KEGG   Chryseobacterium piperi: CJF12_19995
Entry
CJF12_19995       CDS       T05071                                 
Name
(GenBank) type IV secretion protein Rhs
Organism
cpip  Chryseobacterium piperi
SSDB
Motif
Pfam: RHS_repeat FG-GAP_3 FG-GAP SpvB DUF6443
Other DBs
NCBI-ProteinID: ATL75972
LinkDB
Position
2680237..2686023
AA seq 1928 aa
MKFLYSFIISLSSVLSFSQTILYQQESTSRTVQDPQAVVLAQGFKATASTSNPFIAKIGT
ATENQGGGPTNSNAGATNPSGTTAPDGQSFHDTQGNIEVSEAGQLQFTLPIALPPGIKSV
APQINLVYASGTGNGIAGYGWNLSGITAISRIGKTIEKNGETKGVQLDYSDYYSFNGQRL
ILKSGEYGKDGAEYVTEKYSNVKIKSVGIGLFSGPAQFEVTFEDGSQAWYGATDAGLNNA
KTPIEYNIVKWKDVQGNYITYNYLQSGLSNVAVISSIQWGGNETLNKANFNEILFTYISR
DLVEQSYVAGAGFIQNSLLKEIKVSSSGNLFKKYVIEYANNDIKYKFVERITEYNANNEA
ANPIVFKNESSPVGTNIINSNSRYDDIYGDNIITGDFNGDGKLDFLKGNTLMLGRLDGNS
NFINVSYEGSFLSVINTPKNNVLLDRQSFATSVYDYQNKKIIINYYALNSSNILEKYNSF
VLDNIPQSIFAEAPCYPAYNQNMCNSGFSVGVSAKEGDFNGDGVSELLLLVYGSTSCDCE
DYYGSNQTRTNTSSGEAYFYVDTKTNFNKKSTYDPILYTVGDFDGDGKSDLINLSGGSNI
YSFNETSKDFELKVQSSVQIKSEGRKFGDFNGDGKMDILAPVGVGSSDWKMYISTGKGFK
EFYYSNLYLYQPRTQGALTKRRVTLRTYSTSDFNKDGKSDLMIFESQVWFREWAINNPDS
SYGFNYLRNEGVDTAGKPIFLNVYNIAPKEATAWGDQNSEDINYSNYGEHYIPLFGSFRI
AQLNTEFVIIHKTKLITWDLGSKIDKISRINSITQGGIKTDIEYSPLVNEGNIYRSYLDA
NPLMYPYVNVRENLNYYVVSKLIQDQRKQEFRYRDLVAHLHGKGTIGFRQTARSTFFANG
LENTKIWTGSEINPLNEGLPYKDWSIRTNDENKVFPADISLNNTQLLSFKQNEYKIDRLL
NGSIVSSTVANTNKSKIVTSISPDTTTSKDFLKNITTVHKVEAYDNLYLPKKSVTKINDG
FAVLTSELEYYPPNLTPGTNYSIGKPKIKTEVIQAYGDTKSSKQEYIYENNLVKTQITWN
RNNSGSITETYNYDGFGNITKKVTRNSVDAQTQTSDALYDSKGRFVVKKKNNLGLETNII
YNDWGQIEKQTDPLGNTLDNKYDEWGKLLTSKTNLSGTTSYQYERDSNANLIITQNDPDG
NISKKYTNKLGQEYKTSTKAFGQGQYISKQTQYDVLGRKIKESEPYFEGQTANQWNSIEY
TDTVFPTKITVSSFNGHKAETTVSGLTTTVKELNGYARTTSKRTDALDNVIASTDKGGTI
NFSYNAAGEQIKAQYAENSVTTKYDVWGRKSEFNDPSNGIYKYEYDGFGQPKKIISPKGT
KEYIYNTKGQLISQRELSTTDAGEATNKTISFSYDDKGRVISKSGTSKGQAYSSSITYDP
QGRVLSSSESSNGKYFIQKGITYDDKARVTTYEKQLYSSGTLTKVQIENLYSNWSGELFQ
VKDKNTGRVLWQLQETNAKGQVLKARLGTANITNTYAPDGFLTSVNHSSTAKPSILQLSY
SFDAIKNELKSRTTGGDFNIIESFDYDDNNRLVNWTNPVTGVKPNANRNVYDVKGRILEN
DQVGSIKFQNNQKIYQPTSMVLNATGTQNYNNDLIQSIVYNENNDPIFIDGEKGDVAFQY
GLTSMRQRVSYGGNFATDGEGKFTKFYSEDGSFEVIKDNITGREKHILYIGGNPYDSNIV
YLKDYTQSSGSFRFLHKDYIGSVLAISDEAGNKLEQRHFDAWGNFTHLKIGNAATLTGNA
LNQQLSANNLLIDRGYTSHEHFAEVGIIHMNGRLYDPLLRRFLNADENIQDPTNTQNYNK
YGYVMNNPLMYNDPSGELIWFVPLIAAAVSEFFTMYYTQTPFDPLRLAGNAVISYISAGI
TGVIGGGV
NT seq 5787 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaatttttatattcattcatcatatcattaagctcagttttaagcttttcacaaacc
atactctaccagcaggaaagtacgtcacgaacagtacaagacccacaggcagtagtattg
gcacaaggattcaaagctacagccagtacttccaacccatttatagctaagattggtact
gccacagaaaatcagggagggggccctacaaattctaatgcaggagcaactaacccatcg
ggaacaacagcgccggatggacaaagctttcatgatacccaaggaaatattgaggtttcc
gaagcaggtcaattacaatttaccttaccaattgccttacctccggggataaaaagcgtg
gctcctcaaatcaatcttgtctatgccagtggaacaggcaatggtattgctggatatgga
