Chiloscyllium plagiosum (whitespotted bambooshark): 122565550
Help
Entry
122565550 CDS
T08871
Symbol
fbn2b
Name
(RefSeq) fibrillin-2b
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
cpla
Chiloscyllium plagiosum (whitespotted bambooshark)
Pathway
cpla04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpla00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
122565550 (fbn2b)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
cpla00536
]
122565550 (fbn2b)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
cpla00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
122565550 (fbn2b)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
EGF_3
TB
Plasmod_Pvs28
EGF_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122565550
NCBI-ProteinID:
XP_043577538
LinkDB
All DBs
Position
31:complement(16649030..16814460)
Genome browser
AA seq
2572 aa
AA seq
DB search
MNFVLQRTQQIHENERDVDECSTISGVCDGGECSNTVGSYVCTCPRDFVTSLDGSRCIDE
YRRLCIEGVPFGPGYPGIGFPGFSGGIGPNGLGPGGVGPGGVSPGGVGPGGVGPGGLGPN
GVGPSGIGPGGIGTGFSGLPGTGPGIGTATLNQTIDVCKHFTNLCLNGRCIPTPSSYRCE
CNMGFKQDVRRECIDVDECSSSPCVNGDCINTPGAYHCKCHDGFQSTATKQACIDIDECI
QNGVLCRNGRCVNTDGSFQCICNAGFELTPNGKNCIDHDECATTNMCLNGMCINEDGSFK
CICKNGFILAPNGRYCVDIDECQTPGICMNGRCINSEGSFRCECPPGLAIGVDGRVCVDT
HMRSTCYGAIKKGTCTRPFSGAVTKSECCCASPDHGFGEPCQPCPARTSAEFQALCSSGI
GITADGRDINECALDPDICANGNCENLRGSYRCICNIGYESDISGKNCVDIDECSVNMLL
CDNGLCRNTPGSYTCTCPTGYIFKPDTETCEDVNECESSPCVNGYCRNMAGSFICECSLG
SKLDPTRTICIDSMKGTCWLNIQDGRCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCEHCELDPT
CPRGYARVKGVTCEDVNECDVFPGVCTNGRCVNTQGSFKCDCPEGLTLDGTGRTCVDVRL
EHCYLKWEEDECTQPMASRFRIDTCCCSIGRAWGGDCEECPQPGTREYEAICPRGPGFAN
RGDVLTGRPFYKDINECKVFSSLCTYGTCRNTVGSFKCRCESGFALNMEERNCTDINECR
ISPDLCGHGMCVNTPGSFECECFEGYESGFMMMKNCMDIDECERDPLLCRGGTCVNTDGS
YECICPPGHELTIEGDGCVDINECSLSDNLCKNGRCVNMIGTYQCACDSGYQGTADRQGC
VDIDECTIMNGGCDTHCTNSEGSYECSCSEGYALMPDKRTCADIDECEENPDICEGGQCT
NIPGEYRCLCFDGFMASMDMRTCLDVNECDLNPNICLHGDCENTKGSFICHCQLGYFVKK
GTTGCTDIDECEVGAHNCDMHASCVNVPGSFKCKCRDGWIGDGLECIDLDECATEEHQCN
PSANCMNTPGSYRCTCKDGFSGDGFSCSDVDECAENVNLCENGQCLNAPGGYRCECEMGF
TPTEDSKACQDIDECTFQNICVFGTCQNLPGMFRCVCDDGYELDRSGGNCTDINECADPV
NCINGLCVNTPGSYLCNCPTDFELNPTGVGCVDTRVGNCFLETLPRGDGGISCSAEIGVG
VTRASCCCSLGRAWGNPCEFCPLVNSTEYKTLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGL
