAGVALDTDLDGVIDLYDKCVTVPGPVENNGCPVK
KNNHETAKEVEKELKNVYFNFNKATIRPESNEKLDQAAKIIKESEGNYLLTGHTDIKGNA
AYNLKLSRERAAAVVSALEVRGVSQNSLKSRGVGSAEATIPASASDAERLADRKVTVRFI
EDNKEWDSIKKKDYNDISSQKSPKKKSSKKTPAKKKKR
NT seq
1557 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattaaatttagcaattgtagcattagcattagctgtaccaacagcttcttttgca
caagattcaacagcagtttcaaacggagaatatcctaatacgttttcttctggttctgcc
aatgtttcgccttttacacagaaatctaaaagatttaatgattgggctatttcagttggt
gccggggtaccattgatgcaatcagcagatttaacatctattaaaaatggtaatggtaaa
aatctttttggatactctgcttatgtaagtattgataaagcaattactcatgcttttggt
cttaaattacaatatgacagaggagaaacaagacaaggattcttcagtacaaaagattcc
gctcctgctgatttagctgtgagccagagattagctgcaagaactcagtatgatgcgatt
tcaattttaggggatattaacttctctaatttattaagaagagttgataatcactctaca
tacagatgggcacttcatggttacgctggtgtaggtaccttggcatacagagcttatcta
aaagatggttctaatcgtcaaagattaatgacagaagttaaaccttttaaattcaactca
ttattcggacaggtaggtacaggtcttaagtttaaagtgaacagaagtcttgatatcgaa
ggtagagtaatgtatgtagttactggtgatgatcagtttgatggtggaggtgctaaatac
agtgcaatcaaccaacgtgaagaaaatacatctgataacttcttcaatgctactttaggg
gttactctaaaattaggaaaacatgaatctcacttaatgtggcatgacccattacaggaa
gtttattataaactagatgttttagccaacaaaaaccaagatatcgaagtttgtaaaaaa
ggagatgctgataatgatggagtttgtgacgattgggacagacaacttgatactcctgct
ggtgcaagagtggatggtgctggtgttgctcttgatactgaccttgatggtgtaatcgac
ctttacgataagtgtgttacagtacctggacctgttgaaaataatggttgtccggtaaag
aaaaacaatcacgaaacagctaaagaagtagaaaaagaacttaaaaatgtatacttcaat
tttaataaagctactattagaccagagtctaatgaaaagttagatcaagctgctaaaatt
atcaaagaaagtgaaggtaactatttactaaccggacacacagatattaaaggaaacgca
gcctataatttaaagctttctagagaaagagctgctgctgtagtttctgctttagaagtt
agaggtgtttctcaaaattcactaaaatcaagaggtgtaggttctgcagaagcaacaatt
ccagcttccgcatccgatgcagaaagattagctgatagaaaagttacagttcgctttata
gaagataataaagagtgggactctataaaaaagaaagattataacgatatttcttcacag
aaatctcctaaaaagaaatcttctaaaaagacgcctgctaagaaaaagaaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