tggaacctttctgggattacagccatttcaagaataggaaaaacgattgaaaaaaatggt
gaaacaaaaggagttcaattagattactcagattattatagttttaatggacaacgactt
attttaaaatcaggagaatatggcaaagacggagcggagtatgtgaccgagaaatattct
aatgtaaaaataaagtctgtaggtatcggactgttttcagggccagcgcaattcgaagtt
actttcgaagacggttcacaggcatggtatggagctactgatgcggggctaaataatgcc
aaaactcctatcgaatataatattgtaaagtggaaagatgtacaaggaaattatatcacg
tataactatttacaatcaggcctttcaaatgttgctgtgatttcaagtatccaatgggga
ggtaatgaaacacttaataaagcgaatttcaatgagattttgtttacttatatttcgaga
gatttagtcgaacaatcttacgttgctggtgccgggtttatacaaaatagtttactaaag
gaaataaaagtaagttcaagtggtaatctattcaaaaagtatgtgattgaatatgctaat
aatgatataaaatataaatttgttgaaaggataacagaatataacgctaataatgaagcg
gctaatcctatagtttttaaaaatgaatctagtcctgttggaacaaatattatcaattcg
aactcaagatacgatgatatttatggagataatataattacaggtgatttcaatggtgat
ggtaaattggatttcttaaaaggaaatacattaatgcttggaagactggatggaaatagt
aattttattaatgtttcttatgaaggcagttttttatctgtaatcaatactcctaaaaat
aatgttcttctagataggcaatcatttgcaacttctgtatatgattatcagaataaaaaa
attataataaactattatgcgttaaactcgagtaatatacttgaaaagtataattctttt
gtattagataatatccctcaaagtatatttgctgaggcaccatgttatcctgcttataat
caaaacatgtgtaattctggtttttcagttggagtctcagcaaaagaaggcgattttaat
ggagatggagtttctgaattgctccttctagtatatggttcaacaagctgtgattgcgaa
gattattatggatctaatcaaacacgcacaaatacaagtagtggagaagcttatttttat
gttgatacaaaaaccaatttcaacaaaaaatctacatatgatcctatattatatactgta
ggtgattttgacggggatggaaaatccgatttgataaacttatccggtggaagcaacata
tattcatttaatgaaacttcaaaagattttgaattaaaagtacagtcttctgtccaaatt
aaatctgaaggaagaaaatttggagattttaacggggatgggaaaatggacattttagca
cctgtaggagttggctcttcagattggaaaatgtatatttcaacaggaaagggtttcaaa
gagttttattattctaatttatatttatatcagcctagaacacaaggagcactaacaaaa
agaagagtcacattaaggacatattctacatctgattttaataaagacggaaaaagtgac
ttaatgatctttgaatcacaagtttggtttagagaatgggctatcaacaatccagattca
agttatggttttaattatttaagaaatgaaggcgttgatacagctggaaagcctattttt
ttaaatgtttataatattgcaccaaaagaggccactgcatggggggatcaaaattctgaa
gacatcaattattctaactatggagaacattatattcctttattcggatcatttcgtata
gcccaactcaatacagaatttgttattattcataaaaccaaactcatcacttgggatctt
ggaagtaagatagataaaatttcaaggataaattctatcactcaaggaggcataaaaaca
gatatagaatattcccctttagtcaacgaaggaaatatctacagatcttacctggatgca
aaccctctaatgtacccttatgtcaatgtaagggaaaatttgaattattatgttgtttct
aaattgattcaggatcaaagaaagcaggagttcagatatagggatttagtggctcacctt
catggaaaaggaactattggattcaggcaaacagccagatctaccttctttgccaatggt
cttgaaaatacgaagatatggacaggatcggaaataaatcctttaaatgaagggcttccc
tataaagactggtcgatcagaacaaatgatgaaaataaagtatttcctgcagatatttct
ttaaataatacgcagttattatcatttaaacaaaatgaatataaaattgatcgactttta
aatggaagtattgtttcttctacagtagccaatacaaataaatcaaaaatagtcacctca
attagccctgacacgactacttctaaagattttttaaaaaacataacaactgttcataaa
gttgaggcttatgataatctgtatttacctaaaaagtctgttaccaaaattaatgatgga
tttgcagttttaacctctgaattagaatactatccccctaatcttactccaggaactaac