CQGGNCVNTFGSFQCECPAGYYLNEDTRICEDIDECTTHIGICGPGTCYNTLGNYTCVCP
PEYMQVNGGNNCMDMRKSVCYRNFNDTCENELSFNMTKKMCCCSYNVGKGWNKPCEPCPT
PATSHYQLLCGNQAPGFIIDIHTGKPVDIDECREIPGICANGVCINQIGNFRCECPMGFS
YNNVFLICEDIDECTNGDNLCQRNADCINIPGSYRCECSPGFKLSLSGACVDRNECQEIP
NVCSHGECIDTEGSYRCLCHNGFKATADQTMCMDIDECDRQPCGNGTCKNTVGSYNCLCF
PGFDLTHNNDCMDIDECSTQIGQVCRNGQCINSIGSFQCLCQDGYELPPDGKNCVDINEC
ISFPGTCAPGTCQNLDGSFRCICPPGYEVQNDHCIDINECEEDPNICLFGFCTNTPGSFQ
CNCALGFVLSENGRRCFDTRQSFCFTRFDNGKCSVPKAFNTTKARCCCSKMPGEGWGDPC
ELCPQEEEVAFQELCPYGHGAIPGIGDTREDVNECVENPGICVNGHCINTDGSFRCECPF
GYSLDFTGVNCVDTDECTIGNPCGNGTCSNVIGGFECACDDGFEPGPMMTCEDINECSLN
PLLCAFRCINTYGSYECTCPGGYTLRADRKMCKDLDECSEGFHDCESRGMICKNLIGTFM
CICPPGMMRRPDGEGCMDENECRTKPGICQNGRCINTVGSYRCDCNEGFLEGPSATECLD
NRQGFCFIEVLQTMCQMSSTNRNLVTKSECCCNGGRGWGNQCELCPLPGTARYKKMCPHG
PGYATDGRDIDECRVVPNLCKNGQCINTMGSFRCFCNIGYTTDLTATSCVDLDECALSPK
PCNFICKNTEGSYQCSCPRGYILQEDGKTCKDLDECSTKQHNCQFLCVNTIGSFACKCPP
GFTQHHTSCIDNNECMGQPTICGSKGTCQNTPGSFSCDCQKGFSLDGTGFNCEDIDECDG
NHRCQHGCQNMLGGYRCSCPQGYMQHYQWNQCVDENECSNPTACGAASCYNTLGSYKCLC
PSGFDFDQYSGGCQDVNECSVSGNPCTYGCSNTDGGYLCGCPGGYFRVGQGHCISGMGFG
NGQYLPLEEEEGDAENVLSPETCYECKINGYPKRGRHRRSTNGTVSHEDLKISLASLDID
APIPLNVNISDMGIHDHIMEFLPAIETLENHVRYIISSGNEANSFRIHQKNGLSYLHLSR
KKAMRGKYMLEISSMPLYRKKDLLKLEDENDVDYLVGDLGEALHMKLQIHLL
NT seq
7719 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaactttgtccttcaaaggactcagcagattcacgagaatgaaagagatgttgatgaa
tgcagcaccatttctggagtctgtgatgggggtgaatgctcaaacacggttggtagctac
gtctgcacctgtccccgtgactttgtcacaagcctggatggctctcggtgtattgatgaa
tatcgcagactgtgcattgagggtgttccctttggaccgggttaccctggcataggattt
ccaggattttctggtggaattgggccaaatggccttggccctggtggagttgggcctggt
ggagttagccctggtggtgtcggacctggtggagtcggacctggtggacttggacctaac
ggggttgggcccagtgggattggaccaggtggaattggaacaggtttctcaggactacct
gggactgggcctggcattggtacagccaccctgaatcagacaattgatgtttgcaagcat
ttcaccaacctgtgtctgaacggacgttgtattcccaccccatccagttaccgctgtgaa
tgtaacatgggtttcaaacaggatgtgcgtcgagagtgtattgatgttgatgaatgttcc
agcagtccttgtgtgaatggggactgcattaacacccctggtgcctatcactgcaagtgt
catgatggtttccagagtactgccaccaagcaagcctgtattgatatcgatgagtgtatt
cagaacggtgtcttatgcaggaacggccgatgcgttaacactgatggaagcttccagtgt
atctgcaatgctggcttcgagcttacccccaatggaaagaactgcattgatcatgatgaa
tgtgctactaccaacatgtgcctgaatggaatgtgcatcaacgaggatggcagcttcaag
tgtatttgcaagaatggctttatcctagctcctaatggccgttactgtgtggatattgac