tatagtattggtaagcctaagatcaaaacagaagtaatacaagcatatggcgatactaag
tcatctaaacaagagtatatctatgaaaacaacctggtaaaaactcagattacctggaac
agaaacaattccggatctataacggaaacttataattatgatggttttggaaatatcacc
aaaaaagtaacccgtaatagtgtagatgctcaaacccaaacttccgatgctttatatgac
tctaaaggacgttttgtcgtaaagaaaaaaaataatctgggtcttgaaaccaatatcatt
tataatgactggggacaaattgaaaaacaaaccgatccgttaggtaatacattagataat
aaatatgatgaatggggtaaactcttaacctccaaaaccaacctcagcggaacgacttct
taccagtacgaaagggatagtaatgccaaccttattataactcaaaatgatccggatggg
aatatttctaaaaaatataccaataaacttggacaggaatataaaacctctaccaaagca
ttcggacagggtcaatatatttctaagcaaacccagtatgatgtactcggtagaaagatc
aaagaaagtgaaccttattttgagggacaaactgccaatcaatggaatagtattgagtat
acggataccgtatttcctactaaaataacagtctcctcattcaacggtcacaaagccgaa
actacagtttcaggcctgacaaccactgtaaaagaactgaatggttatgcaagaactact
tccaagagaactgatgctctggacaatgtaattgcatccacagataaagggggaacgatt
aacttttcctataatgcagcgggtgaacaaatcaaagcccagtatgctgagaatagtgta
actacaaaatatgatgtatgggggagaaagtcagaatttaatgatccgtcgaatggaatc
tataaatacgagtacgatggttttgggcaacctaaaaagatcattagccctaaaggaacc
aaagaatatatttataatactaagggacaacttatctctcaaagggaactatccactacg
gatgctggagaagccaccaacaaaactatttctttttcttatgatgataaaggaagagtc
atttcaaaatcaggaacctcaaaaggacaagcctacagttcaagtatcacttatgatcca
caaggaagagttttatcttcatctgaaagcagtaacggaaagtactttatccaaaaagga
attacttatgatgataaagccagggtaactacatacgaaaagcagttgtattcttcagga
actttaactaaagtacagatagaaaacctgtacagcaattggagtggagaactgttccag
gtgaaggataaaaatacagggagagtattatggcagcttcaggaaaccaacgctaaagga
caggtactgaaagcaagattgggtacagccaatattaccaatacctatgctcctgatggt
ttcttaacaagtgtgaaccactcttctactgccaagccaagtatattgcagttatcctac
tcttttgatgccattaaaaatgagctgaaaagcagaactaccggtggtgattttaacatc
attgagtcttttgattatgatgataacaaccgtctggtgaactggaccaatccggttaca
ggggtcaaacctaatgctaacaggaatgtatatgatgtgaagggaagaatcctggaaaat
gaccaggtaggaagcatcaagttccaaaacaaccagaaaatctaccaaccgaccagtatg
gttcttaatgcaaccggaacacagaattacaataatgacctgattcaaagtattgtctac
aatgaaaacaatgatccaatattcattgatggtgaaaaaggagatgtagcgttccagtac
ggactgaccagtatgagacaaagggtttcttatggaggaaattttgcaactgatggagaa
ggaaagttcacgaagttttatagtgaggacggaagctttgaagtaattaaagataatatt
acaggaagagagaaacacatcttgtacattggtggtaatccatatgacagcaatattgta
tatttgaaagactatacccagagtagcggttcttttaggtttttacataaggattatatt
ggaagtgtattagcgattagtgatgaagcaggaaataaactggagcaaaggcattttgat
gcatgggggaattttacgcatttaaagattggaaatgcagctactctcacaggaaatgcg
ctcaaccagcaactttcagccaataatttactgatcgataggggttacaccagtcatgaa
cattttgctgaagtaggaattatccatatgaatggcaggttgtatgatccattactcaga
aggttcttaaatgctgatgagaatatccaggatcccaccaatacccagaattataataag
tatggatatgtaatgaataatccactgatgtataatgatccgagtggggagctgatctgg
tttgtacctttaattgcagctgcggtttctgagttttttacaatgtattatactcagacc
ccttttgatccgctacgcttagcaggaaatgctgtaatttcatacataagtgcaggaata
actggagtcataggggggggtgtttaa

DBGET integrated database retrieval system