gaatgtcagacacctggtatctgcatgaatggccgctgcattaactcagaaggttccttc
aggtgtgagtgccctccaggtctggctattggagtggatggacgtgtctgtgttgatacc
catatgcggagcacttgctacggagccatcaaaaagggcacctgtacccgacctttctct
ggagccgtgaccaaatcagagtgttgttgtgccagtccagaccatggctttggagagccc
tgccagccctgcccagccaggacttcagctgagttccaggctttgtgcagcagtggcatc
gggatcacagctgatggacgagatatcaatgagtgtgctcttgatcccgatatctgtgcc
aatgggaattgtgagaacctgcgcggcagttaccgctgtatctgtaatattggctatgag
tctgacatcagtggcaagaattgtgtcgatattgacgagtgctcagtcaacatgcttctg
tgtgacaatggactgtgtcgtaacactccaggcagctacacatgcacttgccccacaggt
tacatcttcaaacctgataccgagacctgtgaagatgtgaatgagtgtgaatccagccca
tgtgtgaatggttactgcaggaacatggcaggctcgttcatctgtgaatgttcacttggc
agcaaattggatccaaccagaaccatctgtatcgacagtatgaaggggacgtgctggctg
aatattcaggatgggcgttgcgaggtgaacatcaatggagcaacactgaagtcggagtgc
tgtgccaccttgggagcagcctggggcagtccctgtgaacactgcgagctggatcccacc
tgccccagaggctatgccagagtgaaaggcgttacttgtgaagatgtgaatgagtgtgat
gtattccctggtgtttgcacaaatggacggtgtgtgaatacacaaggctcattcaagtgt
gactgccctgaaggactgactctggatgggactgggagaacctgtgtggatgttcgtctg
gaacactgctacctgaagtgggaggaggacgagtgcacacagccaatggcgagccggttc
cgtattgacacttgctgctgttcgattggccgtgcctggggtggagactgcgaggaatgc
ccacagcctggcacacgggaatatgaggctatttgccccaggggaccaggatttgccaac
aggggtgatgttctgacaggcagaccattctacaaggatatcaacgaatgtaaggtattc
tccagtctgtgtacatatggaacatgccggaacacagttggaagctttaaatgtcgctgc
gagagtggatttgccctaaacatggaggaaaggaactgtacagatatcaatgaatgccgt
atttcaccggacctctgcggccacggcatgtgtgtgaacacaccaggcagttttgaatgt
gaatgctttgaaggatatgaaagtggttttatgatgatgaagaactgcatggatattgac
gagtgtgagagagaccccttgctgtgtcggggaggaacctgtgtaaacactgatggcagc
tatgagtgtatttgcccaccaggtcatgagttgaccatcgagggagatggctgtgtggat
atcaatgagtgctcactgagtgacaacttgtgcaagaatggccgctgtgtgaatatgatt
gggacttaccagtgtgcttgtgactcaggatatcagggcacagcggacagacagggctgt
gtggatattgatgaatgtacaattatgaacggtggatgtgatacacactgcacaaactcc
gagggaagctatgagtgcagctgcagtgagggctatgcactgatgcctgacaaaaggaca
tgtgcagatattgatgaatgtgaggagaatcctgatatttgtgagggtggacagtgtacc
aacatccctggggaatatcgctgcctctgctttgatgggtttatggcttcgatggacatg
aggacctgtctggatgttaatgaatgtgacctgaaccctaacatctgtctccacggcgac
tgtgagaacaccaaaggctcttttatctgtcattgccagctgggatactttgtaaagaaa
ggaacaacaggatgcacagatattgatgagtgtgaagttggagctcacaactgcgacatg
cacgcctcttgtgtgaatgtgccaggcagcttcaagtgcaagtgtcgtgatggatggatt
ggagatggactggagtgcatcgatctggatgaatgtgccactgaggaacaccagtgtaat
cccagtgccaactgtatgaacacaccaggctcgtatcgctgcacctgtaaggatggcttc
agtggtgatggcttcagctgctcagatgttgacgaatgtgctgaaaatgtgaacctgtgt
gagaacgggcagtgtctgaatgctcctgggggttatcgttgtgaatgcgaaatgggattc
acaccgaccgaggatagcaaggcctgccaagatattgatgagtgcaccttccagaatatt
tgtgtttttggaacttgccagaacctacccggaatgttccgctgtgtttgtgatgatggt
tacgaacttgacagaagtggaggcaattgcacagatatcaatgaatgtgctgaccctgta
aactgcatcaatggcctctgtgtgaacacccctgggagctacctgtgtaactgcccgaca
gatttcgagctgaatcctacaggggttggctgtgtggatacccgtgtgggtaattgcttc
ctggaaaccttgccaaggggagatggcgggatttcatgcagtgcagagatcggtgttggt
gtcactcgagcctcatgctgttgctcgctgggaagggcttggggaaacccttgtgaattc
tgccctctagtcaactccactgaatacaagactctatgtccaggaggggaaggtttccga
cccaatcctatcactgtcattctggaagatattgatgagtgtcaggagttaccaggccta
tgtcagggtggaaactgtgtgaacacatttggcagcttccagtgtgaatgtccagctgga
tattacctgaatgaggacactcgtatatgtgaagatatcgatgaatgcaccactcacatt
ggaatctgtggacctggaacatgctacaatactttgggcaactatacctgtgtctgccct
ccggagtacatgcaagtcaatggaggaaacaattgtatggatatgaggaagagtgtctgt
taccgcaacttcaatgatacatgtgagaatgaactctccttcaacatgaccaagaagatg
tgctgctgctcatacaacgtgggcaagggatggaataagccatgtgagccctgccccacg
ccagctacatctcactatcaactcctgtgtgggaatcaggctcctggcttcatcattgat
atccatacgggcaaaccagttgatattgacgagtgtcgggaaatcccaggcatttgtgcg
aatggcgtctgtatcaaccaaatcggtaatttccgctgtgagtgtccaatgggcttcagc
tacaacaatgtgttcctgatctgtgaagatattgatgagtgcaccaatggagataacctg
tgtcagcggaatgccgactgtatcaacatcccaggcagttaccgctgtgagtgctccccg
ggctttaaactgtcactgagtggagcctgtgtggatcgtaatgagtgccaggagatcccc
aatgtgtgtagccacggagagtgtattgacacagaaggaagttatcggtgtctttgtcac
aatgggttcaaagcaacagctgaccagacaatgtgcatggatatcgatgagtgtgaccgg
cagccctgtgggaatggaacctgcaagaacaccgttggatcttacaactgcctctgtttc
cctggatttgacctcacccacaacaacgattgcatggatatcgatgagtgctcgactcag
attggtcaggtctgtcgaaatgggcagtgtataaacagtatcggctccttccagtgcctg
tgtcaggatggctatgagctgccacccgatgggaagaattgtgttgatatcaatgaatgc
atcagcttccctggcacctgtgcccctgggacctgccagaatctagatggttctttccgg
tgtatttgtcctcctggttacgaagtacagaacgaccactgcatcgatattaatgagtgt
gaggaggatcctaacatctgtctgtttggcttctgtacgaatacacctggaagtttccag
tgtaactgtgccctaggatttgttctgtcggaaaatggaaggagatgcttcgataccagg
cagagcttctgcttcaccaggtttgataacggcaagtgttcggtacccaaggccttcaat
acaaccaaagcccgctgctgctgtagcaagatgccaggggagggctggggcgacccatgt
gaactttgccctcaggaagaagaagttgctttccaggagctgtgtccttacggtcacggt
gcgatccctggcatcggtgatacccgcgaagatgtgaatgagtgtgtcgagaaccctgga
atctgcgttaacgggcactgtataaacactgatggttctttccgatgtgaatgtccattt
ggatatagcctagattttactggagtcaactgtgttgatactgatgaatgcaccattggt
aacccatgtggcaatggaacttgcagcaatgtcattggagggtttgagtgtgcgtgcgat
gatggatttgaacctggtccgatgatgacttgcgaagatattaacgagtgctccctcaat
cccctattgtgtgcatttcgctgcatcaacacctatggttcatacgagtgcacttgccct
ggaggttacactctgagagctgaccgcaagatgtgcaaagatttggatgagtgttcagaa
ggatttcatgactgtgaatcccggggaatgatatgcaagaacttgattggcactttcatg
tgcatctgcccacctggaatgatgcgaagaccagatggagagggctgcatggatgaaaac
gagtgtcgcactaaaccagggatatgtcagaatggccgatgtatcaacacagtcggcagc
taccgatgtgactgcaacgaaggattcttggaaggtccatcagctacagaatgtctggat
aatcgtcagggattctgtttcattgaagttttgcaaaccatgtgccaaatgtcatccacc
aaccgcaacctggtcaccaagtcagagtgctgctgcaatggaggcagaggatggggtaac
cagtgtgagctatgcccactgccaggcactgcccgttacaaaaagatgtgcccacatgga
cctggatatgccacagatggtagagatatcgatgaatgtagagtagtaccgaacctgtgt
aagaacggacagtgcatcaacaccatgggctccttccgctgtttctgtaatattggatac
accactgatctaacagcaacctcctgtgttgatcttgatgaatgtgcgctgtcacccaaa
ccatgcaacttcatctgcaagaacacagaaggtagctaccaatgctcatgtccacgaggc
tacattctgcaggaagatggaaagacgtgtaaagatcttgatgaatgttcaacgaaacag
cataactgtcagttcctgtgtgttaacacgattggatcctttgcttgcaaatgtccacct
ggtttcacacaacaccacacatcgtgcatcgacaataatgagtgcatgggtcagcccaca
atctgtggttcaaagggcacatgccaaaatacaccaggaagtttcagctgtgactgccag
aagggattctcattggatggcaccggttttaactgtgaagatattgatgagtgtgatggg
aaccatcgatgtcagcacggctgccagaatatgctgggtggatatagatgcagctgccct
caaggctacatgcaacactaccagtggaaccagtgtgtcgatgagaatgagtgcagcaat
cccactgcctgtggagctgcctcctgttataacactctaggcagctacaaatgcctctgt
ccgtctgggtttgattttgaccagtattctgggggatgtcaggatgtgaacgaatgctca
gtctctggaaacccctgcacgtatggctgctccaacacagacggtggttacctctgcggc
tgccctgggggctacttcagggtgggtcaaggacactgtatatcaggaatggggttcggg
aatggtcaatatctacctttggaggaggaagagggtgatgcagagaatgtgctgtcccct
gagacatgctatgaatgcaagatcaatggctaccccaagagaggcaggcatcggagaagc
acaaatggcactgtgtcacatgaggatctcaagattagtctggctagtttggacattgat
gcaccaatcccattgaatgtgaatatctccgacatgggaatccatgatcacatcatggaa
ttccttccggccattgagactctggaaaaccacgtgcgttacatcatctccagtgggaat
gaagccaactccttccgaattcatcagaaaaacggactcagttacctccatctaagccgt
aaaaaggccatgcgagggaagtacatgctcgagatttccagtatgcctctgtacaggaag
aaggatctcctgaaactggaagatgagaatgacgttgactacctcgtgggtgatctcggc
gaggccctccacatgaaacttcagattcatcttctttaa
DBGET
integrated database retrieval system
